{"id":46541,"date":"2025-02-21T12:32:54","date_gmt":"2025-02-21T11:32:54","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=46541"},"modified":"2025-03-31T12:46:18","modified_gmt":"2025-03-31T10:46:18","slug":"imatge-mesoscopica-mif","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/imatge-mesoscopica-mif\/","title":{"rendered":"Imatge mesosc\u00f2pica (MIF)"},"content":{"rendered":"\n

Hi ha m\u00e9s del que sembla a primera vista al Parc de Recerca Biom\u00e8dica de Barcelona (PRBB)<\/a><\/a> – en sentit figurat i literal. Fora de la vista, a la planta -1<\/strong> de l’edifici, hi ha no nom\u00e9s un dels m\u00e9s complexes i robotitzats estabularis <\/strong>a Europa<\/a>, sin\u00f3 tamb\u00e9 dues instal\u00b7lacions d’imatge d’\u00faltima generaci\u00f3: la instal\u00b7laci\u00f3 d’imatge de mesosc\u00f2pia (MIF)<\/strong><\/a> del Laboratori Europeu de Biologia Molecular \u2013 Barcelona (EMBL Barcelona)<\/a><\/a> i la Unitat de Microsc\u00f2pia \u00d2ptica Avan\u00e7ada (ALMU)<\/strong><\/a> del Centre de Regulaci\u00f3 Gen\u00f2mica (CRG)<\/a>, situades en el mateix espai. \u00abDurant els \u00faltims 6 anys, hem ofert serveis complementaris a l’ALMU; ells ofereixen microsc\u00f2pia confocal i a escala de superresoluci\u00f3. Nosaltres oferim mesosc\u00f2pia\u00bb, afirma Gopi Shah<\/strong><\/a>, Gerent d’Iniciatives Estrat\u00e8giques d’Imatge del MIF, EMBL Barcelona.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Mesosc\u00f2pia: l’entremig<\/strong><\/strong><\/h2>\n\n\n\n

La microsc\u00f2pia <\/a><\/strong>s’ocupa de coses molt petites: mostres de mida nano a micro, com ara seccions de teixits, c\u00e8l\u00b7lules individuals, estructures subcel\u00b7lulars, org\u00e0nuls, etc. A l’altre costat de l’escala hi ha els raigs X, <\/strong>les resson\u00e0ncies magn\u00e8tiques, <\/strong>les tomografies computades<\/strong> i similars; tecnologies que associem m\u00e9s sovint amb els hospitals i que s\u00f3n \u00fatils per mirar al nivell del pacient hum\u00e0. La mesosc\u00f2pia <\/strong>representa l’escala entremig i afegeix volum.<\/p>\n\n\n\n

Els sospitosos habituals que es mostren amb sistemes de mesosc\u00f2pia s\u00f3n embrions sencers<\/a> <\/a>d’organismes model (embrions de mosca, embrions de peixos<\/a>, embrions de ratol\u00ed) o \u00f2rgans sencers d’organismes model adults, com el cervell, els pulmons, els ronyons, la melsa, els ovaris, etc.<\/p>\n\n\n\n

El tipus de mides <\/strong>que es poden veure amb la mesosc\u00f2pia van des d’uns pocs centenars de micres fins a uns pocs cent\u00edmetres<\/strong>, amb algunes excepcions. \u00abHem pogut visualitzar el creixement i el desenvolupament d’organoides <\/a><\/strong> vius i altres models in vitro<\/em> que s’han desenvolupat en els \u00faltims anys. Tenen una mida d’uns quants centenars de micres, per la qual cosa s\u00f3n m\u00e9s petits de l’habitual per a la mesosc\u00f2pia, per\u00f2 \u00e9s dif\u00edcil obervar-los amb altres microscopis (confocals, de superresoluci\u00f3) ja que s\u00f3n mostres 3D <\/strong>i densament empaquetades. Per aix\u00f2 els nostres sistemes s\u00f3n \u00fatils per a aquests organoides, ja que ens permeten veure mostres des de m\u00faltiples direccions i reconstruir un volum 3D complet. A m\u00e9s, investigadors de l’Institut de Ci\u00e8ncies del Mar (ICM \u2013 CSIC)<\/a> ens porten mostres de 20-50 micres, i tot i aix\u00ed encara aconseguim tractar-les amb alguns dels nostres sistemes\u00bb, explica Gopi.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n
\"\"
Pila d’imatges 3D d’un pescoide (un gastruloide derivat de c\u00e8l\u00b7lules embrion\u00e0ries de peixos). La mostras i les imatges s\u00f3n de Nick Marschlich (Trivedi lab, EMBL Barcelona); el processament de dades i el seguiment cel\u00b7lular van ser realitzats per Nicola Gritti del MIF.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

El MIF est\u00e0 obert a tothom<\/strong>, ja que rep finan\u00e7ament b\u00e0sic del Laboratori Europeu de Biologia Molecular, la major infraestructura europea de Ci\u00e8ncies de la Vida. \u00abEstem encantats de treballar amb usuaris i institucions molt diversos, des de col\u00b7legues de l’EMBL fins als nostres ve\u00efns del PRBB, laboratoris, hospitals o socis de la ind\u00fastria a Barcelona i m\u00e9s enll\u00e0. El nostre principal objectiu \u00e9s donar un servei d’avantguarda a la comunitat cient\u00edfica\u00bb, afirma la gerent del MIF.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

