La investigació biològica d’avui en dia és a gran escala. Encara és essencial fer experiments específics per entendre com funciona una determinada proteïna o què li passa a una cèl·lula o teixit concrets en un moment determinat. Però a gran part de la recerca puntera, els experiments biològics no tracten d’un gen o d’una proteïna tan sols, sinó de milers. Es tracta de les tècniques que en anglès es coneixen com “omics”.
La genòmica (l’estudi de milers de gens alhora) i la proteòmica (la determinació de totes les proteïnes d’una cèl·lula) ja son comuns a molts laboratoris. Però no estan soles. Comencen a fer aparicions cada vegada més freqüents la transcriptòmica (l’anàlisi de tots els gens expressats en un moment donat), la metabolòmica (l’estudi del metabolisme de l’organisme a gran escala, analitzant les diferents vies alhora), la farmacogenòmica (l’estudi quantitatiu de com la genètica d’un individu afecta la seva resposta a les drogues) o la fisiòmica (la dinàmica de la fisiologia de tot l’organisme).
Estem preparats per l’enorme quantitat d’informació que obtindrem d’aquestes disciplines? Aquesta és una de les qüestions que fan que la bioinformàtica sigui cada vegada més necessària en la recerca biomèdica, que al seu torn està esdevenint més multidisciplinar.
Per entendre com funciona un organisme de forma global són necessàries totes aquestes disciplines. L’anomenada biologia de sistemes és un camp dins la biomedicina que busca precisament la integració de totes aquestes dades (dels milers de gens, trànscripts, proteïnes i metabòlits) per comprendre finalment com som i com funcionem.
Els “omics” al PRBB
Al PRBB, aquest canvi d’escala no és una idea abstracta. Diverses plataformes tecnològiques dels centres que l’integren ajuden els equips de recerca a generar dades òmiques i a estudiar ADN, ARN i proteïnes a gran escala. En l’àmbit de la genòmica, la Genomics Unit del CRG ofereix serveis de seqüenciació de nova generació per a múltiples aplicacions d’ADN i ARN, mentre que la Genomics Core Facility de la UPF proporciona mètodes d’anàlisi d’ADN i ARN, incloent seqüenciació, PCR, control de qualitat i suport bioinformàtic. En proteòmica, la CRG/UPF Proteomics Unit dona suport a la recerca biomèdica amb serveis d’anàlisi de proteïnes i tecnologies avançades d’espectrometria de masses. Aquestes infraestructures mostren com els “omics” han passat de ser una promesa tecnològica a una eina habitual per entendre millor com funcionen les cèl·lules, els teixits i els organismes.
