{"id":5716,"date":"2019-03-21T15:39:15","date_gmt":"2019-03-21T14:39:15","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=5716"},"modified":"2019-04-03T16:27:42","modified_gmt":"2019-04-03T14:27:42","slug":"manuel-pastor-mayor-base-de-datos-toxicologicos-del-mundo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/manuel-pastor-mayor-base-de-datos-toxicologicos-del-mundo\/","title":{"rendered":"Manuel Pastor: \u00abHemos creado una gran base de datos toxicol\u00f3gicos\u00bb"},"content":{"rendered":"

Manuel Pastor<\/strong> es l\u00edder del grupo de farmacoinform\u00e1tica<\/a> que forma parte de la Unidad de Investigaci\u00f3n en Inform\u00e1tica Biom\u00e9dica<\/a> (GRIB). Pastor tiene gran experiencia en el campo del dise\u00f1o y desarrollo de f\u00e1rmacos<\/strong>, y desde 2010 participa, junto con Ferran Sanz<\/a>, en la coordinaci\u00f3n del proyecto eTOX<\/u><\/strong><\/a>; hoy le preguntamos por el estado de \u00e9ste y su continuaci\u00f3n.<\/p>\n

eTOX es un proyecto europeo financiado por la Iniciativa de Medicamentos Innovadores<\/strong> (IMI<\/a>), que pretende impulsar el desarrollo de nuevos medicamentos, especialmente en \u00e1reas donde existen necesidades m\u00e9dicas o sociales no cubiertas. En este caso, el proyecto se centra en el campo de la toxicolog\u00eda de los f\u00e1rmacos. \u201cEl valor del proyecto eTOX es crear una cultura de colaboraci\u00f3n entre farmac\u00e9uticas, un modo eficiente de utilizar la informaci\u00f3n que generan en un campo tan importante como la toxicolog\u00eda\u201d, explica Pastor.<\/p>\n

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\u201cEl valor de eTOX es crear una cultura de colaboraci\u00f3n entre farmac\u00e9uticas, un modo eficiente de utilizar la informaci\u00f3n que generan en toxicolog\u00eda\u201d
\nManuel Pastor<\/strong><\/p><\/blockquote>\n

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\u00bfEn qu\u00e9 consiste eTOX y cu\u00e1l ha sido vuestro papel?<\/strong><\/p>\n

En el campo de la toxicolog\u00eda para el desarrollo de medicamentos, las farmac\u00e9uticas<\/strong> han generado una cantidad enorme de datos<\/strong> para demostrar que los compuestos que desarrollan son seguros<\/strong>. La mayor\u00eda de estos datos no se utilizaban, pero gracias al proyecto eTOX, varias empresas farmac\u00e9uticas han empezado a explotarlos y compartirlos.<\/p>\n

Nosotros, como coordinadores acad\u00e9micos<\/strong> hemos gestionado diferentes l\u00edneas de trabajo para extraer los datos, normalizarlos y construir modelos predictivos<\/strong>. As\u00ed hemos generado un producto sostenible, la plataforma eTOXsys<\/a>. \u00c9sta permite hacer una utilizaci\u00f3n eficiente de la informaci\u00f3n y as\u00ed no tener que repetir experimentos que ya se han realizado anteriormente, por ejemplo.<\/p>\n

Adem\u00e1s de ahorrar tiempo y dinero, estos datos son especiales porque permiten salvar vidas. Para obtener toda esta informaci\u00f3n se han sacrificado animales de experimentaci\u00f3n; nuestra plataforma permite que estas vidas se utilicen del modo m\u00e1s eficiente posible.<\/p>\n

\u00abLos datos recolectados en la\u00a0plataforma eTOXsys<\/a>\u00a0permiten ahorrar tiempo, dinero y vidas de animales de laboratorio\u00bb<\/p><\/blockquote>\n

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\u00bfCu\u00e1l es el producto de eTOX, qu\u00e9 es tangible? <\/strong><\/p>\n

