{"id":32960,"date":"2022-10-17T11:09:45","date_gmt":"2022-10-17T09:09:45","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=32960"},"modified":"2023-01-03T17:52:27","modified_gmt":"2023-01-03T16:52:27","slug":"arranca-el-barcelona-collaboratorium-for-modelling-and-predictive-biology","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/arranca-el-barcelona-collaboratorium-for-modelling-and-predictive-biology\/","title":{"rendered":"Arranca el \u00abBarcelona Collaboratorium for modelling and predictive biology\u00bb"},"content":{"rendered":"\n

Una nueva forma de hacer ciencia<\/strong> est\u00e1 surgiendo en Barcelona. El ‘Barcelona Collaboratorium for Modeling and Predictive Biology<\/a>‘, una iniciativa conjunta del Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a> y el Laboratorio Europeo de Biolog\u00eda Molecular \u2013 Barcelona (EMBL Barcelona)<\/a> se inaugur\u00f3 a principios de octubre en el PRBB con el Simposio de lanzamiento ‘Programmable Life<\/a>‘ . Ocupando una planta entera del edificio de la Fundaci\u00f3n Pasqual Maragall (FPM), pretende ser un espacio para la \u00abingenier\u00eda biol\u00f3gica\u00bb en Barcelona<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

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El porqu\u00e9 y el como del Barcelona Collaboratorium <\/h2>\n\n\n\n

En la reuni\u00f3n de inauguraci\u00f3n en el auditorio del Parque de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica de Barcelona (PRBB)<\/a>, el investigador del CRG Ben Lehner<\/strong>, uno de los motores de la creaci\u00f3n del Collaboratorium, explic\u00f3 el por qu\u00e9<\/strong> de esta idea.<\/p>\n\n\n\n

\u201cLos humanos nos hemos vuelto incre\u00edblemente buenos en ingenier\u00eda. Pero todav\u00eda no sabemos c\u00f3mo dise\u00f1ar algo tan notable como un guepardo, que puede pasar de 0 a 100 km en 3 segundos, y puede construirse a s\u00ed mismo, y reproducirse. En realidad, ni siquiera sabemos c\u00f3mo dise\u00f1ar tejidos<\/strong>. O c\u00e9lulas. O incluso, f\u00e1cilmente, prote\u00ednas\u201d, comenz\u00f3 Ben.<\/p>\n\n\n\n

Pero llegaremos a hacerlo, seg\u00fan el joven cient\u00edfico. Y para lograrlo necesitaremos muchos datos<\/strong>, que ya estamos acumulando en grandes cantidades. Desde que cre\u00f3 su propio laboratorio, dijo, la secuenciaci\u00f3n de un genoma ha pasado de costar mil millones de d\u00f3lares a 200 d\u00f3lares.<\/p>\n\n\n\n

Sin embargo, los datos por s\u00ed solos no son suficientes<\/strong>. La biolog\u00eda es tan compleja<\/strong> que hay m\u00e1s formas diferentes de hacer una prote\u00edna de 100 amino\u00e1cidos que \u00e1tomos en el universo. Lo que significa que es pr\u00e1cticamente imposible probar todas las combinaciones experimentalmente o incluso examinar ese espacio computacionalmente de forma exhaustiva. Lo que necesitamos son modelos generativos<\/strong>. \u201cY eso es solo para la estructura m\u00e1s simple\u201d, continu\u00f3 el bi\u00f3logo. \u201cSi vamos a c\u00e9lulas, \u00f3rganos,… el espacio combinatorio es enorme. Necesitamos muchos m\u00e1s modelos, de todo tipo, para hacer que la biolog\u00eda sea predictiva\u201d. Y tiene que pasar aqu\u00ed: en Europa, en Barcelona. De ah\u00ed la creaci\u00f3n del Collaboratorium.<\/p>\n\n\n\n

