{"id":26645,"date":"2021-12-09T18:07:59","date_gmt":"2021-12-09T17:07:59","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=26645"},"modified":"2022-03-02T14:20:03","modified_gmt":"2022-03-02T13:20:03","slug":"seqera-labs-un-recorrido-fructifero-de-la-investigacion-basica-a-la-creacion-de-una-empresa","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/seqera-labs-un-recorrido-fructifero-de-la-investigacion-basica-a-la-creacion-de-una-empresa\/","title":{"rendered":"Seqera Labs: un recorrido fruct\u00edfero de la investigaci\u00f3n b\u00e1sica a la creaci\u00f3n de una empresa"},"content":{"rendered":"\n

Los estudios de biociencias y salud se basan cada vez m\u00e1s en decisiones tomadas a partir de datos complejos<\/strong>. Progresivamente, los datos de secuenciaci\u00f3n, las im\u00e1genes de alta resoluci\u00f3n o los registros m\u00e9dicos complejos se analizan mediante algoritmos para encontrar los mejores resultados. Adem\u00e1s, las soluciones en la nube son cada vez m\u00e1s populares para almacenar grandes cantidades de datos<\/strong>. Por eso, en este entorno biol\u00f3gico donde habitan las TIC, las soluciones que permiten a los y las investigadoras simplificar el an\u00e1lisis de sus datos complejos, son cada vez m\u00e1s populares.<\/p>\n\n\n\n

Seqera Labs<\/a><\/strong> es una plataforma de flujo de trabajo y orquestaci\u00f3n de datos<\/strong> con sede en Barcelona que permite al personal investigador analizar grandes cantidades de datos biol\u00f3gicos de una forma sencilla, segura, r\u00e1pida y colaborativa. La empresa, que sali\u00f3 del Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a>, acaba de recaudar 5,5 millones de d\u00f3lares en financiaci\u00f3n y planea ampliar su presencia en Norteam\u00e9rica.<\/p>\n\n\n\n

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Una empresa que sali\u00f3 del laboratorio<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

En 2010, los investigadores del grupo de investigaci\u00f3n en bioinform\u00e1tica y gen\u00f3mica del CRG, Paolo Di Tommaso<\/strong> y m\u00e1s tarde Evan Floden<\/strong>, junto con su supervisor, Cedric Notredame<\/strong>, empezaron a discutir las posibilidades de simplificar la compilaci\u00f3n y el an\u00e1lisis de datos en la nube de una forma f\u00e1cil y colaborativa<\/strong>. Tres a\u00f1os m\u00e1s tarde, Nextflow<\/a> se public\u00f3 como c\u00f3digo abierto<\/strong> y pronto surgi\u00f3 una peque\u00f1a comunidad de usuarios. <\/p>\n\n\n\n

Una d\u00e9cada m\u00e1s tarde, Nextflow cuenta con m\u00e1s de 10.000 usuarios en todo el mundo<\/strong>. \u00abMantenemos la tecnolog\u00eda sin restricciones<\/strong> porque creemos en el acceso abierto<\/a><\/strong> y eso es lo que permite que la gente nos conozca\u00bb, dice Di Tommaso. Asimismo, tambi\u00e9n han creado Seqera<\/strong><\/a> para facilitar la gesti\u00f3n y control de datos de los flujos de trabajo de Nextflow para organizaciones<\/strong>. Actualmente, Seqera ya ofrece software comercial a 40 organizaciones entre hospitales, empresas farmac\u00e9uticas y start-ups biom\u00e9dicas de Europa y Estados Unidos. <\/p>\n\n\n\n

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Nextflow es libre y de acceso abierto, mientras que Seqera es una empresa que naci\u00f3 para facilitar a las organizaciones la gesti\u00f3n y control de datos de los flujos de trabajo de Nextflow.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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La nube: la clave para garantizar la seguridad y la viabilidad econ\u00f3mica<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Una de las principales ventajas de Seqera es que permite a los usuarios realizar los an\u00e1lisis en la nube<\/strong>. De esta forma, se reduce el coste del an\u00e1lisis<\/strong> mientras los datos se mantienen en un entorno seguro<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

