{"id":28377,"date":"2022-03-14T13:55:11","date_gmt":"2022-03-14T12:55:11","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=28377"},"modified":"2022-03-25T10:21:19","modified_gmt":"2022-03-25T09:21:19","slug":"genigma-el-juego-que-ayuda-a-la-investigacion-del-cancer","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/genigma-el-juego-que-ayuda-a-la-investigacion-del-cancer\/","title":{"rendered":"Genigma: el juego que ayuda a la investigaci\u00f3n del c\u00e1ncer"},"content":{"rendered":"\n

Genigma <\/strong>es un experimento de ciencia ciudadana para explorar el genoma humano de forma colaborativa<\/a><\/strong>. Para involucrar a la ciudadan\u00eda en la investigaci\u00f3n, se ha creado una app para dispositivos m\u00f3viles que permite analizar los datos del genoma de las c\u00e9lulas cancerosas para encontrar el orden de las secuencias y las anomal\u00edas<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Elisabetta Broglio<\/strong>, facilitadora de proyectos de ciencia ciudadana en el Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a> y project manager de Genigma, nos cuenta m\u00e1s.<\/p>\n\n\n\n

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Elisabetta Broglio, facilitadora de proyectos de ciencia ciudadana en el CRG y project manager de Genigma.<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
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\u00bfC\u00f3mo surge la idea de crear este proyecto?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

La idea original nace de dos postdocs, Marco di Stefano y Juan Rodr\u00edguez<\/strong>, del CNAG-CRG, que en 2019 trabajan en el Structural Genomic Group liderado por Marc Mart\u00ed-Renom<\/a><\/strong>. En su trabajo diario de an\u00e1lisis del genoma en 3D siempre recurr\u00edan a unos ajustes manuales<\/strong> para afinar algunos par\u00e1metros que los algoritmos no eran capaces de definir bien. <\/p>\n\n\n\n

Estos ajustes en el ordenador resultaban ser una tarea esencialmente visual y de l\u00f3gica<\/strong>, por lo que se plantearon la idea de convertirla en un juego para involucrar a la gente y acelerar la investigaci\u00f3n<\/strong>. Aplicaron entonces a la convocatoria<\/a> lanzada por el proyecto ORION Open Sience<\/a> y se pusieron en contacto conmigo para que les asesorara sobre aspectos esenciales de ciencia ciudadana, una metodolog\u00eda totalmente desconocida para ellos. <\/p>\n\n\n\n

En el momento en el que se obtuvo la financiaci\u00f3n empezamos a trabajar juntos en el proyecto. Les propuse, entre otras cosas, empezar abriendo la idea a la ciudadan\u00eda con 3 sesiones de co-creaci\u00f3n<\/strong><\/a> e involucramos a 120 personas de perfiles muy diversos<\/strong>. \u00a1Eso fue en 2019!<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfQu\u00e9 aportan los jugadores que les falte a los algoritmos?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Los algoritmos delante del mismo problema te dan siempre el mismo resultado; por decirlo de alguna forma, los algoritmos juegan todos igual. Las personas, en cambio, juegan de forma diferente y pueden llegar a respuestas m\u00e1s creativas. Es precisamente esta creatividad humana e inteligencia de reba\u00f1o<\/strong> lo que buscamos explotar con Genigma. <\/p>\n\n\n\n

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Cu\u00e9ntanos un poco m\u00e1s sobre Genigma, \u00bfc\u00f3mo se juega?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

En Genigma hay 4 clanes que se enfrentan semanalmente<\/strong> para ser quienes m\u00e1s datos aporten a la ciencia. El objetivo es solucionar diferentes rompecabezas ordenando las piezas (que son fragmentos de ADN) para conseguir la m\u00e1xima puntuaci\u00f3n y enviar estos datos al equipo cient\u00edfico. <\/p>\n\n\n\n

Adem\u00e1s, en el juego existen una serie de herramientas virtuales que pueden ayudar a conseguir esta m\u00e1xima puntuaci\u00f3n y, como recompensa, se pueden ir coleccionando cromos de ciencia. <\/p>\n\n\n\n

