<\/p>\n\n\n\n
Cada vez m\u00e1s, la comunidad cient\u00edfica tiene claro que para avanzar hay que trabajar en equipo<\/a>. Por ello, y para alcanzar el ambicioso objetivo de secuenciar el genoma de todas las especies eucariotas que habitan el planeta Tierra<\/strong>, se ha gestado el Proyecto del Biogenoma de la Tierra<\/strong> <\/a>(EBP por sus siglas en ingl\u00e9s).<\/p>\n\n\n\n \u00abEs un proyecto paraguas que agrupa diversos nodos de trabajo que, con una orientaci\u00f3n taxon\u00f3mica<\/strong> o geogr\u00e1fica<\/strong>, pretenden obtener genomas de alta calidad<\/strong> de las diferentes especies que habitan el planeta\u00bb, explica Roderic Guig\u00f3<\/strong>, jefe del grupo de biolog\u00eda computacional del procesamiento del ARN, coordinador del programa de bioinform\u00e1tica en el Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a> y catedr\u00e1tico del Departamento de Ciencias Experimentales y de la Salud, Universidad Pompeu Fabra (DCEXS-UPF)<\/a>.<\/p>\n\n\n\n Efectivamente, dentro del EBP se integran varios proyectos o nodos de trabajo<\/strong> que se organizan a peque\u00f1a o gran escala y aportan financiaci\u00f3n<\/strong>. Estos pueden estar enfocados en:<\/p>\n\n\n\n Adem\u00e1s, el EBP pretende \u00abestablecer una manera de trabajar<\/strong> para que todos los genomas tengan unos mismos est\u00e1ndares de calidad\u00bb, explica Rosa Fern\u00e1ndez<\/strong>, jefa del laboratorio de filogen\u00f3mica de los metazoos del Instituto de Biolog\u00eda Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a>.<\/p>\n\n\n\n El Proyecto del Biogenoma de la Tierra nace con tres objetivos claros<\/p>\n\n\n\n Pero los investigadores a\u00fan ven m\u00e1s ventajas. \u00abNos permitir\u00e1 aprender <\/strong>mucho\u00bb, explica Rosa Fern\u00e1ndez con emoci\u00f3n. Durante muchos a\u00f1os, \u00abla gen\u00e9tica ha desarrollado un mont\u00f3n de t\u00e9cnicas para estudiar en profundidad<\/strong> las especies que generan m\u00e1s inter\u00e9s: los organismos modelo<\/a> y los vertebrados<\/strong>\u00ab. Y ahora ha llegado el \u00abmomento de aplicar todas estas herramientas a otras especies<\/strong>\u00ab, dice la bi\u00f3loga evolutiva.<\/p>\n\n\n\n Seg\u00fan Fern\u00e1ndez, desconocemos muchas especies que son clave para el mantenimiento de los ecosistemas<\/strong>, como los gusanos de tierra, s\u00f3lo porque \u00abson poco atractivos para el p\u00fablico general <\/strong>y pocos cient\u00edficos trabajan con ellos.\u00bb<\/p>\n\n\n\n Ha llegado el momento de aplicar las herramientas y t\u00e9cnicas gen\u00e9ticas que se han desarrollado en los \u00faltimos a\u00f1os en otras especies, m\u00e1s all\u00e1 de los organismos modelo y los vertebrados. Este a\u00f1o, el grupo de filogen\u00f3mica de los metazoos que lidera Rosa Fern\u00e1ndez, ha conseguido una de las ocho becas que ha convocado la Sociedad Catalana de Biolog\u00eda<\/a> para impulsar el proyecto del biogenoma catal\u00e1n<\/strong><\/a>, una iniciativa de orientaci\u00f3n geogr\u00e1fica, que pretende secuenciar todas las especies eucariotas de Catalunya<\/strong> y los pa\u00edses catalanes. Con esta ayuda, podr\u00e1n secuenciar el genoma de Norana najaformis<\/em>, \u00abuna especie de lombriz gigante<\/strong> que tiene una distribuci\u00f3n muy reducida en Catalu\u00f1a en la zona del Ordal<\/strong>\u00ab, explica la directora.<\/p>\n\n\n\n A d\u00eda de hoy, en la iniciativa catalana \u00abtrabajan activamente institutos en Valencia, el principado, Catalu\u00f1a norte, Andorra y Mallorca\u00bb, explica Roderic Guig\u00f3. Y es que la acogida del proyecto en el territorio ha sido muy buena,<\/strong> gracias a \u00abla gran afici\u00f3n naturalista que hay en el pa\u00eds<\/strong>.