{"id":25937,"date":"2021-10-29T12:10:45","date_gmt":"2021-10-29T10:10:45","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=25937"},"modified":"2021-10-29T13:40:14","modified_gmt":"2021-10-29T11:40:14","slug":"nace-durante-el-confinamiento-una-nueva-herramienta-para-analizar-imagenes-de-organoides","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/nace-durante-el-confinamiento-una-nueva-herramienta-para-analizar-imagenes-de-organoides\/","title":{"rendered":"Nace durante el confinamiento una nueva herramienta para analizar im\u00e1genes de organoides"},"content":{"rendered":"\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Cuando <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/la-vida-cientifica-en-plena-pandemia-por-coronavirus\/\" target=\"_blank\">el laboratorio tuvo que cerrar a causa de la pandemia de la Covid-19<\/a>, el cerebro de dos investigadores del <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/vikas-trivedi-embl-queremos-entender-como-las-celulas-forman-un-embrion-construyendo-uno-nosotros\/\" target=\"_blank\">laboratorio de Vikas Trivedi<\/a> en el <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/www.embl.es\/\" target=\"_blank\">Laboratorio Europeo de Biolog\u00eda Molecular \u2013 Barcelona (EMBL Barcelona)<\/a> empezaron a pensar en la mejor manera de aprovechar el tiempo.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">\u00abDecidimos utilizar ese momento para <strong>analizar la gran cantidad de im\u00e1genes de organoides<\/strong> que ten\u00edamos de nuestros experimentos anteriores\u00bb, dice <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/www.embl.org\/people\/person\/b1fa4346f56c5c63b71f229a06c31a14ff5d6f06a49f0de248f4f61b8b440573\/\" target=\"_blank\">Nicola Gritti<\/a>, investigador postdoctoral en el laboratorio. \u00abY necesit\u00e1bamos una herramienta para tener una visi\u00f3n gr\u00e1fica de los resultados biol\u00f3gicos y compartirlos f\u00e1cilmente entre nosotros\u00bb, a\u00f1ade la estudiante de doctorado <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/www.embl.org\/people\/person\/8befb8e9f42b16f49c0b6ea0c9ec800aaba64dc9573f29a3d9749bdd0e31a3e3\/\" target=\"_blank\">Jia Le Lim<\/a>.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">As\u00ed es como, <strong>durante el confinamiento<\/strong>, los dos compa\u00f1eros del laboratorio Trivedi <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/www.embl.org\/news\/science\/morgana-organoids-and-machine-learning\/\" target=\"_blank\">desarrollaron <strong>MOrgAna<\/strong><\/a>, un <strong>software de c\u00f3digo abierto<\/strong> que utiliza el <strong>aprendizaje autom\u00e1tico (<em>machine learning<\/em><\/strong>) para analizar im\u00e1genes de organoides y extraer los componentes celulares de una imagen.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">MOrgAna es gratuito y f\u00e1cil de usar por cualquier persona, incluso sin experiencia en programaci\u00f3n; es modular, abierto y colaborativo, por lo que se puede personalizar e integrar en otras <em>pipelines <\/em>de an\u00e1lisis de im\u00e1genes. Puede analizar distintos tipos de im\u00e1genes tomadas con varios microscopios. Y gracias la utilizaci\u00f3n del aprendizaje autom\u00e1tico, MOrgAna <strong>funciona mejor que otras herramientas similares existentes<\/strong>. Es capaz de capturar caracter\u00edsticas morfol\u00f3gicas complejas de los organoides, aprendiendo a clasificar los p\u00edxeles de una imagen seg\u00fan pertenezcan al fondo, al organoide o al contorno del organoide.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Investigadores del EMBL Barcelona aprovecharon al m\u00e1ximo el confinamiento forzado por la Covid-19, desarrollando una herramienta para analizar im\u00e1genes de organoides mediante el aprendizaje autom\u00e1tico.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":25782,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[27],"tags":[262,722,280,562],"new-type":[44],"class_list":["post-25937","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-investigacion","tag-bioinformatica-es","tag-coronavirus-es","tag-embl-barcelona-es","tag-organoides","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/25937","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=25937"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/25937\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":25954,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/25937\/revisions\/25954"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/25782"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=25937"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=25937"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=25937"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=25937"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}