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El objetivo del juego es solucionar diferentes rompecabezas ordenando las piezas, que son fragmentos de ADN<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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\u00bfEn qu\u00e9 consiste el #GenigmaChallenge?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Genigma se lanz\u00f3 el 27 de enero como un experimento. Entonces planteamos un reto colectivo, el #GenigmaChallenge<\/strong>: conseguir en 90 d\u00edas<\/strong> los datos necesarios para descifrar el mapa gen\u00f3mico de referencia de la l\u00ednea celular T47D del c\u00e1ncer de mama<\/a>. Para ello son necesarias 30.000 jugadores y jugadoras<\/strong> que hagan un m\u00ednimo de 50 partidas <\/strong>cada una. <\/p>\n\n\n\n

Cada semana, el equipo cient\u00edfico introduce nuevos rompecabezas para que los jugadores los vayan resolviendo. Si consigui\u00e9semos cerrar el mapa gen\u00f3mico de este c\u00e1ncer, podr\u00edamos plantearnos meter otras l\u00edneas celulares<\/a> de otros tipos de c\u00e1ncer. Es decir, si el experimento funciona, puede ser exportable a otros tipos de datos.<\/strong> <\/p>\n\n\n\n

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\u00bfC\u00f3mo de presente est\u00e1 la ciencia en Genigma?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Aqu\u00ed tuvimos un gran dilema y se discuti\u00f3 un mont\u00f3n qu\u00e9 hacer. Pero al final decidimos hacer un juego que pudiese llegar a cualquier tipo p\u00fablico<\/strong>, les interesara a priori la ciencia, o no.<\/p>\n\n\n\n

Por esto, y como nos sugirieron varias personas que participaron en las co-creaciones del principio, la parte de ciencia se ha introducido en forma de cromos acumulables (hay m\u00e1s de 200)<\/strong> que explican algunos conceptos relacionados con el genoma<\/a>, el c\u00e1ncer <\/a>y la ciencia abierta<\/a> y aportan tambi\u00e9n datos curiosos. Igualmente, proporcionamos semanalmente informaci\u00f3n de los resultados parciales obtenidos de los cromosomas que se est\u00e1n analizando, con un pop-up y un link a una p\u00e1gina web<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Esta semana tambi\u00e9n hemos presentado una gu\u00eda did\u00e1ctica<\/a> con material exclusivo de ciencia, creado para involucrar <\/strong>en el #GenigmaChallenge a profesores y alumnos de institutos<\/strong>. <\/p>\n\n\n\n

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\u00bfQu\u00e9 esperabais conseguir con el proyecto?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

M\u00e1s all\u00e1 de obtener los datos que nos ayuden a crear el mapa del genoma del c\u00e1ncer de mama, otro de los objetivos era conseguir dar a conocer la ciencia ciudadana<\/a> como metodolog\u00eda<\/strong>, tambi\u00e9n a otros equipos cient\u00edficos. Hacer saber a las personas que hay maneras de participar en una investigaci\u00f3n dedicando parte de su tiempo y su conocimiento a proyectos reales<\/strong>. Y hacer ver a los equipos cient\u00edficos que es posible crear proyectos colaborativos, tambi\u00e9n en disciplinas como la ciencia b\u00e1sica.<\/p>\n\n\n\n

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\u00a1Y lo hab\u00e9is conseguido!<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Obviamente ten\u00edamos la esperanza de que el juego gustase, pero no preve\u00edamos esta respuesta. Est\u00e1 teniendo una acogida incre\u00edble. A un mes del lanzamiento m\u00e1s de 30.000 personas se han descargado la app<\/strong> y est\u00e1n jugando en m\u00e1s de 130 pa\u00edses <\/strong>del mundo.  En las primeras semanas ya se ha resuelto el 100% de 2 cromosomas<\/strong> y seguimos avanzando d\u00eda a d\u00eda para alcanzar el reto.<\/p>\n\n\n\n

Es muy bonito ver c\u00f3mo el juego ha conseguido atraer la atenci\u00f3n de muchas personas y ver que hay ganas de formar parte de una comunidad que colabora por una misma causa.<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfCrees que son necesarios m\u00e1s proyectos de ciencia ciudadana?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

