Personal científic del CNAG-CRG i del Centre de Regulació Genòmica (CRG) ha desenvolupat TADdyn, una eina que permet filmar els canvis que pateix el genoma al llarg del temps. Permetrà tenir una millor visió de l’ambient dinàmic del genoma, on l’estructura varia amb el temps, donant lloc a canvis de funcionalitat.
TADdyn permetrà als investigadors i investigadores de tot el món aprendre molt més sobre la relació directa entre l’estructura i la funció del genoma
L’eina s’ha provat en glòbuls blancs de la sang. Concretament, s’han analitzat canvis en 21 àrees diferents del genoma d’aquestes cèl·lules en ratolí.
Les filmacions obtingudes van demostrar que l’activació gènica es correlaciona amb l’aparició d’unes estructures amb forma de gàbia, enriquides amb cromatina activa.
Els autors de l’estudi conclouen que aquestes estructures podrien ser importants per promoure i mantenir la transcripció gènica.
Di Stefano, M., Stadhouders, R., Farabella, I. et al. Transcriptional activation during cell reprogramming correlates with the formation of 3D open chromatin hubs. Nat Commun 11, 2564 (2020). DOI: 10.1038/s41467-020-16396-1
