{"id":17067,"date":"2020-07-20T11:56:15","date_gmt":"2020-07-20T09:56:15","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=17067"},"modified":"2020-07-27T12:27:51","modified_gmt":"2020-07-27T10:27:51","slug":"facilitando-el-diseno-de-farmacos-una-plataforma-para-estudiar-las-gpcrs","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/facilitando-el-diseno-de-farmacos-una-plataforma-para-estudiar-las-gpcrs\/","title":{"rendered":"Facilitando el dise\u00f1o de f\u00e1rmacos: una plataforma para estudiar las GPCRs"},"content":{"rendered":"\n

En nuestro cuerpo hay m\u00e1s de 800 receptores acoplados a prote\u00edna G (GPCRs)<\/strong>, unas prote\u00ednas presentes en la membrana celular y encargadas de transmitir se\u00f1ales dentro de la c\u00e9lula. Estan involucradas en much\u00edsimos procesos – y en enfermedades desde el Alzheimer o el Parkinson hasta el c\u00e1ncer<\/a>. Es por eso que son dianas para casi el 40% de los f\u00e1rmacos actuales<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

Un consorcio de 24 laboratorios de 10 pa\u00edses <\/strong>acaba de hacer p\u00fablica una plataforma llamada GPCRmd<\/a> para que cient\u00edficos y cient\u00edficas de diferentes disciplinas puedan inspeccionar y analizar f\u00e1cilmente un exhaustivo n\u00famero de simulaciones moleculares de GPCRs. Esto podr\u00eda ayudar al dise\u00f1o de nuevos f\u00e1rmacos que tienen GPCRs como diana o en la medicina personalizada.<\/p>\n\n\n\n

La iniciativa ha sido liderada desde el GRIB <\/a>– <\/strong>un programa de investigaci\u00f3n conjunto del Instituto Hospital del Mar de Investigaciones M\u00e9dicas\u00a0(IMIM) y del Departamento de Ciencias Experimentales y de la Salud, Universidad Pompeu Fabra (DCEXS-UPF)<\/a><\/a> – y ha contado con importante apoyo del Instituto Paul Scherrer de Suiza.<\/p>\n\n\n\n

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La plataforma GPCRmd <\/strong>permite analizar f\u00e1cilmente un exhaustivo n\u00famero de simulaciones moleculares de GPCRs. Esto podr\u00eda ayudar al dise\u00f1o de nuevos f\u00e1rmacos o la medicina personalizada.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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Hablamos con Mariona Torrens Fontanals, una de las principales autoras de este trabajo<\/a><\/strong>. La joven cient\u00edfica es estudiante de doctorado en el Grupo de investigaci\u00f3n en desarrollo de f\u00e1rmacos en base a GPCRs del Programa de Investigaci\u00f3n en Inform\u00e1tica Biom\u00e9dica (GRIB), dirigido por Jana Selent, investigadora Miguel Servet en el IMIM. Ambas son las encargadas de gestionar la plataforma GPCRmd<\/strong><\/a>.<\/p>\n\n\n\n

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Entrevista a Mariona Torrens Fontanals<\/h2>\n\n\n\n

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\u00bfQu\u00e9 son los GPCRs y por qu\u00e9 son tan importantes?<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Son prote\u00ednas que se encuentran en la membrana de muchas c\u00e9lulas de nuestro cuerpo y que se encargan de transmitir una se\u00f1al al interior de la c\u00e9lula<\/strong>. Las hay de muchos tipos – de hecho \u00a1es la mayor familia de prote\u00ednas en humanos! Por ello est\u00e1n implicadas en muchos procesos diferentes. De hecho \u00a1el 40% de los f\u00e1rmacos que existen en el mercado tienen una GPCR como diana!<\/p>\n\n\n\n

