Aquesta imatge del Grup de Dinàmica del Neurodesenvolupament del Departament de Medicina i Ciències de la vida, Universitat Pompeu Fabra (MELIS-UPF), dirigit per la Cristina Pujades, ens mostra una imatge de l’atles digital en 3D del cervell de vertebrats que han obtingut gràcies a l’eina DAMAKER.
La imatge presenta un mapa del naixement de les neurones glutamatèrgiques (les excitatòries) al romboencèfal de peix zebra. Aquesta és la part del cervell dels vertebrats que s’encarrega de funcions bàsiques com la deglució o la respiració. A l’esquerra observem aquestes neurones amb 48h de vida i a la dreta a les 72h després de la seva diferenciació.
“Les tècniques de microscòpia i anàlisi d’imatge que tenim a l’actualitat són impressionants i ens permeten veure en temps real el moviment de les cèl·lules i la formació de moltes estructures biològiques”
Cristina Pujades, MELIS-UPF
Mapa temporal en 3D de diferents poblacions neuronals.
DAMAKER, és una eina que permet obtenir atles digitals de models 3D que integren dades espacials i temporals. El programa, desenvolupat per l’equip de la UPF amb la col·laboració del Laboratori Europeu de Biologia Molecular – Barcelona (EMBL Barcelona), combina imatges in vivo de cèl·lules marcades amb marcadors fluorescents que se segueixen al llarg del seu desenvolupament i s’analitzen utilitzant algoritmes d’accés lliure. Això significa que el programa pot ser utilitzat per qualsevol persona per a construir un atles de qualsevol teixit cel·lular sempre que s’utilitzin marcadors concrets d’allò que es vulgui veure.
Gràcies al programa, l’equip de la Cristina ha produït un atles 3D del romboencèfal de peix zebra. I a més de conèixer quan es diferencien les neurones, ha demostrat que el lloc i el moment del naixement d’aquetes cèl·lules marca el seu destí final.
Aquest estudi presenta la primera cartografia del cervell d’un vertebrat, i el generador d’atles 3D digitals podria ser una bona eina per a conèixer la història vital de les cèl·lules durant la morfogènesi, el procés de formació dels teixits. També, gràcies als models de peix zebra, es podrien crear avatars humans amb mutacions per a estudiar malalties. “En comptes de buscar les afectacions neuronals com si fos una agulla en un paller, podem anar a un estadi determinat, mirar la distribució de les neurones i, en comparar-ho amb l’atles, podem saber quan va ocórrer el defecte neuronal”, puntualitza la Cristina.
Vols veure la teva foto aquí? Envian’s imatges relacionades amb la ciència o la vida al PRBB a ellipse@prbb.org.
Matthias Blanc, Giovanni Dalmasso, Frederic Udina, Cristina Pujades. A dynamic and expandable Digital 3D-Atlas MAKER for monitoring the temporal changes in tissue growth during hindbrain morphogenesis. eLife 2022. DOI: 10.7554/eLife.78300.