\u00bb Pero el bioinform\u00e1tico destaca otros aspectos que hacen que la iniciativa catalana tenga un gran impacto. \u00abLa situaci\u00f3n de Catalu\u00f1a <\/strong>entre el mediterr\u00e1neo y los Pirineos hace que tenga una gran riqueza de especies<\/strong>. A pesar de ser un territorio peque\u00f1o, aqu\u00ed viven cerca del 30% de las especies que se pueden encontrar en Europa. Y, adem\u00e1s, aqu\u00ed tenemos las infraestructuras adecuadas para poder producir genomas de gran calidad<\/strong>, como el Centro Nacional de An\u00e1lisis Gen\u00f3mico<\/a> (afiliado al CRG; CNAG-CRG) y el Barcelona Supercomputing Center<\/a>. \u00ab<\/p>\n\n\n\n El pasado mes de octubre, representantes de varios pa\u00edses europeos crearon el ERGA<\/a><\/strong>, el atlas europeo de referencia de los genomas<\/strong>, una gran iniciativa para contribuir al EBP a nivel de Europa. Y Rosa es una de las dos representantes espa\u00f1olas que participa en el consejo. Ella explica que \u00aben poco tiempo ya somos m\u00e1s de 500 miembros<\/strong> entre expertos en taxonom\u00eda, secuenciaci\u00f3n y computaci\u00f3n que trabajamos de manera conectada y coordinada para generar redes productivas y sumar los conocimientos cient\u00edficos de unos y otros<\/strong>.\u00bb<\/p>\n\n\n\n A pesar de que el proyecto es muy joven, desde el ERGA ya han comenzado a trabajar en un primer proyecto piloto que ha puesto el foco en \u00ablos nematomorfos<\/strong>, un filum muy desconocido del que ni siquiera se conoce su posici\u00f3n en el \u00e1rbol de la vida<\/strong>\u00ab, explica Fern\u00e1ndez.<\/p>\n\n\n\n Todos los nodos de trabajo del EBP tienen un objetivo com\u00fan: obtener genomas de alta calidad del m\u00e1ximo n\u00famero de especies<\/strong>. Por eso ha sido clave la mejora de la t\u00e9cnica. \u00abLa tecnolog\u00eda para secuenciar genomas ha mejorado mucho en esta \u00faltima d\u00e9cada<\/strong>\u00ab, explica Tyler Alioto jefe del grupo de de anotaci\u00f3n y ensamblaje del genoma<\/a> del CNAG-CRG. \u00abHace diez a\u00f1os, tan s\u00f3lo pod\u00edamos secuenciar fragmentos de algunos centenares de bases de longitud, y ahora secuenciamos regiones de cientos de miles de bases<\/strong>\u00ab. Y tener regiones m\u00e1s grandes facilita el ensamblaje del genoma.<\/p>\n\n\n\n Tyler explica que \u00abhace una d\u00e9cada ensamblar el genoma era como hacer un puzzle de 5000 piezas muy peque\u00f1as<\/strong>.\u00bb Si el genoma fuera un puzzle de un paisaje \u00abhabr\u00edas tenido muchas piezas azules con un pedazo de cielo. Ahora, las piezas son m\u00e1s grandes y \u00fanicas<\/strong> y aparte de un trozo de cielo hay una parte de un \u00e1rbol o de una monta\u00f1a. Por lo tanto, es m\u00e1s f\u00e1cil ordenar este puzzle<\/strong>.\u00bb<\/p>\n\n\n\n \u00abHace una d\u00e9cada ensamblar el genoma era como hacer un puzzle de 5000 piezas peque\u00f1as. Ahora, las piezas son m\u00e1s grandes y \u00fanicas y es m\u00e1s f\u00e1cil ordenar el puzzle\u00bb<\/em><\/p> Tyler Alioto<\/strong>; CNAG-CRG<\/em><\/p><\/blockquote>\n\n\n\n Sin embargo, en el proceso de secuenciar genomas de calidad todav\u00eda hay tres cuellos de botella. \u00abEl primero, es identificar y clasificar bien las especies<\/strong>. Para eso se necesitan buenos tax\u00f3nomos. En segundo lugar es clave preservar bien las muestras para extraer un ADN de calidad<\/strong>. Y el tercero, poder secuenciar regiones cada vez m\u00e1s largas<\/strong> para poder ensamblar f\u00e1cilmente\u00bb, explica Alioto.