Una nueva forma de hacer ciencia está surgiendo en Barcelona. El ‘Barcelona Collaboratorium for Modeling and Predictive Biology‘, una iniciativa conjunta del Centro de Regulación Genómica (CRG) y el Laboratorio Europeo de Biología Molecular – Barcelona (EMBL Barcelona) se inauguró a principios de octubre en el PRBB con el Simposio de lanzamiento ‘Programmable Life‘ . Ocupando una planta entera del edificio de la Fundación Pasqual Maragall (FPM), pretende ser un espacio para la «ingeniería biológica» en Barcelona.
El porqué y el como del Barcelona Collaboratorium
En la reunión de inauguración en el auditorio del Parque de Investigación Biomédica de Barcelona (PRBB), el investigador del CRG Ben Lehner, uno de los motores de la creación del Collaboratorium, explicó el por qué de esta idea.
“Los humanos nos hemos vuelto increíblemente buenos en ingeniería. Pero todavía no sabemos cómo diseñar algo tan notable como un guepardo, que puede pasar de 0 a 100 km en 3 segundos, y puede construirse a sí mismo, y reproducirse. En realidad, ni siquiera sabemos cómo diseñar tejidos. O células. O incluso, fácilmente, proteínas”, comenzó Ben.
Pero llegaremos a hacerlo, según el joven científico. Y para lograrlo necesitaremos muchos datos, que ya estamos acumulando en grandes cantidades. Desde que creó su propio laboratorio, dijo, la secuenciación de un genoma ha pasado de costar mil millones de dólares a 200 dólares.
Sin embargo, los datos por sí solos no son suficientes. La biología es tan compleja que hay más formas diferentes de hacer una proteína de 100 aminoácidos que átomos en el universo. Lo que significa que es prácticamente imposible probar todas las combinaciones experimentalmente o incluso examinar ese espacio computacionalmente de forma exhaustiva. Lo que necesitamos son modelos generativos. “Y eso es solo para la estructura más simple”, continuó el biólogo. “Si vamos a células, órganos,… el espacio combinatorio es enorme. Necesitamos muchos más modelos, de todo tipo, para hacer que la biología sea predictiva”. Y tiene que pasar aquí: en Europa, en Barcelona. De ahí la creación del Collaboratorium.
“Tenemos grandes cantidades de datos biológicos de alta calidad disponibles, pero no tenemos herramientas teóricas y computacionales que ayuden a explicar y predecir la biología compleja”
Ben Lehner (CRG)
James Sharpe, el otro cerebro detrás de este nuevo proyecto, continuó explicando cómo planean lograrlo
En pocas palabras, se basa en una nueva forma de organizar la ciencia; en lugar de una estructura fija en laboratorios separados, con investigadores principales, posdoctorados, doctorandos, etc. buscan una estructura colaborativa más fluida. También quieren fomentar la movilidad, por lo que prevén que la mitad de las personas que trabajen en el Collaboratorium sean científicos o científicas visitantes o de sabático, que pasarían allí unos meses y tendrían una relación de mentoría con el resto del personal más estable. Por lo tanto, habrá convocatorias anuales abiertas para traer a estos expertos y expertas líderes mundiales a trabajar bajo un mismo techo, en colaboración con el personal local.
Collaboración por todas partes
«Aunque el Collaboratorium no estará físicamente en el PRBB, no está tan lejos, a 10 minutos a pie, así que esperamos que la interacción con el resto de la comunidad aquí en el PRBB sea muy importante”, agregó Sharpe, refiriéndose al parque donde tanto CRG como EMBL están ubicados. Y también quieren iniciar colaboraciones con otros centros de Barcelona, así como convertirse en un referente mundial en este tipo de ciencia, basada no en laboratorios rígidos sino en visitantes que van y vienen, albergando grandes mentes que interactúan entre sí.
En cuanto a los temas a tratar, no ponen límites; serán tan variados como el personal investigador participante quieran que lo sean.
“Queremos permitir el estudio desde las moléculas hasta los ecosistemas, con una fertilización cruzada de ideas”
James Sharpe (EMBL-Barcelona)
Además de los modelos teóricos que se espera salgan del Collaboratorium, se tiene planificado un simposio anual, que se basará en los temas que proponga la propia comunidad, además de talleres y otros eventos.
La iniciativa tiene prevista una duración mínima de cinco años para empezar, y está cofinanciada por el CRG, EMBL Barcelona, la Generalitat de Catalunya, el Ministerio de Ciencia e Innovación de España y el programa ‘Centro de Excelencia Severo Ochoa’ del CRG.
