{"id":50196,"date":"2025-12-12T10:17:47","date_gmt":"2025-12-12T09:17:47","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=50196"},"modified":"2025-12-12T10:19:36","modified_gmt":"2025-12-12T09:19:36","slug":"limbnet-una-plataforma-abierta-para-visualizar-el-desarrollo-de-extremidades","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/limbnet-una-plataforma-abierta-para-visualizar-el-desarrollo-de-extremidades\/","title":{"rendered":"LimbNET, una plataforma abierta para visualizar el desarrollo de extremidades"},"content":{"rendered":"\n

LimbNET<\/strong><\/a> es una nueva plataforma en l\u00ednea de acceso abierto <\/strong>desarrollada por investigadores en el Laboratorio Europeo de Biolog\u00eda Molecular \u2013 Barcelona (EMBL Barcelona)<\/a> que permitir\u00e1 a los cient\u00edficos y cient\u00edficas simular y explorar c\u00f3mo los genes coreografian el desarrollo de las extremidades<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

La plataforma est\u00e1 formada por \u201cMorphopel\u00edculas\u201d<\/strong>: v\u00eddeos que muestran la evoluci\u00f3n espaciotemporal de los patrones de expresi\u00f3n g\u00e9nica en 2D<\/a> durante la formaci\u00f3n de las extremidades del rat\u00f3n.<\/p>\n\n\n\n

El personal cient\u00edfico puede visualizar morfopel\u00edculas moleculares existentes, crear nuevas a partir de datos de imagen, por ejemplo obtenidas de experimentos de montaje completo in situ<\/em> (\u201cwhole-mount in situ\u201d<\/em>, o simular modelos computacionales de interacciones espaciotemporales entre diferentes genes.<\/p>\n\n\n\n

A diferencia de las publicaciones est\u00e1ticas tradicionales, LimbNET permite crear modelos interactivos y din\u00e1micos <\/strong>que pueden explorarse, probarse y ampliarse para que los investigadores puedan comparar las hip\u00f3tesis de los dem\u00e1s. Este cambio promueve la transparencia, la reproducibilidad y la construcci\u00f3n colaborativa de conocimiento<\/strong> en la comunidad de desarrollo de extremidades.<\/p>\n\n\n\n

La plataforma<\/a> funciona en un navegador<\/strong>, no requiere instalaci\u00f3n, y es accesible <\/strong>incluso para quienes tienen poca experiencia en modelaje. Esto reduce las barreras para la colaboraci\u00f3n interdisciplinar<\/strong>, especialmente entre investigadores experimentales y computacionales.<\/p>\n\n\n\n

En \u00faltima instancia, se espera que LimbNET<\/a> democratice el acceso a herramientas de modelaje<\/strong>, fomente el di\u00e1logo comunitario y apoye la evoluci\u00f3n de los modelos de desarrollo de las extremidades a medida que surjan nuevos datos.<\/p>\n\n\n\n

Antoni Matyjaszkiewicz <\/strong>y James Sharpe<\/a><\/strong> acaban de publicar un art\u00edculo<\/a> sobre la plataforma. Hablamos de ella con Sharpe, director de EMBL Barcelona y l\u00edder de la iniciativa.<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfDe d\u00f3nde surgi\u00f3 la idea de LimbNET?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Nuestro laboratorio ha estado creando simulaciones por ordenador del desarrollo de extremidades<\/strong> durante m\u00e1s de una d\u00e9cada, pero nuestro software solo era utilizable por investigadores del grupo y por aquellos con cierto nivel de experiencia en modelos matem\u00e1ticos. La idea de LimbNET<\/a> surgi\u00f3 al darnos cuenta de que nos gustar\u00eda fomentar que la comunidad experimental pueda acceder y utilizar los modelos por ordenador para ayudar a su investigaci\u00f3n<\/strong>. Por ello, concebimos una plataforma de modelaje inform\u00e1tico que requiriera conocimientos matem\u00e1ticos m\u00ednimos y que fuera accesible desde un navegador normal sin necesidad de instalar ning\u00fan software especializado.<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfQui\u00e9n gestiona la plataforma y qui\u00e9n puede a\u00f1adir nuevos datos?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

