Una nova manera de fer ciència sorgeix a Barcelona. El ‘Barcelona Collaboratorium for Modeling and Predictive Biology‘, una iniciativa conjunta del Centre de Regulació Genòmica (CRG) i el Laboratori Europeu de Biologia Molecular – Barcelona (EMBL Barcelona) es va inaugurar a principis d’octubre al PRBB amb el Simposi de llançament ‘Programmable Life‘ . Ocupant una planta sencera de l’edifici de la Fundació Pasqual Maragall (FPM), pretén ser un espai per a l’enginyeria biològica a Barcelona.
El perquè i el com del Barcelona Collaboratorium
A la reunió d’inauguració a l’auditori del Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (PRBB), l’investigador del CRG Ben Lehner, un dels motors de la creació del Collaboratorium, va explicar el perquè d’aquesta idea.
“Els humans ens hem tornat increïblement bons en enginyeria. Però encara no sabem com dissenyar una cosa tan notable com un guepard, que pot passar de 0 a 100 km en 3 segons, i es pot construir a si mateix, i reproduir-se. En realitat, ni tan sols sabem com dissenyar teixits. O cèl·lules. O fins i tot, fàcilment, proteïnes”, va començar Lehner.
Però ho arribarem a fer, va continuar el jove científic. I per aconseguir-ho necessitarem moltes dades, que ja estem acumulant en grans quantitats. Des que va crear el seu laboratori, va dir com a exemple, la seqüenciació d’un genoma ha passat de costar mil milions de dòlars a 200 dòlars.
No obstant, les dades per si soles no són suficients. La biologia és tan complexa que hi ha més maneres diferents de fer una proteïna de 100 aminoàcids que àtoms a l’univers. Això significa que és pràcticament impossible provar totes les combinacions experimentalment o fins i tot examinar aquest espai computacionalment de manera exhaustiva. El que necessitem són models generatius. “I això només és per a l’estructura més simple”, va continuar el biòleg. “Si anem a cèl·lules, òrgans… l’espai combinatori és enorme. Necessitem molts més models, de tota mena, per fer que la biologia sigui predictiva”. I ha de passar aquí: a Europa, a Barcelona. Per això la creació del Collaboratorium.
“Tenim grans quantitats de dades biològiques d’alta qualitat disponibles, però no tenim eines teòriques i computacionals que ajudin a explicar i predir la biologia complexa“
Ben Lehner (CRG)
James Sharpe, l’altre cervell darrere d’aquest nou projecte, va continuar explicant com planegen aconseguir-ho.
En poques paraules, es basa en una nova manera dorganitzar la ciència; en lloc d’una estructura fixa en laboratoris separats, amb investigadors principals, postdoctorats, doctorands, etc. busquen una estructura col·laborativa més fluida. També volen fomentar la mobilitat, per la qual cosa preveuen que la meitat de les persones que treballin al Collaboratorium siguin científics o científiques visitants o de sabàtic, que hi passarien uns mesos i tindrien una relació de mentoria amb la resta del personal més estable. Per tant, hi haurà convocatòries anuals obertes per portar aquests experts i expertes líders mundials a treballar sota un mateix sostre, en col·laboració amb el personal local.
Col·laboració per tot arreu
“Tot i que el Collaboratorium no estarà físicament al PRBB, no està tan lluny, només a 10 minuts a peu, així que esperem que la interacció amb la resta de la comunitat aquí al PRBB sigui molt important”, va afegir Sharpe, referint-se al parc on tant CRG com EMBL estan ubicats. I també volen iniciar col·laboracions amb altres centres de Barcelona, així com convertir-se en un referent mundial en aquest tipus de ciència, basada no en laboratoris rígids sinó en visitants que hi van i vénen, albergant grans ments que interactuen entre si.
Pel que fa als temes a tractar, no posen límits; seran tan variats com el personal investigador participant vulgui que ho siguin.
“Volem permetre l’estudi des de les molècules fins als ecosistemes, amb una fertilització creuada d’ideess”
James Sharpe (EMBL-Barcelona)
A més dels models teòrics que s’espera que surtin del Collaboratorium, hi ha previst planificat un simposi anual, que es basarà en els temes que proposi la pròpia comunitat, a més de tallers i altres esdeveniments.
La iniciativa té prevista una durada mínima de cinc anys per començar, i està cofinançada pel CRG, l’EMBL Barcelona, la Generalitat de Catalunya, el Ministeri de Ciència i Innovació d’Espanya i el programa ‘Centre d’Excel·lència Severo Ochoa’ del CRG .
