El Centro de Regulación Genómica (CRG) ha liderado una investigación para conocer las proteínas de unión al ARN que intervienen en la metástasis del melanoma, la forma más letal de cáncer de piel. El equipo, formado también por investigadores de la Universidad de Halle y la Universidad de Oxford identificó, gracias a la técnica RIC, 23 proteínas que se encontraban unidas al ARN en células tumorales mucho más que en células normales. Entre estas proteínas destacó PDIA6, que el equipo científico estudió más en detalle. Así, los estudios en ratones revelaron que las células cancerígenas con menor cantidad de esta proteína, inyectadas a los animales, presentan menos capacidad de propagación hacia los pulmones.
“Las proteínas de unión al ARN son de gran interés terapéutico. La técnica empleada en este estudio permite medir su actividad a una escala global, algo que no es posible con métodos convencionales”
Fátima Gebauer, CRG
La técnica RIC
Diseñada en 2012, RIC, de las siglas en inglés RNA Interactome Capture, es una técnica que permite caracterizar las proteínas asociadas al ARN a gran escala. Para llevarla a cabo hay que seguir los siguientes pasos:
- Primero es necesario aplicar luz ultravioleta (UV) a las células para fortalecer la unión entre el ARN y las proteínas.
- Posteriormente se lisan las células para extraer su contenido y se aíslan los ARN mediante un Oligo(dT), una secuencia de desoxitimina (la base nitrogenada complementaria a la adenina) que se une a la cola terminal de adenina (poliA) que tienen los ARNs.
- Finalmente, gracias a la bola magnética que hay unida al Oligo(dT), se ‘pescan’ con un imán los complejos ARN-proteínas de unión (interactoma) de la muestra.
- Una vez obtenido el ARN y las proteínas asociadas, se disocian y se puede proceder a la identificación de estas proteínas.
La investigadora principal, Fátima Gebauer del CRG, asegura que actualmente “solo estamos viendo el potencial de las proteínas de unión al ARN”. Y espera que, en el futuro, esta técnica que les permite comparar células tumorales y no tumorales sirva también para mejorar las terapias personalizadas en cáncer.
Neus Mestre-Farràs, Santiago Guerrero, Nadine Bley, Ezequiel Rivero, Olga Coll, Eva Borràs, Eduard Sabidó, Alberto Indacochea, Carlos Casillas-Serra, Aino I Järvelin, Baldomero Oliva, Alfredo Castello, Stefan Hüttelmaier, Fátima Gebauer. Melanoma RBPome identification reveals PDIA6 as an unconventional RNA-binding protein involved in metastasis, Nucleic Acids Research, 2022; gkac605. doi.org/10.1093/nar/gkac605