De momento, la plataforma<\/a> ser\u00e1 mantenida por nuestro laboratorio<\/a>. Si otros grupos desean unirse y ayudar con el mantenimiento, estar\u00edamos encantados de recibir este apoyo extra.<\/p>\n\n\n\n

Cualquier <\/strong>persona en el mundo interesada en el desarrollo de extremidades puede tener una cuenta en el sistema y a\u00f1adir nuevos datos<\/strong> (por ejemplo, patrones de expresi\u00f3n g\u00e9nica) o nuevas hip\u00f3tesis o ideas<\/strong>, en forma de modelos matem\u00e1ticos. Pero igualmente importante, los investigadores e investigadoras pueden usar el sistema sin a\u00f1adir datos nuevos<\/strong> propios: pueden simplemente acceder a los modelos que ya existen, reejecutarlos, explorarlos, cambiar par\u00e1metros y ver c\u00f3mo afecta a las predicciones de los modelos.<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfTodos los datos de la plataforma est\u00e1n previamente publicados?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

El sistema aloja tanto datos publicados como no publicados<\/strong>. Cada persona usuaria tiene su propio espacio privado, donde puede subir y explorar sus propios datos y modelos sin hacerlos p\u00fablicos. Cualquier usuario puede entonces hacer p\u00fablicos sus datos o modelos cuando est\u00e9 listo, ya sea antes o despu\u00e9s de publicarlos.<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfQu\u00e9 hace especial a LimbNET?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

No conocemos ninguna otra plataforma con las caracter\u00edsticas de este sistema. La caracter\u00edstica \u00fanica es el enfoque dual tanto a la parte de los datos <\/strong>(digitalizaci\u00f3n, curaci\u00f3n y mapeo en trayectorias din\u00e1micas) como a la parte de modelaje<\/strong> (definiendo modelos matem\u00e1ticos, pero tambi\u00e9n los solucionadores num\u00e9ricos para simular los modelos).<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfC\u00f3mo ha reaccionado la comunidad hasta ahora?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Dentro de la comunidad de desarrollo de extremidades, construir modelos inform\u00e1ticos a\u00fan no es una actividad habitual. Nuestro propio laboratorio ha publicado algunos modelos, pero el objetivo de LimbNET<\/a> es ayudar a toda la comunidad a ampliar la gama de modelos disponibles. Esperamos que haya un efecto de retroalimentaci\u00f3n positiva: cuantos m\u00e1s modelos existan, m\u00e1s valioso ser\u00e1 este enfoque para la comunidad experimental<\/strong>, y esto fomentar\u00e1 un mayor compromiso con el modelaje.<\/p>\n\n\n\n

Es importante destacar que el valor de los modelos <\/strong>ser\u00e1 m\u00e1s claro cuando estos sirvan para sugerir experimentos nuevos y espec\u00edficos<\/strong>; debe haber una interacci\u00f3n fluida de retroalimentaci\u00f3n entre experimentos y modelos, a nivel de la comunidad, y no solo a nivel de laboratorios individuales.<\/p>\n\n\n\n

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Dentro de la comunidad de desarrollo de extremidades, construir modelos inform\u00e1ticos a\u00fan no es una actividad habitual. Con LimbNET esperamos ayudar a ampliar la gama de modelos disponibles<\/em><\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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En cierto sentido, LimbNET<\/a> es en s\u00ed mismo un gran experimento. Pero somos muy optimistas de que en los pr\u00f3ximos 2-3 a\u00f1os LimbNET<\/a> pueda empezar a tener un impacto positivo y \u00fanico en el campo del desarrollo de extremidades.<\/p>\n\n\n\n

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Una nueva plataforma de acceso abierto para la comunidad investigadora del desarrollo embrionario de extremidades, desarrollada por EMBL Barcelona, cerrar\u00e1 la brecha entre los experimentos y los modelos matem\u00e1ticos.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":49263,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[27],"tags":[490,278,280],"new-type":[44],"class_list":["post-50196","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-investigacion","tag-ciencia-abierta","tag-desarrollo-embrionario","tag-embl-barcelona-es","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50196","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=50196"}],"version-history":[{"count":8,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50196\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":50221,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/50196\/revisions\/50221"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/49263"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=50196"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=50196"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=50196"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=50196"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}