Identificada una proteïna d’unió a l’ARN involucrada en la metàstasi del melanoma

El Centre de Regulació Genòmica (CRG) ha liderat una recerca per a conèixer les proteïnes d’unió a l’ARN que intervenen en la metàstasi del melanoma, la forma més letal de càncer de pell. L’equip, format també per investigadors de la Universitat de Halle i la Universitat d’Oxford, va identificar, gràcies a la tècnica RIC, 23 proteïnes que es trobaven unides a l’ARN en cèl·lules tumorals molt més que en cèl·lules normals. Entre elles, va destacar PDIA6, que l’equip estudià amb més detall. D’aquesta manera, els estudis van revelar que les cèl·lules cancerígenes amb menor quantitat d’aquesta proteïna, injectades en els animals, presenten menys capacitat de propagació cap als pulmons.

 “Les proteïnes d’unió a l’ARN són de gran interès terapèutic. La tècnica emprada en aquest estudi permet mesurar la seva activitat a una escala global, cosa que no és possible amb mètodes convencionals”
Fátima Gebauer, CRG

La tècnica RIC

Dissenyada l’any 2012, RIC, de les sigles en anglès RNA Interactome Capture, és una tècnica que permet caracteritzar les proteïnes associades a l’ARN a gran escala. Per dur-la a terme cal seguir els passos següents:

1. Primer és necessari aplicar llum ultraviolada (UV) a les cèl·lules per a enfortir la unió entre l’ARN i les proteïnes.
2. Posteriorment es lisen les cèl·lules per a extraure el seu contingut i s’aïllen els ARN mitjançant un Oligo(dT), una seqüència de desoxitimina (la base nitrogenada complementaria a l’adenina) que s’uneix a la cua terminal (poliA) de l’ARN.
3. Finalment, gràcies a la bola magnètica que hi ha unida a l’Oligo(dT), es ‘pesquen’ amb un imant els complexos ARN-proteïnes d’unió (interactoma) de la mostra.
4. Un cop obtingut l’ARN i les proteïnes associades, es dissocien i es pot procedir a la identificació d’aquestes proteïnes.

La investigadora principal, Fátima Gebauer del CRG, assegura que actualment “només estem veien el potencial de les proteïnes d’unió a l’ARN”. I espera que, en el futur, aquesta tècnica que els permet comparar cèl·lules tumorals i no tumorals, serveixi també per a millorar les teràpies personalitzades en càncer.