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\u00bfQu\u00e9 dificultades conllevan a la hora de desarrollar f\u00e1rmacos contra ellas?<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Son prote\u00ednas muy complejas. Pueden causar m\u00e1s de una se\u00f1al al mismo tiempo <\/strong>– una puede ser el efecto terap\u00e9utico que quieres, pero otra puede ser un efecto secundario que no quieres. Y es dif\u00edcil saber c\u00f3mo activar la prote\u00edna para que haga s\u00f3lo lo que t\u00fa quieres. Su estructura var\u00eda seg\u00fan qu\u00e9 mol\u00e9cula se une a ellas<\/strong>. Y cuando var\u00eda su estructura, var\u00eda la se\u00f1alizaci\u00f3n que env\u00edan dentro de la c\u00e9lula. As\u00ed, seg\u00fan como se una el potencial f\u00e1rmaco, puede tener una acci\u00f3n u otra. Por ello entender su estructura es tan importante, y en los \u00faltimos 10 a\u00f1os se ha descifrado la estructura 3D de muchas GPCRs.<\/p>\n\n\n\n

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Pero conocer su estructura est\u00e1tica no es suficiente\u2026<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Una cosa es determinar la estructura por cristalograf\u00eda u otras t\u00e9cnicas. Pero en el caso de las GPCRs la estructura es muy din\u00e1mica, y por eso lo que es interesante es hacer despu\u00e9s simulaciones con din\u00e1mica molecular (DM) <\/strong>para explorar todo el paisaje conformacional de cada GPCR a nivel at\u00f3mico – es decir, mirar \u00e1tomo por \u00e1tomo y ver qu\u00e9 fuerzas se est\u00e1n aplicando unos a otros en cada momento. Esto lo hacemos cada 2 femtosegundos (0,000 000 000 000 002 segundos) y vamos viendo c\u00f3mo se mueve la prote\u00edna – c\u00f3mo cambia su estructura – \u00e1tomo por \u00e1tomo. Ahora bien, esto requiere un alto nivel de experiencia y conocimiento t\u00e9cnico, as\u00ed como mucho espacio y software especializado\u2026<\/p>\n\n\n\n

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Las simulaciones con din\u00e1mica molecular (DM) permiten explorar todo el paisaje conformacional de cada GPCR \u00e1tomo por \u00e1tomo, mirando qu\u00e9 fuerzas se est\u00e1n aplicando unos a otros cada 2 femtosegundos.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

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Y de esta necesidad naci\u00f3 GPCRmd.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

S\u00ed, como una herramienta para poder compartir todas estas simulaciones <\/strong>con la comunidad cient\u00edfica. No s\u00f3lo entre bioinform\u00e1ticos o bi\u00f3logos estructurales – que somos los que hacemos din\u00e1mica molecular – sino con investigadores o investigadoras de diferentes disciplinas interesados \u200b\u200ben las GCPRs <\/strong>a nivel experimental: gente que est\u00e1 desarrollando f\u00e1rmacos, que quieren entender que una determinada mutaci\u00f3n o variante en una GPCR modifica su acci\u00f3n\u2026 Para toda esta gente, la informaci\u00f3n que dan las simulaciones de din\u00e1mica molecular es muy \u00fatil, pero a menudo no la usan porque no saben de d\u00f3nde sacarla o como interpretarla. GPCRmd es una plataforma abierta<\/strong> donde se pueden encontrar estas simulaciones de las GPCRs; de momento hay un 70% de todas las GPCRs de las que se conoce la estructura, pero esperamos ir a\u00f1adiendo m\u00e1s hasta llegar al 100%. Y adem\u00e1s de estas simulaciones, tambi\u00e9n hay ejemplos de an\u00e1lisis <\/strong>que se pueden hacer para que cualquier persona interesada pueda sacar el m\u00e1ximo provecho de estos datos.<\/p>\n\n\n\n

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Aqu\u00ed pod\u00e9is escuchar a Mariona Torrens Fontanals contando en primera persona c\u00f3mo y porque han creado GPCRmd (v\u00eddeo en Catalan)<\/p>\n\n\n\n

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