{"id":11637,"date":"2019-12-13T11:12:15","date_gmt":"2019-12-13T10:12:15","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=11637"},"modified":"2020-01-17T15:52:42","modified_gmt":"2020-01-17T14:52:42","slug":"un-telescopio-para-nuestros-genes-un-nuevo-algoritmo-permite-comparar-casi-millon-y-medio-de-secuencias-de-adn","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/un-telescopio-para-nuestros-genes-un-nuevo-algoritmo-permite-comparar-casi-millon-y-medio-de-secuencias-de-adn\/","title":{"rendered":"Un supertelescopio para nuestros genes: un nuevo algoritmo permite comparar casi mill\u00f3n y medio de secuencias de ADN"},"content":{"rendered":"

Hay distintas formas de viajar al pasado<\/strong>.<\/span><\/p>\n

Una es la macro, con la mirada hacia afuera<\/strong>, observando el comportamiento de las enormes galaxias y c\u00f3mo el universo que nos rodea ha variado en el tiempo. La otra es la micro, mirando hacia dentro<\/strong>, hacia los diminutos genes, y comparando tambi\u00e9n su variaci\u00f3n entre especies. Tanto una como otra aproximaci\u00f3n se enfrentan a retos tecnol\u00f3gicos<\/strong>.\u00a0<\/span><\/p>\n

Para lo m\u00e1s macro, los cient\u00edficos han desarrollado el Telescopio Espacial Hubble<\/a>, que orbita alrededor de la tierra y evita la distorsi\u00f3n provocada por la atm\u00f3sfera terrestre.<\/span><\/p>\n

Para lo micro, hace a\u00f1os que se usan programas inform\u00e1ticos que comparan secuencias de ADN o de prote\u00ednas. Esta t\u00e9cnica, llamada <\/span>alineamiento m\u00faltiple de secuencias (MSA)<\/a><\/strong>, <\/span>\u00a0busca similitudes y diferencias entre las secuencias biol\u00f3gicas de distintas especies para descifrar cu\u00e1nto hace que dos especies divergieron<\/a> y predecir c\u00f3mo cambios espec\u00edficos en un gen o prote\u00edna pueden afectar a su funci\u00f3n.<\/span> Nos ha permitido avanzar mucho en el conocimiento de nuestra historia evolutiva<\/a>, y de nuestra relaci\u00f3n con otras especies, pero tiene sus limitaciones a la hora de comparar grandes n\u00fameros de secuencias<\/strong>; el l\u00edmite ha sido durante mucho tiempo 100.000 secuencias.<\/span><\/p>\n

\u00a0<\/span><\/p>\n

El alineamiento m\u00faltiple de secuencias (MSA) permit\u00eda hasta ahora comparar hasta 100.000 secuencias de ADN de diferentes especies. Busca similitudes y diferencias entre ellas para descifrar cu\u00e1nto hace que dos especies divergieron y predecir c\u00f3mo han afectado los cambios.<\/p><\/blockquote>\n

 <\/p>\n

\"Ejemplo
Ejemplo de un alineamiento m\u00faltiple de secuencias (MSA). Imagen de Miguel Andrade, CC BY-SA 3.0<\/figcaption><\/figure>\n

<\/h2>\n

De 100.000 a 1,4 millones<\/b><\/h2>\n

Ahora, un equipo de investigadores del Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a>, liderados por C\u00e9dric Notredame<\/a>, han desarrollado un algoritmo mucho m\u00e1s eficiente<\/a> que permite comparar a la vez\u00a0 1,4 millones de secuencias<\/strong> – 10 veces m\u00e1s de lo que se pod\u00eda hasta ahora. Cuantas m\u00e1s secuencias puedan compararse a la vez, m\u00e1s atr\u00e1s en el tiempo podemos ir.<\/span><\/p>\n

Las nuevas t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n nos permiten secuenciar m\u00e1s y m\u00e1s genomas; por ejemplo, el proyecto Earth BioGenome<\/a> pretende secuenciar y catalogar el genoma de toda la diversidad de organismos eucariotas de la tierra – unos 1,5 millones<\/strong> de secuencias. Ahora, este nuevo algoritmo desarrollado en el CRG nos permitir\u00e1 compararlas entre ellas para descifrar sus relaciones y su historia evolutiva<\/a>.<\/span><\/p>\n

\u00abHay una gran cantidad de ‘materia oscura’ en biolog\u00eda<\/a> que todav\u00eda no hemos identificado, tanto en nuestro genoma como en el de otros organismos que, aunque aparentemente irrelevantes, pueden tener un papel fundamental en la promoci\u00f3n de la salud humana y la de nuestro planeta<\/a>, como el descubrimiento de CRISPR<\/a> en las arqueas\u00bb, concluye C\u00e9dric. \u00abNuestro desarrollo podr\u00e1 ayudar a analizar los genomas en m\u00e1s detalle, a encontrar las agujas en el pajar de los genomas de la vida.\u00bb<\/p>\n

 <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Un equipo de investigaci\u00f3n del CRG ha desarrollado una nueva t\u00e9cnica para comparar 1,4 millones de secuencias de ADN a la vez. Esto representa 10 veces m\u00e1s de lo que se hab\u00eda podido hacer hasta ahora.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":11645,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[27],"tags":[262,266,284,290],"new-type":[44,42],"class_list":["post-11637","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-investigacion","tag-bioinformatica-es","tag-crg-es","tag-evolucion","tag-genoma-es","new-type-noticias","new-type-recomendamos"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11637","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11637"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11637\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":11791,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11637\/revisions\/11791"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/11645"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11637"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11637"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11637"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=11637"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}