<\/p>\n\n\n\n Quiz\u00e1s algunos os pregunt\u00e1is si tiene sentido este esfuerzo de comunicaci\u00f3n y cooperaci\u00f3n internacional <\/strong>por el solo hecho de conseguir tener una biblioteca de genomas de las especies eucariotas. Pero los genomas s\u00f3lo son el primer paso para conocer y preservar mejor la biodiversidad.<\/strong><\/p>\n\n\n\n Seg\u00fan Fern\u00e1ndez, \u00abtener los genomas nos permite comparar las piezas gen\u00e9ticas<\/strong> de diferentes especies y entender c\u00f3mo ha sido la evoluci\u00f3n<\/strong> de los genes\u00bb. Pero esta herramienta no s\u00f3lo sirve para estudiar la evoluci\u00f3n. Alioto a\u00f1ade que \u00absecuenciar genomas de varios individuos de una poblaci\u00f3n, es una buena herramienta para entender si una especie est\u00e1 en peligro, porque lo est\u00e1 y poder, <\/strong>a partir de ah\u00ed, tomar medidas para recuperarla<\/strong><\/a>\u00ab.<\/p>\n\n\n\n \u00abEstamos viviendo una extinci\u00f3n masiva debida a la actividad del hombre<\/a>. Por eso tenemos la oportunidad y la obligaci\u00f3n de hacer todo lo posible para preservar la biodiversidad\u00bb<\/em><\/p> Tyler Alioto<\/strong>; <\/em>CNAG-CRG<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n Y no s\u00f3lo eso. Mirando al futuro, \u00abun \u00e1rea que comienza ahora, aunque es un poco pol\u00e9mica, es utilizar las tecnolog\u00edas gen\u00e9ticas para hacer conservaci\u00f3n de las especies<\/strong>\u00ab, explica Guig\u00f3. Un ejemplo es el caso de Australia, donde no hay especies aut\u00f3ctonas de sapos t\u00f3xicos. En 1935, introdujeron el sapo gigante, un animal que, ante la amenaza, libera una toxina que causa arresto cardiaco y la muerte a los animales que la intentan depredar. Mediante la tecnolog\u00eda CRISPR, cient\u00edficos australianos \u00abdetoxificaron\u00bb los sapos<\/a> para detener los efectos deteriorantes en la fauna aut\u00f3ctona causados por este anfibio.<\/p>\n\n\n\n Sea como sea, no se puede proteger lo que no se conoce<\/strong>. Por eso vale la pena \u00abtapar el agujero negro debido a la falta de informaci\u00f3n que tenemos de la historia natural\u00bb, concluye Fern\u00e1ndez.<\/p>\n\n\n\n Un proyecto que combina taxonom\u00eda, gen\u00e9tica y secuenciaci\u00f3n suma esfuerzos para conocer los genomas de las especies eucariotas de la Tierra.<\/p>\n","protected":false},"author":27,"featured_media":23362,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[27],"tags":[260,284,290],"new-type":[44],"class_list":["post-23623","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-investigacion","tag-biodiversidad","tag-evolucion","tag-genoma-es","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/23623","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/27"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=23623"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/23623\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":23751,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/23623\/revisions\/23751"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/23362"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=23623"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=23623"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=23623"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=23623"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}
Rosa Fern\u00e1ndez (IBE)<\/strong><\/p><\/blockquote>\n\n\n\nCatalu\u00f1a lidera una potente iniciativa local<\/h3>\n\n\n\n
ERGA, la iniciativa europea<\/strong><\/h3>\n\n\n\n
Las claves para conseguir una buena secuencia<\/h3>\n\n\n\n
Las aplicaciones del EBP<\/strong><\/h3>\n\n\n\n