{"id":38661,"date":"2023-10-23T10:16:33","date_gmt":"2023-10-23T08:16:33","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=38661"},"modified":"2023-10-23T12:50:10","modified_gmt":"2023-10-23T10:50:10","slug":"un-nuevo-aparato-para-hacer-pcr-digitales-en-el-prbb","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/un-nuevo-aparato-para-hacer-pcr-digitales-en-el-prbb\/","title":{"rendered":"Un nuevo equipo para hacer PCR digitales en el PRBB"},"content":{"rendered":"\n

El servicio de gen\u00f3mica del Departamento de Medicina y Ciencias de la vida, Universidad Pompeu Fabra (MELIS-UPF)<\/a> ha instalado este verano un equipo para hacer PCR digitales<\/strong>, una tecnolog\u00eda que hace m\u00e1s de 5 a\u00f1os que existe, pero que en los \u00faltimos uno o dos a\u00f1os ha estado en alza. El equipo ha sido cedido por Roche <\/strong>durante un per\u00edodo de 6 a 12 meses, con la posibilidad de continuidad si hay suficiente inter\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n

Todo comenz\u00f3 cuando Roger Anglada<\/strong>, miembro de la unidad, visit\u00f3 las instalaciones Roche en Sant Cugat. All\u00ed coincidi\u00f3 con Bea Bellosillo<\/strong>, investigadora del Hospital del Mar Research Institute<\/a>, quien ya estaba utilizando la tecnolog\u00eda de PCR digitales y quer\u00eda conocer mejor la m\u00e1quina de Roche. \u00abDecidimos presentar un proyecto conjunto para poder tener esta m\u00e1quina aqu\u00ed en el PRBB, ya que no hab\u00eda ninguna parecida<\/strong>\u00ab. Y lo consiguieron.<\/p>\n\n\n\n

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PCR cuantitativa vs <\/em>PCR digital <\/strong><\/h2>\n\n\n\n

\u00bfY qu\u00e9 es una PCR digital? Una PCR <\/strong>– popularizada gracias a los test de la Covid<\/a> – es una tecnolog\u00eda para amplificar ADN o ARN<\/strong>. En una PCR cuantitativa <\/strong>se puede ir viendo en tiempo real c\u00f3mo se van generando las copias \u2013 y la curva exponencial que marca la cantidad de mol\u00e9culas, al principio casi inexistente, empieza a ser visible m\u00e1s temprano o m\u00e1s tarde seg\u00fan la cantidad de muestra inicial. Por ello con este tipo de PCR se<\/strong> puede inferir la cantidad de material presente en una muestra<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

\u00abEsto es \u00fatil, por ejemplo, para hacer estudios de expresi\u00f3n g\u00e9nica, donde se puede amplificar el ARN de un gen de inter\u00e9s y compararlo con otro gen del que se conocen los niveles de expresi\u00f3n\u00bb, explica N\u00faria Bonet<\/strong>, jefa de la unidad de gen\u00f3mica<\/a>. O comparar los niveles de expresi\u00f3n de un gen antes y despu\u00e9s de a\u00f1adir un f\u00e1rmaco a la muestra, por ejemplo.<\/p>\n\n\n\n

Esta cuantificaci\u00f3n <\/strong>es, entonces, siempre relativa <\/strong>a otra muestra, o a otro momento.<\/p>\n\n\n\n

