En un estudio reciente, un equipo de investigación del Centro de Regulación Genómica (CRG) ha desarrollado un nuevo método para medir las modificaciones del ARN en el cáncer, que podría conducir a nuevos enfoques en la detección de esta enfermedad.
Hemos hablado con los primeros autores del estudio, Oguzhan Begik y Morghan Lucas, del grupo de Eva Novoa, para conocer más sobre este prometedor método.
¿Por qué son importantes las modificaciones del ARN en el estudio del cáncer?
Las modificaciones del ARN regulan muchos aspectos de la biología del ARN; estructura, degradación, localización, traducción, empalme,… ¡ y la lista continúa! Recientemente se ha demostrado que estas alteraciones químicas tienen un papel clave en muchos procesos biológicos, como el desarrollo, la inmunidad y la progresión del cáncer.
«Hay más de 170 modificaciones de ARN identificadas hasta ahora, que decoran todo tipo de ARN de forma dinámica»
Oguzhan Begik, CRG, co-autor del estudio
En un estudio anterior de nuestro laboratorio, descubrimos que las enzimas responsables de colocar, eliminar y reconocer las modificaciones del ARN están desreguladas en múltiples tipos de cáncer y pueden proporcionar nuevos biomarcadores de cáncer o dianas terapéuticas.
De hecho, un trabajo reciente comprobó que las enzimas modificadoras de ARN suponen una nueva y prometedora vía para la terapia contra el cáncer en la leucemia mieloide aguda, y anticipamos que este campo de investigación ganará mucha tracción en los próximos años con el avance en tecnologías de secuenciación de tercera generación.
¿Cómo podrían estos hallazgos conducir a nuevos enfoques en la detección del cáncer?
El primer paso para entender el papel funcional de las modificaciones del ARN en varios procesos biológicos es su detección. Necesitamos entender qué modificaciones de ARN juegan un papel en la progresión y metástasis del cáncer, y cuándo. Luego, podemos utilizar este conocimiento para identificar posibles biomarcadores para detectar el cáncer o para estratificar mejor a los pacientes.
«Mediante el uso de perfiles de modificación de ARN podríamos afinar el pronóstico del cáncer y aprovechar las enzimas de modificación de ARN desreguladas como dianas terapéuticas»
Morghan Lucas, CRG, co-autora del estudio
¿Podría vuestro nuevo método ser útil en otros campos de investigación y enfermedades?
En nuestro último estudio lo que hemos hecho ha sido ampliar nuestros esfuerzos anteriores de detección de modificaciones de ARN en moléculas de ARN nativo de una manera imparcial en todo el transcriptoma, ampliando el repertorio de modificaciones que podemos detectar, así como cuantificando su estequiometría.
Este método no se limita a muestras específicas o a un tipo de enfermedad; se puede aplicar a una amplia gama de sistemas biológicos, desde el gusano C. elegans hasta muestras de pacientes, para estudiar la dinámica de modificación del ARN en moléculas de ARN nativo.
Begik, O., Lucas, M.C., Pryszcz, L.P. et al. Quantitative profiling of pseudouridylation dynamics in native RNAs with nanopore sequencing. Nat Biotechnol (2021).
