{"id":27929,"date":"2022-02-15T17:19:31","date_gmt":"2022-02-15T16:19:31","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=27929"},"modified":"2022-03-04T10:07:06","modified_gmt":"2022-03-04T09:07:06","slug":"investigadores-del-prbb-secuenciaran-el-genoma-de-cuatro-especies-endemicas-por-el-proyecto-del-biogenoma-de-la-tierra","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/investigadores-del-prbb-secuenciaran-el-genoma-de-cuatro-especies-endemicas-por-el-proyecto-del-biogenoma-de-la-tierra\/","title":{"rendered":"Investigadores del PRBB secuenciar\u00e1n el genoma de cuatro especies end\u00e9micas por el Proyecto del BioGenoma de la Tierra"},"content":{"rendered":"\n

En noviembre de 2018, la comunidad cient\u00edfica dio el pistoletazo de salida de uno de los proyectos m\u00e1s ambiciosos del momento con el nacimiento del Proyecto del BioGenoma de la Tierra<\/a> (EBP por sus siglas en ingl\u00e9s). Este proyecto es un esfuerzo coordinado con personal investigador de todo el mundo con la ambici\u00f3n de secuenciar el genoma del 1,5 millones de especies eucariotas que se estima que habitan en el planeta Tierra<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

Dos a\u00f1os despu\u00e9s, el Proyecto del BioGenoma de la Tierra ha terminado su fase piloto y comienza la producci\u00f3n a gran escala<\/strong>. Un hito que esperan conseguir gracias a la colaboraci\u00f3n de los proyectos afiliados.
En el territorio de habla catalana, contamos con la Iniciativa Catalana por el<\/strong> BioGenoma de la Tierra<\/strong><\/a>, uno de estos proyectos afiliados impulsado por la Sociedad Catalana de Biolog\u00eda <\/a>que, por segundo a\u00f1o consecutivo, financia la producci\u00f3n de genomas de alta calidad en el territorio<\/strong>. Y, en esta segunda ronda, la Iniciativa Catalana del EBP ha becado tres proyectos que salen del Parque de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica de Barcelona (PRBB)<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

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El proyecto del BioGenoma de la Tierra quiere secuenciar el genoma del 1,5 millones de especies eucariotas que se estima que habitan en el planeta.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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Reptiles de altura<\/h3>\n\n\n\n

La lagartija pallaresa<\/strong> (Iberolacerta aurelioi<\/em>), es una de las ocho lagartijas del g\u00e9nero Iberolacerta que habitan en la pen\u00ednsula Ib\u00e9rica. Concretamente, la encontramos en canchales de alta monta\u00f1a, por encima de los 2000m<\/strong>, en una reducida isla de monta\u00f1as del este de los Pirineos<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

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Lagartija pallaresa (Iberolacerta aurelioi). Cr\u00e9dito: Salvador Carranza, IBE.<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
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En Catalu\u00f1a, esta especie en peligro de extinci\u00f3n habita \u00edntegramente en el parque natural del Alt Pirineu<\/a>. Y gracias a los esfuerzos de conservaci\u00f3n de la fauna y la flora del parque, este reptil es una especie emblem\u00e1tica<\/strong> de la regi\u00f3n. Esta es una lagartija robusta <\/strong>y tiene un ciclo vital marcado por un largo per\u00edodo de hibernaci\u00f3n<\/strong>. Por eso, cuando llega mayo come, engorda, pone huevos y hace crecer a las cr\u00edas antes de volver a hibernar a finales de septiembre.<\/p>\n\n\n\n

Pero aparte de su ciclo de vida peculiar, la lagartija pallaresa tiene muchas similitudes con la lagartija ar\u00e1nica<\/strong> (Iberolacerta aranica<\/em>) y la lagartija pirenaica<\/strong> (Iberolacerta bonnali<\/em>), de la que se separ\u00f3 hace pocos miles de a\u00f1os. Y esta voluntad de conocer las relaciones evolutivas<\/a><\/strong> entre estas tres lagartijas ha hecho que el grupo de investigaci\u00f3n en sistem\u00e1tica, biogeograf\u00eda y evoluci\u00f3n de los reptiles y anfibios<\/a> del Instituto de Biolog\u00eda Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a> liderado por el Salvador Carranza<\/a><\/strong>, se haya fijado en este reptil emblem\u00e1tico.<\/p>\n\n\n\n

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Un coral desubicado<\/h3>\n\n\n\n

Los arrecifes <\/strong>marinos son estructuras f\u00edsicas <\/strong>generadas por seres vivos que protegen el litoral y son puntos con una elevada riqueza de diversidad<\/strong>. Aunque la mayor\u00eda de arrecifes marinos est\u00e1n formados por corales<\/a>, en el Mediterr\u00e1neo la mayor\u00eda de ellos provienen estructuras calc\u00e1reas producidas por algunas algas o esponjas.<\/strong> Sin embargo, en la costa del Pa\u00eds Valenciano, en las islas Columbretes, tenemos una especie singular: Cladocora caespitosa<\/em><\/strong>, que es el \u00fanico coral que forma arrecifes en nuestras costas<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