Hemos pasado de una carpeta polvorienta con informes internos a una base de datos digital perfectamente estructurada<\/strong>. Esto ha sido muy dif\u00edcil porque muchos resultados estaban en papel y no estructurados; la misma cosa estaba escrita de mil formas diferentes y en muchos idiomas distintos. \u00a1Estoy hablando de 4 millones de t\u00e9rminos <\/strong>de histopatolog\u00eda que hemos tenido que estandarizar! Hemos hecho, por primera vez, una ontolog\u00eda completa de histopatolog\u00eda<\/strong>, con conceptos organizados y ordenados de forma jer\u00e1rquica.<\/p>\n

Hemos aplicado un enorme esfuerzo para convertir estos repositorios en una plataforma digital compatible para hacer un tratamiento l\u00f3gico de an\u00e1lisis de datos. Ahora tenemos la base de datos de este tipo de estudios toxicol\u00f3gicos in vivo<\/em> m\u00e1s grande del mundo<\/strong>.<\/p>\n

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\"Durante
Durante el proyecto eTOX se han ordenado miles de documentos internos y m\u00e1s de 4 millones de t\u00e9rminos. Foto de Unsplash.<\/figcaption><\/figure>\n

\u00bfY esta base de datos, c\u00f3mo se utiliza? <\/strong><\/p>\n

Hay varias formas de explotar la plataforma eTOXsys. La primera es usar la base de datos directamente para ver si alguien ya ha probado este compuesto en concreto. Pero hay otra forma, que es observar patrones<\/strong>, puesto que ciertas caracter\u00edsticas de las mol\u00e9culas est\u00e1n asociadas a un efecto adverso.<\/p>\n

Cuando tu estas a punto de desarrollar el f\u00e1rmaco, puedes mirar lo que llamamos modelos predictivos para comprobar si es posible que este compuesto sea t\u00f3xico. Con esto, puedes descartar o priorizar el compuesto dependiendo de la predicci\u00f3n de su toxicidad<\/strong>, pero tambi\u00e9n puede servir para ver cu\u00e1l es el orden de las pruebas que tienes que seguir; haremos primero las pruebas en las que tenga m\u00e1s probabilidad de ser t\u00f3xico, as\u00ed podemos descartar el compuesto antes y no usamos tantas vidas animales.<\/p>\n

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Pero los modelos predictivos s\u00f3lo te dan pistas\u2026 no son definitivos, \u00bfno?<\/strong><\/p>\n

La verdad es que se ha abierto un debate en cuanto a la validez de los modelos. Los ratones son un modelo no humano<\/strong>, y muchas veces cuando repites los experimentos te puede dar otro resultado<\/strong> porque hay diferencias entre especies<\/strong> y entre animales de una misma especie. Las reglas GLP (good laboratory practices)<\/strong> garantizan, en teor\u00eda, la mejor calidad que podemos tener; pero a\u00fan as\u00ed, los m\u00e9todos animales no son la panacea. Muchas de estas pruebas se consideran el \u201cgold standard\u201d, pero sabemos que no son infalibles y que \u00a0hay estrategias que pueden ser m\u00e1s seguras.<\/p>\n

Pero, por ahora, tampoco se puede prescindir de la experimentaci\u00f3n animal<\/a>\u2026 Los reguladores tienen una actitud abierta hacia \u00a0nuevas estrategias que sean mejores que las que hay hoy en d\u00eda, siempre que seamos capaces de demostrarlo. Los animalistas todos los a\u00f1os recogen firmas para prohibir la experimentaci\u00f3n animal, pero actualmente es una utop\u00eda, no se puede hacer. La gente tiene que ser consciente de que prohibir taxativamente todas las pruebas animales no es justificable<\/strong>, los pacientes acabar\u00edan siendo los primeros seres vivos en probar los f\u00e1rmacos por lo que seguir\u00eda siendo in vivo <\/em>en humanos, y esto no ser\u00eda \u00e9tico. Hay esperanzas de que en un per\u00edodo de tiempo se puedan sustituir m\u00e9todos in vivo<\/em> por in vitro<\/em>, junto con in silico<\/em>. Pero no te puedo decir la fecha de cu\u00e1ndo ocurrir\u00e1; 10 a\u00f1os, 20 a\u00f1os\u2026 \u00a1pero no antes! Imposible. Hoy en d\u00eda no hay nada con lo que podamos reemplazar algunos tipos de pruebas in vivo<\/em>.<\/p>\n

