{"id":17613,"date":"2020-09-15T18:58:25","date_gmt":"2020-09-15T16:58:25","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=17613"},"modified":"2020-09-16T22:41:52","modified_gmt":"2020-09-16T20:41:52","slug":"un-faro-en-el-mar-de-datos-del-sars-cov-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/un-faro-en-el-mar-de-datos-del-sars-cov-2\/","title":{"rendered":"Un faro en el mar de datos del SARS-CoV-2"},"content":{"rendered":"\n

El an\u00e1lisis de datos nunca ha sido tan relevante, como ha demostrado la crisis mundial de salud causada por el coronavirus SARS-CoV-2<\/a>, pero los datos gen\u00f3micos son incre\u00edblemente dif\u00edciles de navegar. Ahora, un equipo experto en bioinform\u00e1tica del Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a>, que forma parte de ELIXIR<\/a> Espa\u00f1a, ha desarrollado una plataforma<\/a> , llamada COVID-19 Viral Beacon<\/a><\/strong>, que permite navegar el mar de datos de SARS-CoV-2<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

La plataforma presenta la oportunidad de analizar datos gen\u00e9ticos en bruto y consensuados de COVID-19<\/strong> provenientes de varios conjuntos de datos, buscando variantes gen\u00e9ticas espec\u00edficas y explorando los metadatos asociados, a partir de una interfaz intuitiva para el usuario<\/strong>. Por ejemplo, puede filtrar cepas virales de una regi\u00f3n geogr\u00e1fica concreta o descubrir variantes que puedan explicar diferencias individuales en la respuesta inmune.<\/p>\n\n\n\n

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\u00abLa plataforma es f\u00e1cilmente accesible para buscar informaci\u00f3n gen\u00f3mica del SARS-CoV-2 r\u00e1pidamente, incluso con tel\u00e9fonos m\u00f3viles\u00bb
Jordi Rambla<\/strong>, Jefe de equipo del EGA en el CRG.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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El Viral Beacon del CRG utiliza la API GA4GH<\/a> Beacon, que se cre\u00f3 inicialmente para descubrir los Polimorfismos de Nucle\u00f3tidos \u00danicos (SNP)<\/a> humanos y compartir datos gen\u00f3micos en investigaciones biom\u00e9dicas sin comprometer la privacidad<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

Hace unos meses, el equipo cient\u00edfico del CRG modific\u00f3 y ampli\u00f3 la arquitectura y la funcionalidad de esta herramienta para el descubrimiento de datos del SARS-CoV-2.<\/strong> El nodo ELIXIR Spain comenz\u00f3 a recopilar secuencias gen\u00f3micas p\u00fablicas a trav\u00e9s de pipelines<\/a><\/em> dedicadas (leed el art\u00edculo de Galaxy<\/a> para m\u00e1s detalles).<\/p>\n\n\n\n

Babita Singh<\/strong>, que forma parte del equipo EGA <\/a>del CRG, dijo: \u00abAhora buscamos colaboraciones adicionales con expertos en la materia para ayudarnos a ampliar las funcionalidades de esta herramienta. El objetivo es hacer de Beacon una herramienta r\u00e1pida de b\u00fasqueda de variantes gen\u00f3micas para COVID y otras enfermedades infecciosas. En el futuro, nuestra idea es tambi\u00e9n incluir informaci\u00f3n de variantes gen\u00f3micas humanas para estudiar la interacci\u00f3n entre la gen\u00f3mica humana y la viral<\/strong>\u00ab.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Bioinform\u00e1ticos del CRG han desarrollado una plataforma para analizar y explorar datos gen\u00e9ticos del SARS-CoV-2 procedentes de diversas fuentes.<\/p>\n","protected":false},"author":9,"featured_media":17590,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[27],"tags":[262,722,266,707],"new-type":[44],"class_list":["post-17613","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-investigacion","tag-bioinformatica-es","tag-coronavirus-es","tag-crg-es","tag-genomica-es","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17613","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/9"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=17613"}],"version-history":[{"count":12,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17613\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":17627,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17613\/revisions\/17627"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/17590"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=17613"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=17613"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=17613"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=17613"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}