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Una PCR cuantitativa tan solo infiere la cantidad de ADN o ARN original que hay en una muestra, siempre de forma relativa a otra muestra. La PCR digital permite saber el n\u00famero exacto de mol\u00e9culas.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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En cambio, la PCR digital (dPCR) <\/strong>permite hacer una cuantificaci\u00f3n absoluta<\/strong>, es decir, saber el n\u00famero exacto de mol\u00e9culas que tienes en la muestra<\/strong>. \u00abCargas tu muestra muy diluida en una superficie con muchos pozos (hay placas de 28.000 y de 100.000). Por azar, en algunos pozos no habr\u00e1 ninguna mol\u00e9cula y en otros habr\u00e1 s\u00f3lo una. Una vez haces la dPCR, ves si cada pozo ha amplificado o no, y contando el n\u00famero de pozos donde s\u00ed ha habido amplificaci\u00f3n puedes saber el n\u00famero exacto de mol\u00e9culas iniciales\u00bb, explica Bonet. \u201cPara hacer una analog\u00eda, con la PCR cuantitativa pod\u00edamos saber si el campo del Bar\u00e7a estaba m\u00e1s lleno que el del Espanyol, mientras que con la PCR digital podemos saber que hay exactamente 89.472 asientos ocupados de los 113.000 totales. Tiene una sensibilidad incre\u00edble\u00bb, a\u00f1ade Anglada. En efecto, la PCR digital puede detectar mol\u00e9culas presentes en tan solo un 0,02%\u201d. <\/strong>Adem\u00e1s, se pueden poner hasta 12 placas a la vez en la m\u00e1quina, y puede leer hasta 6 fluorocromos diferentes a la vez en cada pozo\u00bb, concluye Bonet.<\/p>\n\n\n\n

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Posibles aplicaciones<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

La PCR digital puede tener muchas aplicaciones. Bellosillo la usa, por ejemplo, para detectar mol\u00e9culas cancer\u00edgenas en muestras de sangre<\/strong><\/a> \u2013 y ver la carga tumoral antes y despu\u00e9s del tratamiento. De forma similar, se puede utilizar para detectar la carga viral en una infecci\u00f3n. \u00abOtro ejemplo de aplicaci\u00f3n ser\u00eda detectar mutaciones som\u00e1ticas<\/strong>, que tienen lugar en el individuo adulto y por lo tanto no est\u00e1n presentes en todas las c\u00e9lulas de nuestro cuerpo; con la PCR digital puedes cuantificar qu\u00e9 porcentaje de c\u00e9lulas tienen esta mutaci\u00f3n<\/strong> y cu\u00e1les no\u00bb, a\u00f1ade Bonet.<\/p>\n\n\n\n

El pr\u00f3ximo 31 de octubre a las 11.30h en la sala Ram\u00f3n y Cajal <\/strong>se celebrar\u00e1 un acto donde Roche presentar\u00e1 la m\u00e1quina, su funcionamiento y sus aplicaciones<\/strong>. \u00abHasta ahora hemos estado haciendo pruebas, calibrando, aprendiendo el software… La preparaci\u00f3n es igual a la de la PCR cuantitativa, pero las placas y el an\u00e1lisis es diferente\u00bb, explica la jefa del servicio de gen\u00f3mica. \u00abInvitamos a todos a venir al seminario el d\u00eda 31 para ver qu\u00e9 se puede hacer con esta tecnolog\u00eda, y luego nosotros ofreceremos a aquellas personas interesadas formaci\u00f3n espec\u00edfica\u00bb.<\/p>\n\n\n\n

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El pr\u00f3ximo martes 31 de octubre a las 11,30h, habr\u00e1 una sesi\u00f3n abierta a todos los residentes del PRBB para presentar este aparato y sus aplicaciones.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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Como todos los servicios cient\u00edfico-t\u00e9cnicos del Parque de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica de Barcelona (PRBB)<\/a>, este equipo est\u00e1 disponible para todos los residentes del parque, as\u00ed como para personas de la comunidad cient\u00edfica externas al PRBB.<\/p>\n\n\n\n

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La unidad de gen\u00f3mica de la UPF tiene un nuevo equipo para hacer PCR digitales, que permiten saber el n\u00famero exacto de mol\u00e9culas en una muestra, y pueden detectar mol\u00e9culas presentes en tan solo un 0,02%.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":38648,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[29,33],"tags":[707,274,590],"new-type":[44],"class_list":["post-38661","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-comunidad","category-vida-cientifica-es","tag-genomica-es","tag-melis-upf-es","tag-tecnologia-es","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/38661","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=38661"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/38661\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":38715,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/38661\/revisions\/38715"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/38648"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=38661"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=38661"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=38661"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=38661"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}