Un model d’IA innovador anomenat popEVE, desenvolupat per investigadors de la Facultat de Medicina de Harvard i del Centre de Regulació Genòmica (CRG), promet transformar el diagnòstic de malalties genètiques rares o minoritàries. PopEVE utilitza dades evolutives de centenars de milers d’espècies, així com dades de variació genètica a la població humana, per identificar mutacions en proteïnes humanes que poden causar malalties, fins i tot aquelles que no s’han vist mai abans. En comparar les seqüències de proteïnes humanes amb les d’altres espècies, popEVE identifica quines parts de les aproximadament 20.000 proteïnes humanes són essencials per a la vida i quines poden tolerar mutacions. Això permet que el model no només detecti possibles mutacions causants de malalties, sinó que també classifiqui la seva gravetat, oferint als metges una nova eina per prioritzar les mutacions més perilloses del genoma d’un pacient.
Durant milers de milions d’anys, l’evolució a la Terra ja ha dut a terme innombrables experiments, provant quins canvis pot tolerar una proteïna i quins són massa perjudicials per sobreviure.
Aquest model és particularment vital per a les malalties minoritàries, on la meitat dels pacients no reben mai un diagnòstic clar. A diferència dels mètodes tradicionals que es basen en grans cohorts de pacients, popEVE treballa amb dades genètiques individuals, fent-lo més ràpid, senzill i accessible, especialment en sistemes sanitaris amb recursos limitats. En identificar amb precisió les mutacions nocives, fins i tot en casos en què no existeixen dades prèvies, popEVE pot ajudar els metges a prendre decisions més informades sense necessitat d’ADN parental ni d’historials genètics extensos, diu Mafalda-Dias, del CRG i una de les líders de l’estudi. En les proves, popEVE va identificar correctament les mutacions de malalties conegudes el 98% de les vegades i va descobrir nous gens candidats relacionats amb trastorns del desenvolupament.
A més, popEVE aborda el problema de la manca de representació i de diversitat en les bases de dades genètiques, on la majoria de les dades provenen d’ascendència europea. En preguntar si una mutació s’ha vist abans en humans, independentment de si és una vegada en una població específica o mil vegades en poblacions europees sobrerepresentades, garanteix que totes les poblacions siguin considerades per igual, independentment de la seva ascendència.
«Ningú hauria d’obtenir un resultat alarmant només perquè la seva comunitat no estigui ben representada a les bases de dades globals. popEVE ajuda a solucionar aquest desequilibri, que ha existit al camp durant molt de temps»
Jonathan Frazer, un dels líders de l’article (CRG)
En l’estudi, popEVE va descobrir 123 mutacions que mai abans s’havien relacionat amb trastorns del desenvolupament; 104 d’aquestes es van observar en només un o dos pacients.
Aquest desenvolupament promet revolucionar els diagnòstics genètics, fent-los més equitatius i eficients.
Orenbuch, R., Shearer, C.A., Kollasch, A.W. et al. Proteome-wide model for human disease genetics. Nat Genet (2025). https://doi.org/10.1038/s41588-025-02400-1
