Per ser funcionals, les proteïnes tenen una estructura determinada, que es modula quan interaccionen les unes amb les altres. Aquesta idea que aparentment pot semblar senzilla, fa anys que té intrigada a la comunitat científica, que intenta predir aquesta estructura.
En el quart episodi de la segona temporada de ‘La mare de la ciència’, descobrirem com s’estudia el ‘plegament de les proteïnes‘ amb en Baldo Oliva, cap del grup de bioinformàtica estructural al GRIB, un programa compartit entre l’Institut Hospital del Mar d’Investigacions Mèdiques (IMIM) i el Departament de Medicina i Ciències de la vida, Universitat Pompeu Fabra (MELIS-UPF).
Conèixer l’estructura de les proteïnes és clau per saber quina és la seva part activa o com una mutació pot afectar el seu funcionament. Però també és una eina magnífica per a dissenyar noves molècules per fer materials o nous fàrmacs.
L’estudi d’aquesta estructura, es basa en experiments teòrics on utilitzen programes informàtics i eines d’intel·ligència artificial per a comparar diferents seqüències i patrons de plegament. Però, curiosament, aquesta recerca de frontera conviu amb teories tant antigues com les lleis de Newton que ajuden a explicar el moviment de les molècules.
I què va passar l’estiu del 2021? Doncs que es van publicar Alpha Fold i RoseTTA Fold, dos softwares d’accés obert que permeten predir l’estructura de les proteïnes. Tots dos han revolucionat el camp i han sigut classificats per la revista Science com a descobriment de l’any. I, malgrat que aquests programes encara tenen limitacions, ja han donat resposta a un dels enigmes més antics de la biomedicina.
Teniu ganes de saber-ne més? Escolteu-lo!