El nostre principal objectiu \u00e9s donar un servei d’avantguarda a la comunitat cient\u00edfica, vingui d’on vingui.<\/em><\/p>Gopi Shah<\/em><\/strong>, Gerent d’Iniciatives Estrat\u00e8giques d’Imatge, MIF, EMBL Barcelona<\/em><\/cite><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Pel que fa al cost, afegeix: \u00abFins ara, no hem cobrat per utilitzar la instal\u00b7laci\u00f3. Cada nou sistema necessita moltes proves, i els usuaris ens han ajudat amb aix\u00f2. Per tant, actualment estem gestionant la instal\u00b7laci\u00f3 amb un enfocament col\u00b7laboratiu<\/strong> i en el futur els nostres serveis podran ser amb preus assequibles. Estem compromesos a construir col\u00b7laboracions i oferir un servei d’imatge d’avantguarda a tants laboratoris com sigui possible\u00bb.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Diferents microscopis i diferents t\u00e8cniques<\/strong><\/strong><\/h2>\n\n\n\n

La microsc\u00f2pia de fluoresc\u00e8ncia de l\u00e0mina de llum <\/strong>(LSFM, tamb\u00e9 anomenada microsc\u00f2pia d’il\u00b7luminaci\u00f3 plana selectiva <\/strong>o SPIM)<\/strong><\/a> \u00e9s el principal tipus d’imatge que es fa a la instal\u00b7laci\u00f3. Disposen de 2 equips casolans i 3 comercials<\/strong>, cadascun amb aplicacions diferents. Els casolans es poden personalitzar per a coses que no es poden fer amb els comercials. Observen mostres grans com un embri\u00f3 de ratol\u00ed sencer o fins i tot el cervell d’un ratol\u00ed adult <\/a> amb una resoluci\u00f3 d’una sola c\u00e8l\u00b7lula<\/strong>. \u00abTamb\u00e9 utilitzem aquests sistemes per obtenir imatges d’organoides vius<\/a><\/strong>: pots fer imatges durant dies i els organoides estan c\u00f2modes all\u00e0!\u00bb, explica Gopi.<\/p>\n\n\n\n

La tomografia de projecci\u00f3 \u00f2ptica (OPT), <\/strong>una altra de les t\u00e8cniques que ofereixen, utilitza una font de llum i una c\u00e0mera, posant la mostra entremig. Funciona fent girar la mostra 1 grau cada vegada<\/strong> i fent una foto. Aix\u00ed, s’acaba amb imatges de 360\u00b0 i es pot reconstruir l’objecte 3D<\/strong> de la mateixa manera que un sistema de raigs X en una cl\u00ednica permet als metges fer una reconstrucci\u00f3 3D dels teus ossos. Aquests s\u00f3n \u00fatils per a mostres m\u00e9s grans, i la instal\u00b7laci\u00f3 posseeix dues m\u00e0quines OPT, una comercial i una altra casolana<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

Un tercer tipus de tecnologia que tenen a la instal\u00b7laci\u00f3 \u00e9s l’holotomografia: <\/strong>permet obtenir imatges en directe <\/strong>de cultius cel\u00b7lulars en una placa i l\u00e0mines planes de c\u00e8l\u00b7lules que no necessiten etiquetes (ni colorants ni etiquetes fluorescents), ja que utilitza el contrast inherent<\/strong> que prov\u00e9 del fet que cada compartiment d’una c\u00e8l\u00b7lula t\u00e9 un \u00edndex de refracci\u00f3 diferent. Aix\u00ed es poden veure els org\u00e0nuls dins de les c\u00e8l\u00b7lules<\/strong>. L’\u00fanica limitaci\u00f3 \u00e9s que nom\u00e9s pot capturar una profunditat de 30 micres.<\/p>\n\n\n\n

Tots aquests sistemes d’imatge permeten diferents maneres de visualitzar les mostres, ja siguin vives o tractades.<\/p>\n\n\n\n

\u00abPodem fer aclariment <\/em>de teixits<\/strong>, que \u00e9s una t\u00e8cnica per aprofundir en una mostra; s’apliquen productes qu\u00edmics perqu\u00e8 es torni transparent i uniforme en el seu \u00edndex de refracci\u00f3\u00bb, explica Gopi, que afegeix que aix\u00f2 \u00e9s \u00fatil per veure un \u00f2rgan de ratol\u00ed sencer o fins i tot un ratol\u00ed adult sencer. \u00abEs pot disseccionar un \u00f2rgan, fer l’etiquetatge, fer l’aclariment de teixits amb els reactius qu\u00edmics i mirar-lo amb microsc\u00f2pia de l\u00e0mina de llum o OPT\u00bb. L’holotomografia \u00e9s l’\u00fanica que no es pot utilitzar per a mostres ‘aclarides’.<\/p>\n\n\n\n

A m\u00e9s dels seus microscopis i t\u00e8cniques especialitzades, disposen d’alguns equips m\u00e9s habituals, com un microscopi d’epifluoresc\u00e8ncia<\/strong> per executar un time-lapse<\/em>, o per comprovar si l’etiquetatge de les mostres ha funcionat correctament, una campana de cultiu de teixits<\/strong> per si es necessita alguna petita manipulaci\u00f3, i una zona de laboratori <\/strong>on els usuaris poden preparar les seves mostres si cal.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Un proc\u00e9s pas a pas<\/strong><\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Normalment, quan un usuari o usu\u00e0ria est\u00e0 interessat a utilitzar la instal\u00b7laci\u00f3, se segueix un proc\u00e9s de 3 passos:<\/p>\n\n\n\n

  1. Reuni\u00f3\/consulta <\/strong>on els investigadors expliquen qu\u00e8 volen aconseguir. El personal de la instal\u00b7laci\u00f3 els mostra el que tenen i discuteix qu\u00e8 \u00e9s possible i qu\u00e8 \u00e9s el m\u00e9s adequat per a la tasca.<\/li><\/ol>\n\n\n\n