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Cladocora caespitosa. Cr\u00e9dito: Diego Kersting, IBE.<\/em><\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
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Pero Cladocora <\/em>tiene otras caracter\u00edsticas que la hacen especial. Y es que, a diferencia de la mayor\u00eda de corales, retiene a las especies que viven en simbiosis en su interior. Por eso, cuando se dan circunstancias ambientales adversas, como podr\u00eda ser un aumento de temperaturas repentino, los simbiontes no pueden salir y mueren con el hu\u00e9sped.<\/p>\n\n\n\n

Por todo ello, el grupo de ecolog\u00eda microbiana y evoluci\u00f3n<\/a> del Instituto de Biolog\u00eda Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a>, liderado por Javier del Campo<\/a><\/strong> se ha fijado en ella. Adem\u00e1s, Cladocora <\/em>es una especie en peligro de extinci\u00f3n. Por eso es necesario \u201ctener informaci\u00f3n gen\u00f3mica de calidad<\/strong> lo antes posible para generar herramientas \u00fatiles para su conservaci\u00f3n y preservaci\u00f3n<\/strong>\u201d.<\/p>\n\n\n\n

El equipo liderado por del Campo, espera que este genoma les ayude a estudiar el efecto del cambio clim\u00e1tico<\/a> en la expresi\u00f3n de los genes de este coral.<\/p>\n\n\n\n

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Una esponja rara y un cten\u00f3foro invasor<\/h3>\n\n\n\n

\u201cLas esponjas <\/strong>son animales poco emblem\u00e1ticos<\/strong>, ya menudo no tenemos demasiada informaci\u00f3n<\/strong>. Y de las esponjas calc\u00e1reas, \u00a1menos!\u201d. As\u00ed es como Arnau Seb\u00e9-Pedr\u00f3s, jefe del grupo de gen\u00f3mica de c\u00e9lula \u00fanica y evoluci\u00f3n<\/a> del Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a> presenta Clarthrina clathrus<\/strong><\/em>, una esponja caliza <\/strong>que habita las aguas del Atl\u00e1ntico y el Mediterr\u00e1neo.<\/p>\n\n\n\n

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Clarthrina clathrus<\/em>. Cr\u00e8dit: Wikicommons.<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
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\u201cLas esponjas calc\u00e1reas y el resto de las esponjas se parecen tanto entre ellas como podemos parecernos una Drosophila <\/em>y un humano<\/strong>\u201d, explica Seb\u00e9-Padr\u00f3s. Por eso generar un genoma de calidad de Clarthrina<\/em>, permitir\u00e1 tener un genoma de referencia \u201cde proximidad\u201d<\/strong> del linaje para estudiar los tipos celulares<\/strong> que tienen<\/strong>, como es su biolog\u00eda celular y molecular y su evoluci\u00f3n. Para ello, trabajan con la bi\u00f3loga experta en esponjas, Ana Riesgo<\/a><\/strong>, con la que han ido a Blanes a recolectar la esponja. <\/p>\n\n\n\n

Estudiar estos organismos singulares, que evolutivamente nos quedan muy lejos, hace que podamos descubrir <\/strong>nuevas v\u00edas metab\u00f3licas<\/strong> o mol\u00e9culas <\/strong>de las que podemos sacar provecho, como es el caso del a<\/a>ntitumoral citarabina<\/a><\/strong>, descubierto en una esponja marina.<\/p>\n\n\n\n

Pero Arnau tambi\u00e9n quiere secuenciar el genoma de una especie muy abundante. El cten\u00f3foro Mnemiopsis leidyi<\/strong><\/em>, una especie invasora en el Mediterr\u00e1neo <\/strong>que crece desmesuradamente en determinadas condiciones. \u00abEn las bah\u00edas interiores del delta del Ebro cuando hay un repentino crecimiento de Mnemiopsis leidyi dicen que hay ‘mala agua’, porque el agua se vuelve densa\u00bb, explica Seb\u00e9-Padr\u00f3s.<\/p>\n\n\n\n

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Mnemiopsis leidyi. Cr\u00e9dito: Wikicommons.<\/em><\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
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Y es que \u00ablos cten\u00f3foros son como las medusas, que cuanto m\u00e1s degradados est\u00e1n los oc\u00e9anos, mejor les va<\/strong>\u00ab. El estudio de su genoma <\/strong>permitir\u00e1 contar <\/strong>su crecimiento <\/strong>y ayudar\u00e1 a entender <\/strong>mejor el desarrollo animal y el origen de las neuronas<\/a><\/strong>. Por eso Arnau quiere secuenciar el genoma. Aunque no ser\u00e1 el primero, espera mejorar la calidad del genoma original que se secuenci\u00f3 hace 10 a\u00f1os.<\/p>\n\n\n\n

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El cambio clim\u00e1tico, la gran amenaza<\/h3>\n\n\n\n

Aunque parezca que estas cuatro especies no tienen nada en com\u00fan, la crisis clim\u00e1tica est\u00e1 condicionando su presencia en el medio<\/strong>. Aunque la \u00fanica especie que sale beneficiada, es Mnemiopsis leidyi<\/em>.<\/p>\n\n\n\n

