{"id":15350,"date":"2020-06-08T15:56:23","date_gmt":"2020-06-08T13:56:23","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=15350"},"modified":"2020-06-08T15:57:54","modified_gmt":"2020-06-08T13:57:54","slug":"cuando-la-genomica-ayuda-a-salvar-a-los-chimpances","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/cuando-la-genomica-ayuda-a-salvar-a-los-chimpances\/","title":{"rendered":"Cuando la gen\u00f3mica ayuda a salvar a los chimpanc\u00e9s"},"content":{"rendered":"

En estos momentos en los que la aparici\u00f3n del SARS-CoV-2<\/a> ha cambiado nuestras vidas, es un buen momento para reflexionar\u00a0c\u00f3mo esta pandemia<\/a> tambi\u00e9n afecta al resto de seres vivos<\/strong>. Por ejemplo, en el caso de los chimpanc\u00e9s (Pan troglodytes<\/em>) ya se empieza a hablar de c\u00f3mo\u00a0esta infecci\u00f3n puede ser perjudicial para su supervivencia<\/strong>.<\/p>\n

Si bien la COVID-19 y otras enfermedades infecciosas, como el \u00c9bola, son un factor de riesgo para los chimpanc\u00e9s, tambi\u00e9n la destrucci\u00f3n del h\u00e1bitat natural, el cambio clim\u00e1tico y el tr\u00e1fico ilegal han provocado que hoy en d\u00eda los chimpanc\u00e9s est\u00e9n considerados en peligro de extinci\u00f3n<\/strong>. Seg\u00fan la IUCN (International Union for Conservation of Nature and Natural Resources<\/em>), se estima que su poblaci\u00f3n se habr\u00e1 reducido a la mitad para el a\u00f1o 2050. As\u00ed pues,\u00a0es imprescindible la elaboraci\u00f3n de planes de acci\u00f3n eficaces para la conservaci\u00f3n de esta especie<\/strong>.<\/p>\n

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Se estima que la poblaci\u00f3n de chimpanc\u00e9s se habr\u00e1 reducido a la mitad para el a\u00f1o 2050. La destrucci\u00f3n de su h\u00e1bitat natural, el cambio clim\u00e1tico y el tr\u00e1fico ilegal son las causas principales.<\/p>\n<\/blockquote>\n

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Estos planes suelen dividirse en ex situ <\/em>e in situ<\/em>, dependiendo de si se efect\u00faan fuera o en su h\u00e1bitat natural.<\/p>\n

Fuera de \u00c1frica, uno de los planes de conservaci\u00f3n de especies en peligro de extinci\u00f3n m\u00e1s importantes es el dirigido por la Asociaci\u00f3n de Zoos y Acuarios Europeo (EAZA)<\/a>. Su objetivo principal es velar por la supervivencia a largo plazo de una poblaci\u00f3n sana de chimpanc\u00e9s, manteniendo separadas sus cuatro subespecies. Aun as\u00ed, debido a un conocimiento poco concreto del origen, ascendencia gen\u00e9tica y parentesco de los chimpanc\u00e9s, pero tambi\u00e9n por la falta de herramientas moleculares precisas, la cr\u00eda de esta especie ha derivado hacia casos de mezcla entre subespecies y consanguinidad<\/strong>.<\/p>\n

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La gen\u00f3mica al rescate<\/strong><\/h2>\n

Por este motivo, en el estudio que hemos publicado en Heredity<\/em>, hemos querido explorar hasta qu\u00e9 punto encontramos estos casos en 167 chimpanc\u00e9s tanto de zoos europeos como de santuarios en \u00c1frica. De este modo se pueden identificar los individuos susceptibles a formar parte de programas de cr\u00eda en cautividad y contribuir a mantener una poblaci\u00f3n gen\u00e9ticamente fidedigna con la naturaleza. En el estudio, hemos determinado que de los 136 chimpanc\u00e9s que forman parte del programa de conservaci\u00f3n\u00a0ex situ<\/em> en zoos europeos<\/strong>, 90 tienen ascendencia de una sola subespecie mientras que el resto han sido clasificados como h\u00edbridos, es decir, con ascendencia de dos o m\u00e1s subespecies.<\/p>\n

Pero tambi\u00e9n desde una visi\u00f3n de la conservaci\u00f3n\u00a0in<\/em> situ<\/em><\/strong>, hemos completado el estudio con la\u00a0determinaci\u00f3n del origen geogr\u00e1fico de 31 chimpanc\u00e9s rescatados del tr\u00e1fico ilegal de mascotas<\/strong> y que actualmente se encuentran en santuarios en \u00c1frica. Esto ha sido posible gracias a\u00a0un estudio anterior<\/strong> de nuestro grupo en el que describimos\u00a0un atlas gen\u00e9tico-geogr\u00e1fico que permite inferir el lugar de origen a partir de los datos gen\u00e9ticos<\/strong> (de Manuel, 2016).<\/p>\n