\u00a1Desde luego que s\u00ed! Este tipo de proyectos aportan un gran valor a la relaci\u00f3n entre ciencia y ciudadan\u00eda<\/a>. Se puede conseguir que desde la ciencia se trabaje de una manera m\u00e1s horizontal escuchando las necesidades de la sociedad y que la ciudadan\u00eda sea parte del proyecto<\/a>. Si esta relaci\u00f3n es honesta y bien trabajada, consigue crear esta conexi\u00f3n con la ciencia real y actual y expandirla.<\/p>\n\n\n\n

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\u201cLa ciencia ciudadana rompe todos los esquemas: te permite llegar m\u00e1s all\u00e1, no solo a nivel de big data, sino tambi\u00e9n mental. Implica otra forma de trabajar teniendo en cuenta que el tiempo y el valor que las personas aportan es algo que no se puede conseguir encerrado en un laboratorio\u201d<\/p>

Elisabetta Broglio<\/strong><\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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\u00bfQu\u00e9 consejo le dar\u00edas a alguien que quiera comenzar un proyecto de ciencia ciudadana?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Que se busque un buen equipo<\/a> <\/strong>multidisciplinar<\/strong> <\/a>con personas que tengan habilidades complementarias y visiones diferentes<\/strong> y que se arme de mucha paciencia porque es un proceso largo. Y esto es un punto cr\u00edtico. Hay que conseguir financiaci\u00f3n paralela que ayude a mantener el proyecto en el tiempo. <\/p>\n\n\n\n

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Parte del gran equipo creador del juego Genigma<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
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Los proyectos tienen gestaci\u00f3n larga y la primera financiaci\u00f3n siempre se acaba en alg\u00fan momento. La rotaci\u00f3n natural de la ciencia conlleva adem\u00e1s que los postdocs se muevan: de hecho, Marco y Juan ya no est\u00e1n en el CNAG y, aunque siguen muy activos en el equipo cient\u00edfico de Genigma, hay nuevas personas que se han incorporados y se necesitan nuevas f\u00f3rmulas para la sostenibilidad del proyecto. Hemos tardado m\u00e1s de 2 a\u00f1os en crear el juego de Genigma, y ahora que est\u00e1 ah\u00ed fuera \u00a1hay que mantenerlo!  <\/p>\n\n\n\n

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\u00bfQu\u00e9 es lo que m\u00e1s te ha sorprendido de Genigma?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Me ha sorprendido muy positivamente el cambio que ha experimentado el equipo cient\u00edfico<\/a> durante todo el proceso creativo. Era su primer proyecto de ciencia ciudadana y juntos hemos aprendido much\u00edsimo y estamos colaborando de forma transversal disipando las barreras entre disciplinas<\/strong>. Ha habido tambi\u00e9n una implicaci\u00f3n muy especial de los equipos de profesionales contratados, que ha ido mucho m\u00e1s all\u00e1 de lo estipulado, por tratarse de un proyecto de este estilo.<\/p>\n\n\n\n

Tambi\u00e9n me ha sorprendido ver c\u00f3mo hemos superado fronteras geogr\u00e1ficas <\/strong>gracias al importante esfuerzo que estamos haciendo en la comunicaci\u00f3n del proyecto <\/strong>y de los resultados preliminares. Y, por supuesto, estoy abrumada por la respuesta, la complicidad y el esfuerzo de todos los participantes en las primeras fases y de quienes se han apuntado ahora a jugar. \u00a1Ojal\u00e1 a finales de abril, podamos anunciar que tenemos todos los datos necesarios para construir el mapa gen\u00f3mico de referencia del c\u00e1ncer de mama y que los hemos obtenido de forma colectiva con personas de todo el mundo!<\/p>\n\n\n\n

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\u201cTener el mapa de referencia del c\u00e1ncer de mama nos ayudar\u00eda a tener m\u00e1s informaci\u00f3n para identificar nuevas dianas y terapias para ayudar a los pacientes en el futuro\u201d<\/p>

Roni Wright<\/strong>, investigadora del c\u00e1ncer de mama utilizando la l\u00ednea celular T47D<\/p><\/blockquote>\n\n\n