En general, \u00abel cambio clim\u00e1tico compromete las condiciones ideales del desarrollo de los organismos<\/strong><\/a>\u00ab, explica del Campo. Y las especies marinas s\u00e9siles (que viven enganchadas al fondo marino y no pueden escaparse a nado), como los corales y las esponjas, est\u00e1n m\u00e1s amenazadas. Seg\u00fan el bi\u00f3logo, \u201cel cambio clim\u00e1tico<\/strong> causa un aumento de la temperatura del agua<\/strong>, pero tambi\u00e9n favorece la proliferaci\u00f3n de pat\u00f3genos causantes de enfermedades emergentes<\/strong>. Todo ello, altera el <\/strong>microbioma<\/strong> <\/a>de los organismos marinos, compromete su sistema inmunitario<\/strong> y acaba amenazando a especies como el n\u00e1car mediterr\u00e1neo que est\u00e1 en peligro cr\u00edtico de extinci\u00f3n desde 2016\u201d.<\/p>\n\n\n\n

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El cambio clim\u00e1tico causa un aumento de la temperatura del agua y favorece la proliferaci\u00f3n de pat\u00f3genos causantes de enfermedades emergentes.<\/p>Javier del Campo<\/strong>, investigador principal del IBE.<\/cite><\/blockquote>\n\n\n\n

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En alta monta\u00f1a, el aumento de temperaturas aumenta la competencia entre especias. La lagartija roquera<\/strong> (Podarcis muralis<\/em>), que tiene un ciclo de vida m\u00e1s largo que la lagartija pallaresa y habita en las zonas bajas de todo el Pirineo, ha ampliado su distribuci\u00f3n<\/strong>. \u00abLos \u00faltimos muestreos hemos visto la gartija roquera a 2000m – donde vive la pallaresa -, en zonas donde no la hab\u00edamos visto nunca\u00bb, explica Salvador Carranza. Y aunque, a d\u00eda de hoy, ambas especies todav\u00eda no competin<\/strong>, est\u00e1n separadas por algo m\u00e1s de 100m.<\/p>\n\n\n\n

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El proyecto del BioGenoma Catal\u00e0<\/h3>\n\n\n\n

Sea para hacer frente a la crisis clim\u00e1tica o para entender la evoluci\u00f3n de las especies, tener nuevos genomas va a generar nuevos conocimientos<\/strong>. Lo que seg\u00fan del Campo \u201cya tiene valor, por s\u00e9. Y es que lo que hoy no sabes para qu\u00e9 sirve, ma\u00f1ana puede ser crucial para salir de una pandemia<\/strong>\u201d, explica. Este conocimiento ser\u00e1 muy valioso para profesionales como Salvador Carranza que a pesar de conocer la biolog\u00eda, la ecolog\u00eda, la taxonom\u00eda y fisiolog\u00eda de algunas especies, hace a\u00f1os que le quedan preguntas por responder<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

Adem\u00e1s, la iniciativa catalana, ha unido a dos comunidades de personal investigador que no siempre cohabitaban<\/strong>. \u00abNos encontramos gente del museo de historia natural y del instituto bot\u00e1nico con gente que hacemos estudios gen\u00f3micos y se est\u00e1n generando nuevas redes de colaboraci\u00f3n que valen mucho la pena\u00bb, explica Arnau Seb\u00e9-Padr\u00f3s.<\/p>\n\n\n\n

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Nos encontramos gente del museo de historia natural con gente que realizamos estudios gen\u00f3micos y surgen colaboraciones que valen mucho la pena.<\/p>Arnau Seb\u00e9-Padr\u00f3s, jefe de grupo en el CRG.<\/strong><\/cite><\/blockquote>\n\n\n\n

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Esta iniciativa local \u00abpone el foco <\/strong>en especies end\u00e9micas<\/strong> del sur de Europa que no ser\u00edan estudiadas por ninguna iniciativa mundial<\/strong>\u00ab, apunta Seb\u00e9-Padr\u00f3s. Y \u00abposiciona el sur de europa en proyectos de investigaci\u00f3n de alcance mundial<\/strong>\u00ab. Y es que, a menor escala, equipara el Catalan BioGenome project con proyectos ambiciosos como el Darwin tree of life del Reino Unido.<\/p>\n\n\n\n

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La iniciativa Catalana por el Proyecto del BioGenoma de la Tierra ha reconocido los proyectos presentados por Salvador Carranza y Javier del Campo del IBE y Arnau Seb\u00e9 del CRG.<\/p>\n","protected":false},"author":27,"featured_media":27874,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[31,27],"tags":[260,266,284,707,212],"new-type":[39,44],"class_list":["post-27929","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia-y-sociedad","category-investigacion","tag-biodiversidad","tag-crg-es","tag-evolucion","tag-genomica-es","tag-ibe-csic-upf-es","new-type-a-fondo","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/27929","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/27"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=27929"}],"version-history":[{"count":14,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/27929\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":27957,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/27929\/revisions\/27957"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/27874"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=27929"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=27929"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=27929"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=27929"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}