De los 31 chimpanc\u00e9s que hemos analizado, la mayor\u00eda pertenecen a la subespecie P.t. schweinfurthii<\/em>, y hemos inferido el origen principalmente en dos localizaciones concretas: una al norte y la otra al sur de la Rep\u00fablica Democr\u00e1tica del Congo. Al cruzar estos datos con el lugar de confiscaci\u00f3n, hemos visto que en la mayor\u00eda de los casos coincid\u00eda, hecho que nos indica que\u00a0la ruta de tr\u00e1fico ilegal sucede a escala local, a poca distancia del lugar donde el animal ha sido capturado<\/strong>. A pesar de ello, tambi\u00e9n hemos encontrado dos casos en los que los chimpanc\u00e9s hab\u00edan sido confiscados mucho m\u00e1s lejos, uno en Mosc\u00fa y el otro en Nairobi, mientras que el or\u00edgen geogr\u00e1fico inferido gen\u00e9ticamente los sit\u00faa en el oeste de \u00c1frica y en Camer\u00fan, respectivamente.<\/p>\n

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Determinar el origen geogr\u00e1fico de los animales confiscados abre la posibilidad de que estos chimpanc\u00e9s puedan ser reintroducidos a su h\u00e1bitat natural.<\/p>\n<\/blockquote>\n

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El hecho de poder determinar el origen geogr\u00e1fico de los animales confiscados abre la posibilidad de que estos chimpanc\u00e9s puedan ser reintroducidos a su h\u00e1bitat natural, y gracias a los an\u00e1lisis gen\u00f3micos, poderlo hacer en el lugar correspondiente. Pero tambi\u00e9n nos permite conocer en qu\u00e9 zonas hay m\u00e1s casos de tr\u00e1fico ilegal para que las administraciones pertinentes puedan aplicar las sanciones necesarias.<\/p>\n

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Soluciones innovadoras para las limitaciones<\/strong><\/h2>\n

Ahora bien, muchas veces la aplicaci\u00f3n de la gen\u00e9tica en la conservaci\u00f3n se ha visto limitada por la financiaci\u00f3n. Por eso, hemos querido desarrollar y aplicar un\u00a0m\u00e9todo que nos permite capturar las regiones del genoma que nos informan sobre cu\u00e1l es la subespecie del chimpanc\u00e9 analizado mirando ~60.000 SNPs<\/a><\/strong>, evitando el coste de la secuenciaci\u00f3n de genomas completos<\/a>. As\u00ed pues,\u00a0hemos propuesto una t\u00e9cnica asequible que puede ser usada en la conservaci\u00f3n de especies en peligro de extinci\u00f3n<\/strong>.<\/p>\n

Otra\u00a0limitaci\u00f3n<\/strong> que muy a menudo nos encontramos es la\u00a0obtenci\u00f3n de muestras<\/strong>, sobre todo de\u00a0animales salvajes<\/strong>. Por lo tanto, tambi\u00e9n\u00a0hemos comprobado la idoneidad de las muestras no-invasivas (pelo)<\/b>, comparando los resultados con muestras de sangre de los mismos individuos.<\/p>\n

Este proyecto ha sido posible gracias a una larga colaboraci\u00f3n entre el grupo de Tom\u00e0s Marqu\u00e8s en el Instituto de Biolog\u00eda Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a>, con la ayuda del Zoo de Barcelona<\/a>, as\u00ed como el Zoo de Copenhaguen, con los investigadores Peter Frandsen y Christina Hvilsom.<\/p>\n

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\u00abNuestro estudio ayudar\u00e1 a construir, con m\u00e1s precisi\u00f3n, el atlas de correspondencia gen\u00e9tica y geogr\u00e1fica y as\u00ed poder geolocalizar chimpanc\u00e9s a nivel mucho m\u00e1s local\u00bb
Cl\u00e0udia Fontser\u00e8 Alemany<\/strong><\/p>\n<\/blockquote>\n

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En definitiva, nuestro estudio demuestra\u00a0el potencial de la gen\u00f3mica para contribuir en la elaboraci\u00f3n de planes de conservaci\u00f3n<\/strong> pero a la vez nos prepara el terreno para los estudios que vendr\u00e1n. Los siguientes pasos en la gen\u00e9tica de la conservaci\u00f3n consistir\u00e1n en construir, con m\u00e1s precisi\u00f3n, estos atlas de correspondencia gen\u00e9tica y geogr\u00e1fica y as\u00ed poder geolocalizar chimpanc\u00e9s, no a nivel de pa\u00eds o regi\u00f3n sino a nivel mucho m\u00e1s local, por ejemplo de parque nacional. Para conseguirlo se necesitar\u00e1n muchas m\u00e1s muestras de las cuales conozcamos su origen geogr\u00e1fico y es aqu\u00ed donde las muestras no-invasivas nos ser\u00e1n de gran ayuda. \u00a1Espero poder explicaros un poco m\u00e1s sobre este tema en un futuro bien pr\u00f3ximo!<\/p>\n

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\"\"<\/figure><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Cl\u00e0udia Fontser\u00e8 Alemany est\u00e1 acabando su doctorado en el IBE. Nos cuenta c\u00f3mo han desarrollado un an\u00e1lisis gen\u00f3mico asequible y no invasivo que puede ser usado en la conservaci\u00f3n de especies en peligro de extinci\u00f3n.<\/p>\n","protected":false},"author":9,"featured_media":15268,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[31],"tags":[260,658,290,707,212],"new-type":[44],"class_list":["post-15350","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia-y-sociedad","tag-biodiversidad","tag-doctorado","tag-genoma-es","tag-genomica-es","tag-ibe-csic-upf-es","new-type-noticias"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/15350","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/9"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=15350"}],"version-history":[{"count":23,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/15350\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":15741,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/15350\/revisions\/15741"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/15268"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=15350"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=15350"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=15350"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=15350"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}