Con este sistema basado en la nube, son capaces de analizar grandes cantidades de datos, principalmente datos de secuenciaci\u00f3n<\/strong>. Ayudan a los usuarios a realizar an\u00e1lisis variados como la vigilancia de pat\u00f3genos<\/strong>, el desarrollo de inmunoterapias personalizadas<\/strong> o la generaci\u00f3n de vacunas o tratamientos personalizados<\/strong> basados \u200b\u200ben datos de secuenciaci\u00f3n de individuos, mientras que a la vez asisten a instituciones de investigaci\u00f3n tradicionales como SciLifeLab<\/a>, QBic o el Instituto Sanger<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

\u201cNuestro software b\u00e1sico, Nextflow, es realmente abierto y crece por s\u00ed mismo<\/strong>. Un buen ejemplo es la adaptaci\u00f3n que ha realizado el consorcio COVID del Reino Unido<\/a> que ha analizado la secuencia SARS-Cov-2 en muestras de aproximadamente el 10% de la poblaci\u00f3n del Reino Unido con COVID19. Esto ha dado lugar a la identificaci\u00f3n de las variantes alfa y delta y se ha replicado en todo el mundo<\/strong>\u201d, explica Floden.<\/p>\n\n\n\n

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\u00abNextflow ha sido utilizado por el consorcio COVID del Reino Unido para analizar la secuencia SARS-Cov-2 en el 10% de la poblaci\u00f3n del Reino Unido con COVID19, ayudando a la identificaci\u00f3n de las variantes alfa y delta\u00bb
Evan Floden<\/strong> (CEO y co-fundador de Seqera)<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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Un futuro prometedor<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Este oto\u00f1o, Seqera recaud\u00f3 5,5 millones de d\u00f3lares en financiaci\u00f3n<\/strong> de Talis Capital<\/a>, Speedinvest<\/a>, BoxOne Ventures<\/a> y una subvenci\u00f3n de la Chan Zuckerberg Initiative<\/a>. \u201cEste es un hito importante<\/strong> en lo que respecta a nuestra capacidad de crecimiento<\/strong>. Hace 18 meses, s\u00f3lo \u00e9ramos dos personas. Ahora, tenemos un equipo de 20 personas que incluye ingenieros, arquitectos de soluciones, personal de ventas y desarrolladores, y esperamos volver a duplicar el equipo antes de finales del pr\u00f3ximo a\u00f1o\u201d, se\u00f1ala Floden.<\/p>\n\n\n\n

Sin embargo, fundar una empresa<\/a> va m\u00e1s all\u00e1 de su crecimiento. \u201cGestionar una empresa es completamente distinto a la investigaci\u00f3n b\u00e1sica<\/strong>. Mirando hacia atr\u00e1s, hemos aprendido un mont\u00f3n de cosas; desde familiarizarnos con el vocabulario empresarial hasta gestionar un proceso de recaudaci\u00f3n de fondos o contratar a un equipo de ventas. Y todav\u00eda nos queda mucho por aprender para llevar la empresa m\u00e1s all\u00e1\u201d, dice Di Tommaso.  <\/p>\n\n\n\n

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La necesidad de disponer de una herramienta de an\u00e1lisis llev\u00f3 a los investigadores a producir un software revolucionario que se ha convertido en una exitosa empresa de inform\u00e1tica en la nube.<\/p>\n","protected":false},"author":26,"featured_media":26631,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[33],"tags":[266,707,728,655,618,590],"new-type":[39,44],"class_list":["post-26645","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-vida-cientifica-es","tag-crg-es","tag-genomica-es","tag-innovacion","tag-secuenciacion","tag-somosprbb","tag-tecnologia-es","new-type-a-fondo","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/26645","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/26"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=26645"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/26645\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":27898,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/26645\/revisions\/27898"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/26631"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=26645"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=26645"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=26645"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=26645"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}