{"id":44490,"date":"2024-09-16T11:46:50","date_gmt":"2024-09-16T09:46:50","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=44490"},"modified":"2024-09-16T11:49:18","modified_gmt":"2024-09-16T09:49:18","slug":"iluminando-la-oscuridad-del-proteoma-con-inteligencia-artificial","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/iluminando-la-oscuridad-del-proteoma-con-inteligencia-artificial\/","title":{"rendered":"Iluminando la oscuridad (del proteoma) con inteligencia artificial"},"content":{"rendered":"\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Todos los seres vivos fabrican <strong>prote\u00ednas<\/strong> a partir de su ADN, pero<strong> no todas se conocen<\/strong>. De algunas no se sabe su forma ni su funci\u00f3n, pero s\u00ed se puede tener la secuencia de ADN que las codifica. Esta secuencia ha sido la base de una colaboraci\u00f3n entre el<a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/www.cabd.es\/es\/\" target=\"_blank\"> Centro Andaluz de Biolog\u00eda del Desarrollo (CABD)<\/a> y el <a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/www.ibe.upf-csic.es\/\" target=\"_blank\">Instituto de Biolog\u00eda Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a> para <strong>analizar prote\u00ednas con<a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/tag\/ia-es\/\" target=\"_blank\"> inteligencia artificial<\/a><\/strong>.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">El <a href=\"https:\/\/www.ibe.upf-csic.es\/home\/-\/asset_publisher\/T2caeLMECPvW\/content\/a-study-shows-that-artificial-intelligence-can-decipher-the-function-of-unknown-proteins\/maximized\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><strong>estudio<\/strong> <\/a>ha analizado <strong>secuencias de organismos modelo<\/strong> (levadura, rat\u00f3n y <a href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/de-moscas-y-humanos\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">mosca de la fruta<\/a>) a trav\u00e9s del <strong><em>deep learning<\/em><\/strong> o aprendizaje profundo, y se han podido <strong>determinar y clasificar<\/strong> con gran detalle las <strong>funciones de prote\u00ednas<\/strong> de las que no se ten\u00eda informaci\u00f3n previa.<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:31px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<blockquote class=\"wp-block-quote is-layout-flow wp-block-quote-is-layout-flow\"><p>A trav\u00e9s del aprendizaje profundo, los grupos de investigaci\u00f3n han logrado determinar la funci\u00f3n de prote\u00ednas de las que solo se ten\u00eda la secuencia de ADN que las codifica.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n<div style=\"height:31px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Los y las autoras tambi\u00e9n observaron que, de entre los dos m\u00e9todos de <em>deep learning<\/em> utilizados, los<strong> modelos de lenguaje<\/strong> o <em>transformers<\/em> son m\u00e1s eficientes que las <strong>redes convolucionales<\/strong>. Este \u00faltimo m\u00e9todo se basa en el procesamiento de im\u00e1genes, mientras que los <em>transformers<\/em> procesan secuencias y lenguaje, lo que los hace m\u00e1s informativos y precisos, adem\u00e1s de poder recuperar informaci\u00f3n a partir de secuencias de ARN.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Esta investigaci\u00f3n es vital para abordar la problem\u00e1tica del <strong>proteoma oscuro<\/strong>, formado por todas aquellas prote\u00ednas de las que no se tiene informaci\u00f3n. As\u00ed, se pueden <strong>analizar prote\u00ednas e identificar<\/strong> funciones de genes con <strong>potencial biom\u00e9dico y biotecnol\u00f3gico<\/strong>, sobre todo en organismos poco estudiados hasta ahora, se\u00f1ala <a href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/biodiversity-genomics-europe-un-empuje-a-la-conservacion-de-la-biodiversidad-en-europa\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><strong>Rosa Fern\u00e1ndez<\/strong><\/a>, co-l\u00edder del estudio en el IBE (CSIC-UPF). Esto es especialmente relevante ahora que<a href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/investigadores-del-prbb-secuenciaran-el-genoma-de-cuatro-especies-endemicas-por-el-proyecto-del-biogenoma-de-la-tierra\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"> se est\u00e1n secuenciando grandes cantidades de organismos desconocidos<\/a>, lo que genera <a href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/tomas-marques-bonet-ibe-queremos-secuenciar-las-70-000-especies-de-vertebrados-en-los-proximos-10-anos\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">millones de secuencias<\/a>, de las cuales no se puede predecir la funci\u00f3n usando m\u00e9todos tradicionales.<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:55px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>El proteoma oscuro comprende las prote\u00ednas de las que no se conoce su estructura ni funci\u00f3n. Ahora, un estudio en el que ha participado el IBE (CSIC-UPF), revela que es posible determinar funciones desconocidas de las prote\u00ednas gracias al aprendizaje profundo o deep learning.<\/p>\n","protected":false},"author":33,"featured_media":44478,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[27],"tags":[861,212,206,330],"new-type":[44],"class_list":["post-44490","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-investigacion","tag-ia-es","tag-ibe-csic-upf-es","tag-organismos-modelo","tag-proteinas","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/44490","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/33"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=44490"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/44490\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":44511,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/44490\/revisions\/44511"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/44478"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=44490"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=44490"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=44490"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=44490"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}