Para entender mejor la evolución humana y de nuestros parientes más cercanos, diversos equipos de investigación del Instituto de Biología Evolutiva (IBE: CSIC-UPF), CSIC y BGI Shenzhen han analizado la diversidad del ARN en humanos y primates. Los investigadores han comparado los distintos ARNs presentes en líneas celulares linfoblastoides de humanos, chimpancés, gorilas, orangutanes y macacos Rhesus. Lo han hecho utilizando una tecnología llamada de secuenciación ‘de lectura larga’. Ésta es capaz de detectar distintas formas de ARN enteros con resolución de una única molécula – al contrario que otras técnicas anteriores que secuencian solo fragmentos cortos, a partir de los cuales se reconstruye la molécula.
“Las tecnologías de secuenciación de lectura larga permiten comparar las isoformas directamente entre especies para saber si son compartidas o exclusivas de un determinado linaje”
Luis Ferrández-Peral, investigador del IBE
Así, han sido capaces de generar el mayor catálogo de isoformas de ARN hasta la fecha. De hecho, casi la mitad de las isoformas detectadas no habían sido anotadas hasta ahora en sus genomas de referencia (es decir, no se habían identificado nunca), de forma que se ha expandido el conocimiento de genes en primates de forma significativa.
Los resultados muestran una gran similitud de los ARNs presentes en las distintas especies, pero también diferencias. La mayoría de formas de ARN que varían entre especies están relacionadas con la función inmune y de inflamación.
Ferrández-Peral et al. Transcriptome innovations in primates revealed by single-molecule long-read sequencing. Genome Research, August 2022. DOI: https://genome.cshlp.org/content/early/2022/08/09/gr.276395.121 http://www.doi.org/10.1101/gr.276395.121