{"id":10679,"date":"2019-10-22T18:02:08","date_gmt":"2019-10-22T16:02:08","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=10679"},"modified":"2019-11-14T23:06:30","modified_gmt":"2019-11-14T22:06:30","slug":"nuevos-datos-sobre-la-agregacion-proteica-y-las-enfermedades-neurodegenerativas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/nuevos-datos-sobre-la-agregacion-proteica-y-las-enfermedades-neurodegenerativas\/","title":{"rendered":"Nuevos datos sobre la agregaci\u00f3n proteica y las enfermedades neurodegenerativas"},"content":{"rendered":"<p>Al igual que en muchas enfermedades neurodegenerativas, los\u00a0<strong>agregados proteicos<\/strong> est\u00e1n presentes en el cerebro y la m\u00e9dula espinal de la inmensa mayor\u00eda de pacientes con\u00a0<strong>Esclerosis Lateral Amiotr\u00f3fica (ELA)<\/strong>. Sin embargo, no est\u00e1 claro si estos agregados son los causantes reales de estas enfermedades.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2><b>Agregaci\u00f3n proteica: \u00bfcausa o consecuencia?<\/b><\/h2>\n<p>Para echar luz sobre el tema, personal investigador del <a href=\"http:\/\/www.crg.eu\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG)<\/a> y del Instituto de Bioingenier\u00eda de Catalu\u00f1a (IBEC) han <strong>usado una t\u00e9cnica llamada mutag\u00e9nesis profunda.<\/strong>\u00a0Cogieron\u00a0<strong>TDP-43<\/strong>, una prote\u00edna que se acumula en las motoneuronas de pr\u00e1cticamente todos los pacientes con ELA, y\u00a0<strong>crearon alrededor de 50.000 versiones\u00a0<\/strong>de \u00e9sta, cada una con una mutaci\u00f3n distinta. Posteriormente, introdujeron cada versi\u00f3n en c\u00e9lulas de levadura y cuantificaron su toxicidad.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2><b>Resultados inesperados<\/b><\/h2>\n<p>Sorprendentemente,\u00a0<strong>las prote\u00ednas mutadas que causaban agregaci\u00f3n resultaron ser las menos t\u00f3xicas en levaduras, <\/strong>mientras que\u00a0las versiones m\u00e1s t\u00f3xicas se encontraban en estado l\u00edquido. Seg\u00fan\u00a0<strong>Ben Lehner<\/strong>, l\u00edder del estudio, esto es exactamente lo contrario de lo que esperaban encontrar seg\u00fan el actual conocimiento sobre estas enfermedades. \u00abParece que la agregaci\u00f3n protege a las c\u00e9lulas, en vez de perjudicarlas\u00bb, coincide\u00a0<strong>Benedetta Bolognesi<\/strong>, primera co-autora del art\u00edculo\u00a0\u2013 juntamente con\u00a0<strong>Andr\u00e9 Faure<\/strong>\u00a0\u2013 y, actualmente, l\u00edder de grupo junior en el IBEC.<\/p>\n<p>\u00abPor supuesto, el\u00a0<strong>estudio se ha llevado a cabo en levaduras<\/strong>, que es un sistema modelo\u00a0\u2013 no sabemos si en humanos hay otros aspectos en juego&#8230; Pero este experimento nos demuestra que el agregado en si mismo, en estado s\u00f3lido, no mata a las c\u00e9lulas eucariotas. Y esto es importante, porque todos los art\u00edculos publicados sobre enfermedades neurodegenerativas, como el <a href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/vivir-con-el-alzheimer-el-amor-no-se-olvida\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Alzheimer<\/a> o el Parkinson, empiezan diciendo \u00ablos agregados insolubles o las placas son un marcador distintivo de la enfermedad\u00bb; y es cierto, pero no significa que sean la causa\u00bb, explica la investigadora italiana.<\/p>\n<p>\u00abEs posible que las formas perjudiciales sean intermediarios en el proceso de agregaci\u00f3n, pero tambi\u00e9n podr\u00edan estar form\u00e1ndose independientemente a los agregados; podr\u00edan no estar relacionados. No lo hemos mirado\u00bb, alertan los autores.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><iframe loading=\"lazy\" width=\"1170\" height=\"400\" scrolling=\"no\" frameborder=\"no\" src=\"https:\/\/w.soundcloud.com\/player\/?visual=true&#038;url=https%3A%2F%2Fapi.soundcloud.com%2Ftracks%2F697636047&#038;show_artwork=true&#038;maxwidth=1170&#038;maxheight=1000&#038;dnt=1\"><\/iframe><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<blockquote><p><span style=\"font-weight: 400;\">Los autores crearon &gt;50.000 formas mutantes de TDP-43, la prote\u00edna que se acumula en el cerebro de los pacientes con Esclerosis Lateral Amiotr\u00f3fica (ELA). Han visto que los agregados como tales no matan a las c\u00e9lulas de levadura.<\/span><\/p><\/blockquote>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>La investigadora italiana comprobar\u00e1 ahora si esto (que las formas l\u00edquidas son perjudiciales y los agregados no) es cierto en c\u00e9lulas de mam\u00edfero. Si se confirma, estar\u00edamos ante un <strong>punto de inflexi\u00f3n en el estudio de las enfermedades neurodegenerativas <\/strong>como el ELA o el Alzheimer, el tratamiento de las cuales se ha centrado hasta ahora en estos agregados proteicos, sin \u00e9xito.