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\"\"<\/p>\n

\u00abLos organismos reguladores tienen una actitud abierta hacia \u00a0nuevas estrategias para detectar toxicidad que sean mejores que las que hay hoy en d\u00eda (i.e. la experimentaci\u00f3n animal), siempre que seamos capaces de demostrar que lo son\u00bb.<\/p><\/blockquote>\n

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Sin embargo, es cierto que est\u00e1 ocurriendo un cambio de paradigma<\/strong>. Se est\u00e1n empezando a reemplazar estas pruebas con animales por otros m\u00e9todos<\/strong>. Este proyecto ha tenido la fortuna de desarrollarse durante este momento de cambio, lo que nos permite aplicar los modelos predictivos que estamos desarrollando en eTOX para intentar hacer aproximaciones que pueden ser m\u00e1s seguras que las que se hacen \u00fanicamente con animales. En este y otros proyectos estamos colaborando directamente con los reguladores, como la European Medicines Agency (EMA)<\/a> y la Agencia Europea de Productos Qu\u00edmicos (ECHA)<\/a>, para estudiar c\u00f3mo estos nuevos m\u00e9todos pueden dar lugar a una evaluaci\u00f3n de la toxicidad mucho m\u00e1s segura<\/strong>.<\/p>\n

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\u00bfLa plataforma ser\u00e1 p\u00fablica?<\/strong><\/p>\n

Es un tema bastante delicado porque la base de datos ha sido construida con datos internos de las farmac\u00e9uticas<\/strong>. Yo creo que esto ya ha sido un paso de gigante, en el sentido que una farmac\u00e9utica ha dejado ver lo que ha hecho a otra farmac\u00e9utica, y esto ha costado mucho trabajo. Ellos tienen una cultura de tener un cuidado exquisito de su propiedad intelectual, muy comprensible porque se ha invertido mucho dinero en hacer esto. Cada farmac\u00e9utica ten\u00eda una especie de fortaleza para proteger sus datos y no los compart\u00edan con nadie. El hecho de que ahora por primera vez una empresa farmac\u00e9utica comparta datos con otra es un \u00e9xito y forma parte de esta cultura de colaboraci\u00f3n pre-competitiva<\/strong>. Este es el primer paso, compartir.<\/p>\n

Pero este proyecto empez\u00f3 hace tiempo y durante este tiempo ha crecido la necesidad y la demanda social<\/strong> de que los datos<\/strong> que se generen sean cada vez m\u00e1s p\u00fablicos<\/strong> y que la investigaci\u00f3n cient\u00edfica sea m\u00e1s transparente. <\/strong>Es algo de lo que al principio no se hablaba y que ahora es de importancia capital. Hemos conseguido convencerles de la importancia de crear esa base de datos y, de hecho, una parte de los compuestos y modelos (lo que llamamos el eTOXsys<\/a> sampler) es p\u00fablica.<\/p>\n

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\u00bfCu\u00e1les son los datos de los compuestos que se han hecho p\u00fablicos?<\/strong><\/p>\n

Lo m\u00e1s privado de la base de datos no son los resultados de toxicidad sino las estructuras<\/strong>, que son muy confidenciales<\/strong> porque son compuestos con potencial valor comercial<\/strong>. La parte p\u00fablica sobre todo contiene medicamentos ya en el mercado o compuestos conocidos que no han salido al mercado por su toxicidad.<\/p>\n

El honest broker<\/em><\/strong> es la figura del proyecto que almacena los datos y proporciona acceso<\/strong> a \u00e9stos dependiendo de los permisos que tengas para acceder. Esta figura es la encargada de gestionar el acceso y est\u00e1 ligado por contrato a no dejar ver los datos a nadie que no tenga el permiso necesario.<\/p>\n

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