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\u201cTenemos grandes cantidades de datos biol\u00f3gicos de alta calidad disponibles, pero no tenemos herramientas te\u00f3ricas y computacionales que ayuden a explicar y predecir la biolog\u00eda compleja\u201d<\/em>
Ben Lehner <\/strong>(CRG)<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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James Sharpe,<\/strong> el otro cerebro detr\u00e1s de este nuevo proyecto, continu\u00f3 explicando c\u00f3mo <\/strong>planean lograrlo<\/p>\n\n\n\n

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En pocas palabras, se basa en una nueva forma de organizar la ciencia<\/strong>; en lugar de una estructura fija en laboratorios separados, con investigadores principales, posdoctorados, doctorandos, etc. buscan una estructura colaborativa m\u00e1s fluida<\/strong>. Tambi\u00e9n quieren fomentar la movilidad<\/strong>, por lo que prev\u00e9n que la mitad de las personas que trabajen en el Collaboratorium sean cient\u00edficos o cient\u00edficas visitantes o de sab\u00e1tico<\/strong>, que pasar\u00edan all\u00ed unos meses y tendr\u00edan una relaci\u00f3n de mentor\u00eda con el resto del personal m\u00e1s estable. Por lo tanto, habr\u00e1 convocatorias anuales<\/strong> abiertas para traer a estos expertos y expertas l\u00edderes mundiales a trabajar bajo un mismo techo, en colaboraci\u00f3n con el personal local.<\/p>\n\n\n\n

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Collaboraci\u00f3n por todas partes<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

\u00abAunque el Collaboratorium no estar\u00e1 f\u00edsicamente en el PRBB, no est\u00e1 tan lejos, a 10 minutos a pie, as\u00ed que esperamos que<\/strong> la interacci\u00f3n con el resto de la comunidad aqu\u00ed en el PRBB sea muy importante<\/strong>\u201d, agreg\u00f3 Sharpe, refiri\u00e9ndose al parque donde tanto CRG como EMBL est\u00e1n ubicados. Y tambi\u00e9n quieren iniciar colaboraciones con otros centros de Barcelona<\/strong>, \u200b\u200bas\u00ed como convertirse en un referente mundial en este tipo de ciencia, basada no en laboratorios r\u00edgidos sino en visitantes que van y vienen, albergando grandes mentes que interact\u00faan entre s\u00ed.<\/p>\n\n\n\n

En cuanto a los temas a tratar, no ponen l\u00edmites; ser\u00e1n tan variados como el personal investigador participante quieran que lo sean.<\/p>\n\n\n\n

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\u201cQueremos permitir el estudio desde las mol\u00e9culas hasta los ecosistemas, con una fertilizaci\u00f3n cruzada de ideas\u201d
James Sharpe <\/strong>(EMBL-Barcelona)<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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Adem\u00e1s de los modelos te\u00f3ricos <\/strong>que se espera salgan del Collaboratorium, se tiene planificado un simposio anual<\/strong>, que se basar\u00e1 en los temas que proponga la propia comunidad, adem\u00e1s de talleres <\/strong>y otros eventos.<\/p>\n\n\n\n

La iniciativa tiene prevista una duraci\u00f3n m\u00ednima de cinco a\u00f1os<\/strong> para empezar, y est\u00e1 cofinanciada por el CRG, EMBL Barcelona, \u200b\u200bla Generalitat de Catalunya, el Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n de Espa\u00f1a y el programa ‘Centro de Excelencia Severo Ochoa’ del CRG.<\/p>\n\n\n\n

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La iniciativa Barcelona Collaboratorium tiene como objetivo fomentar una nueva forma de hacer ciencia para crear modelos generativos que ayuden a predecir y dise\u00f1ar la biolog\u00eda.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":32952,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[33],"tags":[310,308,266,280,431],"new-type":[39,44],"class_list":["post-32960","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-vida-cientifica-es","tag-biologia-de-sistemas","tag-biologia-sintetica-es","tag-crg-es","tag-embl-barcelona-es","tag-modelaje-de-tejidos","new-type-a-fondo","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32960","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=32960"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32960\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":32973,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32960\/revisions\/32973"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/32952"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=32960"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=32960"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=32960"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=32960"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}