{"id":7952,"date":"2019-06-03T17:25:10","date_gmt":"2019-06-03T15:25:10","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=7952"},"modified":"2022-01-10T15:30:00","modified_gmt":"2022-01-10T14:30:00","slug":"hacia-una-biologia-computacional-mas-reproducible-transparente-y-colaborativa","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/hacia-una-biologia-computacional-mas-reproducible-transparente-y-colaborativa\/","title":{"rendered":"Hacia una biolog\u00eda computacional m\u00e1s reproducible, transparente y colaborativa"},"content":{"rendered":"<p>La <strong>reproducibilidad<\/strong> es b\u00e1sica para la ciencia. Las nuevas investigaciones se basan en conocimientos previos, que deben ser robustos y, por tanto, reproducibles. En el caso de la <strong>biolog\u00eda computacional<\/strong>, es esencial poder <strong>entender el c\u00f3digo escrito para reproducir un an\u00e1lisis<\/strong>. Sin embargo, el razonamiento detr\u00e1s de la creaci\u00f3n de un determinado c\u00f3digo se da a veces por asumido y no se presta suficiente atenci\u00f3n en dejar claro c\u00f3mo se cre\u00f3.<\/p>\n<p>\u00a0<\/p>\n<blockquote>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">\u201c<\/span><span title=\"\">Los hechos<\/span> <span title=\"\">individuales<\/span> <span title=\"\">no reproducibles<\/span> <span title=\"\">no tienen<\/span> <span title=\"\">ninguna importancia<\/span> <span class=\"\" title=\"\">para la ciencia<\/span><span style=\"font-weight: 400;\">\u201d<br \/><strong>Karl Popper<br \/><\/strong><\/span><\/p>\n<\/blockquote>\n<p>\u00a0<\/p>\n<p>El <a href=\"http:\/\/www.crg.eu\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a>\u00a0organiz\u00f3 un <strong>taller<\/strong> el pasado mes de abril en este contexto. De formato muy <strong>pr\u00e1ctico<\/strong>, el taller reuni\u00f3 a unas 30 personas &#8211; estudiantes de doctorado, bioinform\u00e1ticos y estudiantes universitarios, mayoritariamente de m\u00e1ster &#8211; que quer\u00edan aprender a <strong>hacer su investigaci\u00f3n m\u00e1s reproducible, transparente y colaborativa<\/strong>.<\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\"><a href=\"https:\/\/orcid.org\/0000-0002-8731-3530\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><strong>Ulf Tolch<\/strong><\/a>,<\/span>\u00a0del centro QUEST de Berl\u00edn, Alemania, se encarg\u00f3 de impartir este seminario interactivo de 4 horas, que tuvo lugar el 9 de abril en la sala Charles Darwin del <a href=\"http:\/\/www.prbb.org\/es\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Parque de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica de Barcelona (PRBB)<\/a>. Los participantes proven\u00edan mayoritariamente de centros del PRBB &#8211; especialmente del CRG y del CNAG, con algunos del <a href=\"https:\/\/www.imim.es\/es_index.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Instituto Hospital del Mar de Investigaciones M\u00e9dicas\u00a0(IMIM)<\/a> y el <a href=\"https:\/\/www.ibe.upf-csic.es\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Instituto de Biolog\u00eda Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a> &#8211; aunque otros ven\u00edan de centros externos como la Universidad de Barcelona, el Barcelona Supercomputing Centre (BSC) o el Instituto de Bioingenier\u00eda de Catalu\u00f1a (IBEC).<\/p>\n<p>\u00a0<\/p>\n<figure id=\"attachment_7419\" aria-describedby=\"caption-attachment-7419\" style=\"width: 5472px\" class=\"wp-caption alignnone\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-7419\" src=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2019\/05\/P1020255.jpg\" alt=\"About 30 bioinformaticians participated in this workshop about reproducibility in computational research.\" width=\"5472\" height=\"3648\" srcset=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2019\/05\/P1020255.jpg 5472w, https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2019\/05\/P1020255-336x224.jpg 336w, https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2019\/05\/P1020255-768x512.jpg 768w, https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2019\/05\/P1020255-900x600.jpg 900w\" sizes=\"auto, (max-width: 5472px) 100vw, 5472px\" \/><figcaption id=\"caption-attachment-7419\" class=\"wp-caption-text\">Alrededor de 30 bioinform\u00e1ticos y bioinform\u00e1ticas participaron en este taller sobre la reproducibilidad en la investigaci\u00f3n computacional.<\/figcaption><\/figure>\n<p>\u00a0<\/p>\n<p>Pod\u00e9is leer m\u00e1s detalles sobre el contenido del taller en la <a href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/hacia-una-biologia-computacional-mas-reproducible-transparente-y-colaborativa\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">versi\u00f3n inglesa de este art\u00edculo<\/a>.<\/p>\n<p>La jornada tuvo lugar gracias al proyecto europeo <a href=\"https:\/\/www.fosteropenscience.eu\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><b>Foster<\/b><\/a><b> H2020<\/b> en el que el CRG participa. En la p\u00e1gina web del proyecto pod\u00e9is encontrar muchos m\u00e1s recursos de formaci\u00f3n sobre <a href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/michael-eisen-el-cambio-es-inevitable-toda-la-investigacion-sera-abierta-y-evaluada-de-otra-forma\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">ciencia abierta<\/a>.<\/p>\n<p>Pod\u00e9is ver un v\u00eddeo (en INGL\u00c9S) donde entrevistamos al tutor del curso, Ulf Tolch.<\/p>\n<p>\u00a0<\/p>\n\n<style>.embed-container { position: relative; padding-bottom: 56.25%; height: 0; overflow: hidden; max-width: 100%; } .embed-container iframe, .embed-container object, .embed-container embed { position: absolute; top: 0; left: 0; width: 100%; height: 100%; }<\/style>\n<div class='embed-container'><iframe src='https:\/\/www.youtube.com\/embed\/-8qVsXEcR2s' frameborder='0' allowfullscreen><\/iframe><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>C\u00f3mo hacer que la investigaci\u00f3n en biolog\u00eda computacional sea m\u00e1s reproducible, transparente y colaborativa fue el tema de un curso organizado por el CRG el pasado mes de abril. <\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":7869,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[33],"tags":[262,435,490,266,487],"new-type":[44],"class_list":["post-7952","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-vida-cientifica-es","tag-bioinformatica-es","tag-buenas-practicas-cientificas","tag-ciencia-abierta","tag-crg-es","tag-formacion","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/7952","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=7952"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/7952\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":27128,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/7952\/revisions\/27128"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/7869"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=7952"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=7952"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=7952"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=7952"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}