Dades massives per a predir la resposta a la immunoteràpia

Només un 20% dels pacients de càncer de bufeta responen al tractament d’immunoteràpia. Ara, equips d’investigadores al PRBB han utilitzat l’anàlisi massiva de dades per a identificar marcadors clau del càncer de bufeta que podran ajudar a determinar el nivell de resposta a la immunoteràpia. L’equip, coordinat per Mar Albà (codirectora del Programa de Recerca en Informàtica Biomèdica (GRIB)), Júlia Perera y Joaquim Bellmunt (Hospital del Mar Research Institute) i en el que ha col·laborat Robert Castelo (Departament de Medicina i Ciències de la Vida, MELIS-UPF), ha analitzat les dades de més de 700 pacients amb càncer de bufeta de sis cohorts diferents.

Les investigadores i els investigadors han desenvolupat un algoritme d’aprenentatge automàtic per veure com respon el pacient a la immunoteràpia segons el subtipus de càncer de bufeta. Amb ell, han descobert que el subtipus neuronal, tot i ser el menys comú dels cinc subtipus, és el que millor respon al tractament. Gràcies a l’algoritme, han detectat que els marcadors que millor determinen l’èxit del tractament són el número de mutacions introduïdes per la família d’enzims APOBEC, el número de mutacions del tumor i la quantitat de macròfags antiinflamatoris. També han identificat alguns marcadors al microambient tumoral i, gràcies al gran número de pacients, han detectat noves mutacions rares que farien que el tumor fos invisible al sistema immunitari.

“És important entendre els mecanismes de resposta dins dels diferents subgrups, perquè hi ha una gran heterogeneïtat tumoral”

Lilian Marie Boll, primera autora de l’article

Aquest estudi ajuda a analitzar els mecanismes de resposta dels diferents subtipus de càncer de bufeta davant la immunoteràpia. A més, destaca la gran diversitat que hi ha als tumors, el que complica el seu tractament. L’equip investigador ressalta la necessitat de tenir una gran quantitat de dades per a poder desenvolupar models predictius que permetin tractar els tumors individualment.