<\/p>\n<p>\u201cLo que me gusta de este art\u00edculo, y de la metodolog\u00eda usada, es que gracias a que analizamos todas las mutaciones posibles podemos ver algunos patrones que no ver\u00edamos al analizar una sola mutaci\u00f3n\u00bb, a\u00f1ade Bolognesi.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><iframe loading=\"lazy\" width=\"1170\" height=\"658\" src=\"https:\/\/www.youtube.com\/embed\/AB_BJY8Md-U?feature=oembed\" frameborder=\"0\" allow=\"accelerometer; autoplay; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture\" allowfullscreen><\/iframe><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2><b>Las mutaciones gen\u00e9ticas pueden indicar la estructura de las prote\u00ednas<\/b><\/h2>\n<p>La metodolog\u00eda usada,\u00a0<strong>el escaneo profundo de mutaciones, implica crear miles de versiones mutadas de la misma prote\u00edna y analizarlas <\/strong>despu\u00e9s\u00a0\u2013 y ha demostrado ofrecer nuevos puntos de vista sobre las estructuras de las prote\u00ednas y c\u00f3mo \u00e9stas afectan a las c\u00e9lulas. Su uso para descubrir las estructuras de las prote\u00ednas fue <a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41588-019-0431-x\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">propuesto recientemente<\/a> por el laboratorio de Lehner, y el estudio del TDP-43 lo ha aplicado.<\/p>\n<p>Descifrar la\u00a0<strong>estructura 3D de las prote\u00ednas<\/strong> se lleva a cabo, normalmente, por m\u00e9todos como la cristalograf\u00eda de rayos X, la espectroscop\u00eda de Resonancia Magn\u00e9tica Nuclear (RMN) o la criomicroscop\u00eda electr\u00f3nica. Todas estas metodolog\u00edas, sin embargo, tienen limitaciones y suelen ser caras. La predicci\u00f3n computacional a partir de secuencias de amino\u00e1cidos no es tan cara, pero no siempre es precisa.<\/p>\n<p>El personal investigador del CRG\u00a0<strong>implement\u00f3 una aproximaci\u00f3n m\u00e1s barata y simple<\/strong>: tomar una prote\u00edna, mutar cada uno de sus amino\u00e1cidos y, despu\u00e9s, analizar c\u00f3mo cada mutaci\u00f3n afecta el crecimiento de las c\u00e9lulas que contienen la mutaci\u00f3n. Encontrando relaciones entre las mutaciones los efectos de las cuales se combinaban de maneras inesperadas, y asumiendo que seguramente estas mutaciones ser\u00e1n colindantes en la prote\u00edna doblada, los cient\u00edficos han podido inferir la estructura 3D de la prote\u00edna.<\/p>\n<p>\u00abA pesar de que el escaneo profundo de mutaciones podr\u00eda ser considerado un m\u00e9todo experimental ya muy establecido,\u00a0<strong>existe una gran necesidad de usar herramientas computacionales f\u00e1ciles de utilizar para analizar\u00a0<\/strong>e interpretar los resultados obtenidos, tal y como hicimos en este art\u00edculo. Este es el motivo por el cual estamos desarrollando <a href=\"https:\/\/github.com\/lehner-lab\/DiMSum\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">DiMSum<\/a>: un software gratuito para procesar resultados obtenidos a partir del escaneo profundo de mutaciones\u00bb, a\u00f1ade Andr\u00e9 Faure, quien dirigi\u00f3 el an\u00e1lisis de datos en el art\u00edculo sobre TDP-43.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Un equipo cient\u00edfico del CRG ha creado 50.000 mutaciones para probar la toxicidad de los agregados proteicos en Esclerosis Lateral Amiotr\u00f3fica (ELA), con resultados inesperados.<\/p>\n","protected":false},"author":9,"featured_media":10652,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[27],"tags":[321,266,333,692,318,232,330],"new-type":[44,42],"class_list":["post-10679","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-investigacion","tag-alzheimer-es","tag-crg-es","tag-genes-es","tag-levadura","tag-neurobiologia-es","tag-parkinson-es","tag-proteinas","new-type-noticias","new-type-recomendamos"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10679","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/9"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=10679"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10679\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10702,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10679\/revisions\/10702"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/10652"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=10679"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=10679"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=10679"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/es\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=10679"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}