{"id":51188,"date":"2026-04-22T12:07:11","date_gmt":"2026-04-22T10:07:11","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=51188"},"modified":"2026-04-28T13:21:07","modified_gmt":"2026-04-28T11:21:07","slug":"una-nova-eina-ajuda-a-identificar-que-fa-unica-cada-tipus-de-cellula-del-pancrees","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/una-nova-eina-ajuda-a-identificar-que-fa-unica-cada-tipus-de-cellula-del-pancrees\/","title":{"rendered":"Una nova eina ajuda a identificar qu\u00e8 fa \u00fanica cada tipus de c\u00e8l\u00b7lula del p\u00e0ncrees"},"content":{"rendered":"\n

Qu\u00e8 fa que una c\u00e8l\u00b7lula beta del p\u00e0ncrees sigui diferent d\u2019una delta o d\u2019una alfa? Un equip del grup d\u2019Endocrine Regulatory Genomics<\/a> del Departament de Medicina i Ci\u00e8ncies de la Vida de la Universitat Pompeu Fabra (MELIS-UPF)<\/a> ha desenvolupat SPICEY<\/strong>, una eina inform\u00e0tica que ajuda a identificar quins gens i quines regions reguladores de l\u2019ADN s\u00f3n pr\u00f2pies de cada tipus de c\u00e8l\u00b7lula<\/strong>. Aplicada als illots pancre\u00e0tics, pot ajudar a entendre millor com funciona aquest teixit en salut i diabetis.<\/p>\n\n\n\n

Les tecnologies single-cell<\/em> han revolucionat la manera d\u2019estudiar teixits complexos com el p\u00e0ncrees. En lloc d\u2019analitzar un teixit sencer en conjunt, la tecnologia single-cell permet  analitzar el material gen\u00e8tic de les c\u00e8l\u00b7lules una per una i veure millor en qu\u00e8 es diferencien. Per\u00f2 tenir m\u00e9s dades no sempre vol dir entendre-les millor, continuava faltant una manera clara de mesurar fins a quin punt un gen, o una regi\u00f3 reguladora de l\u2019ADN, \u00e9s realment espec\u00edfica d\u2019un tipus cel\u00b7lular concret<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

Aqu\u00ed \u00e9s on entra SPICEY. L\u2019eina analitza, d\u2019una banda, quins gens estan especialment actius en cada poblaci\u00f3 cel\u00b7lular i, de l\u2019altra, quines regions de la cromatina (el material gen\u00e8tic empaquetat dins del nucli) estan m\u00e9s accessibles i poden actuar com a \u201cinterruptors\u201d d\u2019aquests gens. El seu valor afegit \u00e9s que integra totes dues capes d\u2019informaci\u00f3.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Dels marcadors coneguts a nous candidats<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Aplicada a illots pancre\u00e0tics humans, SPICEY recupera marcadors coneguts de diferents poblacions cel\u00b7lulars<\/strong>, com la insulina en les c\u00e8l\u00b7lules beta del p\u00e0ncrees, o la somatostatina en les delta. Per\u00f2 tamb\u00e9 permet identificar nous candidats amb alta especificitat cel\u00b7lular<\/strong>, com l\u2019ADCYAP1<\/strong> en c\u00e8l\u00b7lules beta, que mostra una alta coher\u00e8ncia entra expressi\u00f3 i accessibilitat de la cromatina. Aix\u00f2 ajuda a connectar regions reguladores amb els seus gens diana<\/strong>, aix\u00ed com a reconstruir relacions funcionals dins de xarxes gen-reguladores especifiques de teixit.  <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u201cSPICEY neix per omplir un buit important en l\u2019an\u00e0lisi de dades single-cell: fins ara no ten\u00edem una manera clara i quantitativa de mesurar fins a quin punt l\u2019expressi\u00f3 d\u2019un gen o l\u2019activitat d\u2019un element regulador \u00e9s espec\u00edfica d\u2019un tipus cel\u00b7lular respecte als altres\u201d<\/p>Georgina Fuentes-P\u00e1ez, estudiant de doctorat i autora principal d\u2019aquest estudi.<\/cite><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Aix\u00f2 \u00e9s especialment rellevant en el cas del p\u00e0ncrees<\/strong>, perqu\u00e8 moltes variants gen\u00e8tiques associades a la diabetis es troben en regions no codificants del genoma. \u00c9s a dir, no alteren directament un gen, sin\u00f3 la seva regulaci\u00f3. Per aix\u00f2, eines com SPICEY poden ser \u00fatils per entendre millor quins mecanismes reguladors s\u00f3n importants en salut i malaltia<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

M\u00e9s enll\u00e0 del p\u00e0ncrees i la diabetis<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Tot i que l\u2019estudi se centra en illots pancre\u00e0tics, els autors expliquen que SPICEY \u00e9s una eina vers\u00e0til que es pot aplicar a altres contextos biol\u00f2gics<\/strong>. Pot ser \u00fatil en estudis de teixit sa o malalt, inflamaci\u00f3, resposta a tractaments o processos de diferenciaci\u00f3 cel\u00b7lular, sempre que hi hagi dades d\u2019expressi\u00f3 g\u00e8nica i\/o activitat reguladora en diferents tipus cel\u00b7lulars.<\/p>\n\n\n\n

L\u2019eina pot ajudar a prioritzar gens i elements reguladors amb possible rellev\u00e0ncia funcional per a futurs estudis. En un moment en qu\u00e8 la biologia genera cada vegada m\u00e9s dades detallades, eines com SPICEY recorden que el repte no \u00e9s nom\u00e9s obtenir informaci\u00f3, sin\u00f3 saber interpretar-la.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

El grup d\u2019Endocrine Regulatory Genomics de MELIS-UPF ha desenvolupat SPICEY, una eina que ajuda a identificar quins gens i quines regions reguladores de l\u2019ADN s\u00f3n pr\u00f2pies de cada tipus de c\u00e8l\u00b7lula. Aplicada als illots pancre\u00e0tics, pot ajudar a entendre millor el p\u00e0ncrees en salut i diabetis.<\/p>\n","protected":false},"author":37,"featured_media":51404,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[26],"tags":[275,261,806,273],"new-type":[35],"class_list":["post-51188","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-recerca","tag-adn","tag-bioinformatica","tag-diabetis","tag-melis-upf-ca","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/51188","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/37"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=51188"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/51188\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":51265,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/51188\/revisions\/51265"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/51404"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=51188"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=51188"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=51188"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=51188"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}