Datos masivos para predecir la respuesta a la inmunoterapia

El estudio, realizado íntegramente dentro del programa de Investigación en Informática Biomédica (GRIB) del Hospital del Mar Research Institute y del Departamento de Medicina y Ciencias de la Vida (MELIS-UPF), se ha enfocado en el cáncer de vejiga

El grupo de investigación ha podido ver cómo funciona la inmunoterapia en los diferentes tipos de cáncer de vejiga. Fotografía de Hospital del Mar Research Institute

Sólo un 20% de los pacientes de cáncer de vejiga responden al tratamiento de inmunoterapia. Ahora, equipos investigadores en el PRBB han utilizado el análisis masivo de datos para identificar marcadores clave del cáncer de vejiga que podrán ayudar a determinar el nivel de respuesta a la inmunoterapia. El equipo, coordinado por Mar Albà (codirectora del Programa de Investigación en Informática Biomédica (GRIB)), Júlia Perera y Joaquim Bellmunt (Hospital del Mar Research Institute) y en el que ha colaborado Robert Castelo (Departamento de Medicina y Ciencias de la Vida, MELIS-UPF), ha analizado los datos de más de 700 pacientes con cáncer de vejiga de seis cohortes diferentes.

Las investigadoras e investigadores han desarrollado un algoritmo de aprendizaje automático para ver cómo responde el paciente a la inmunoterapia según el subtipo de cáncer de vejiga. Con él han descubierto que el subtipo neuronal, aun siendo el menos común de los cinco subtipos, es el que mejor responde al tratamiento. Gracias al algoritmo, han detectado que los marcadores que mejor determinan el éxito del tratamiento son el número de mutaciones introducidas por la familia de enzimas APOBEC, el número de mutaciones del tumor y la cantidad de macrófagos antiinflamatorios. También han identificado algunos marcadores en el microambiente tumoral y, gracias al gran número de pacientes, han detectado nuevas mutaciones raras que harían que el tumor fuera invisible al sistema inmunitario.

“Es importante entender los mecanismos de respuesta dentro de los diferentes subgrupos, porque hay una gran heterogeneidad tumoral» Lilian Marie Boll, primera autora del artículo

Este estudio ayuda a analizar los mecanismos de respuesta de los diferentes subtipos de cáncer de vejiga ante la inmunoterapia. Además, destaca la gran diversidad que hay en los tumores, lo que complica su tratamiento. Por eso el equipo investigador resalta la necesidad de tener una gran cantidad de datos para poder desarrollar modelos predictivos que permitan tratar los tumores individualmente.

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