Per entendre millor l’evolució dels humans i els grans primats, diversos equips de recerca de l’Institut de Biologia Evolutiva (IBE: CSIC-UPF), CSIC i BGI Shenzhen han analitzat la diversitat de l’ARN en humans i primats. Els investigadors han comparat els diferents ARNs presents en línies cel·lulars limfoblastoides d’humans, ximpanzés, goril·les, orangutans i macacos Rhesus. Ho han fet utilitzant una tecnologia anomenada de seqüenciació ‘de lectura llarga’. Aquesta és capaç de detectar diferents formes d’ARNs sencers amb resolució d’una única molècula – al contrari que altres tècniques anteriors que seqüencien només fragments curts, a partir dels quals es reconstrueix la molècula.
“Les tecnologies de seqüenciació de lectura llarga permeten comparar les isoformes directament entre espècies per saber si són compartides o exclusives d’un llinatge determinat”
Luis Ferrández-Peral, investigador de l’IBE
Així, han estat capaços de generar el catàleg d’isoformes d’ARN més gran fins ara. De fet, gairebé la meitat de les isoformes detectades no havien estat anotades fins ara als seus genomes de referència (és a dir, no s’havien identificat mai), de manera que s’ha expandit el coneixement de gens en primats de manera significativa.
Els resultats mostren una gran similitud en els ARNs presents a les diferents espècies, però també diferències. La majoria de formes d’ARN que varien entre espècies estan relacionades amb la funció immune i inflamació.
Ferrández-Peral et al. Transcriptome innovations in primates revealed by single-molecule long-read sequencing. Genome Research, August 2022. DOI: https://genome.cshlp.org/content/early/2022/08/09/gr.276395.121 http://www.doi.org/10.1101/gr.276395.121
