{"id":45476,"date":"2025-01-17T09:52:15","date_gmt":"2025-01-17T08:52:15","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=45476"},"modified":"2025-03-31T12:51:37","modified_gmt":"2025-03-31T10:51:37","slug":"una-mirada-microscopica-a-levolucio-marina","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/una-mirada-microscopica-a-levolucio-marina\/","title":{"rendered":"Una mirada microsc\u00f2pica a l\u2019evoluci\u00f3 marina"},"content":{"rendered":"\n

Daniel Richter<\/strong> va sentir a parlar d\u2019evoluci\u00f3<\/strong> per primer cop amb tretze anys i li va encantar. Tant \u00e9s aix\u00ed que, tot i no tenir clar si volia ser cient\u00edfic, va estudiar les carreres de Biologia i Programaci\u00f3<\/strong> a Estats Units. Va treballar de programador en una instituci\u00f3 centrada en biologia evolutiva, i al cap d\u2019uns anys es va animar a fer un doctorat. La seva tesi era sobre els primers passos de l\u2019evoluci\u00f3 dels animals<\/a>, per\u00f2 d\u2019aquest punt en la hist\u00f2ria de l\u2019evoluci\u00f3 no hi ha registre f\u00f2ssil. Aix\u00ed que el que calia fer era comparar organismes vius com els animals amb els seus cosins vius m\u00e9s propers: els coanoflagel\u00b7lats<\/a>, un dels molts grups de protists. <\/p>\n\n\n\n

Ara \u00e9s l\u2019investigador principal del Laboratori de Biologia i Ecologia de Protists Abundants (BEAP Lab<\/a>)<\/strong> de l\u2019Institut de Biologia Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a>. El grup d\u2019investigaci\u00f3, de tan sols tres anys, est\u00e0 compost per investigadors i investigadores de perfils diversos, des de la bioinform\u00e0tica fins la biologia cel\u00b7lular<\/strong>. Tamb\u00e9 s\u00f3n diversos els seus pa\u00efsos d\u2019origen: Estats Units, It\u00e0lia, Espanya, Ucra\u00efna, Portugal, Gr\u00e8cia i Fran\u00e7a<\/strong>.  <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Una caixa negra dins del mar<\/h2>\n\n\n\n

Els protists <\/strong>s\u00f3n els grans desconeguts dins el grup dels eucariotes<\/a>, que inclou tamb\u00e9 animals, fongs i plantes<\/strong>. Aquests organismes unicel\u00b7lulars i colonials s\u00f3n molt abundants <\/strong>a l\u2019oce\u00e0<\/strong>, on un 95% de les esp\u00e8cies encara es desconeixen. <\/p>\n\n\n\n

L\u2019objectiu del grup liderat per Richter \u00e9s a\u00efllar i cultivar esp\u00e8cies noves dins els 500 protists m\u00e9s abundants<\/strong> del mar i comprendre com van evolucionar <\/strong>i com es relacionen <\/strong>entre ells i amb l\u2019ambient. Treballen amb una base de dades d\u2019ADN<\/strong> dels organismes que hi ha en mostres d\u2019aigua <\/strong>per\u00f2 sense saber quin organisme \u00e9s quin. Per aix\u00f2, cal identificar quin ADN pertany a cada protist, i ho fan a trav\u00e9s de cultius d\u2019aigua<\/strong>. Com que els protists hi abunden, dilueixen l\u2019aigua i hi fan cr\u00e9ixer els organismes que hi ha, identificant-los despr\u00e9s mirant pel microscopi. <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u201cEl nostre estudi \u00e9s com un casament entre l\u2019evoluci\u00f3 i l\u2019ecologia d\u2019organismes desconeguts.\u201d<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Per desxifrar <\/strong>el rol ecol\u00f2gic<\/strong> de cada esp\u00e8cie, seq\u00fcencien el genoma <\/strong>i el transcriptoma<\/strong>, que \u00e9s el conjunt de gens que s\u2019expressa en un moment determinat. Amb m\u00e8todes bioinform\u00e0tics <\/strong>analitzen patrons <\/strong>en l\u2019expressi\u00f3 g\u00e8nica per trobar-hi interaccions, respostes a canvis ambientals… I per la part d’evoluci\u00f3, la computaci\u00f3 \u00e9s igual d\u2019important: estudien fam\u00edlies de gens, dominis proteics i processos biol\u00f2gics<\/strong> tot buscant reconstruir la hist\u00f2ria evolutiva<\/strong>.  <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n
\"\"<\/figure><\/div>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

L’oce\u00e0 a la inversa<\/h2>\n\n\n\n

Les mostres <\/strong>amb qu\u00e8 treballen acostumen a ser d\u2019aigua<\/strong> recollida per altres grups de recerca en campanyes d\u2019investigaci\u00f3 marina<\/strong>. Com que estan en contacte amb l\u2019Institut de Ci\u00e8ncies del Mar (ICM)<\/a>, poden obtenir mostres de diverses regions, des de l\u2019Ant\u00e0rtida fins a llocs propers com Blanes. La seva darrera expedici\u00f3, per\u00f2, la van planificar d\u2019una manera especial: amb simulacions a la inversa<\/strong>. Necessitaven aigua del centre de l\u2019oce\u00e0, per\u00f2 el cost d\u2019un dia en un vaixell oceanogr\u00e0fic<\/strong> oscil\u00b7la entre els 10.000 i els 50.000 euros<\/strong>. Aix\u00ed doncs, van decidir fer l\u2019expedici\u00f3 a una illa que reb\u00e9s corrents d\u2019aquestes zones centrals. Utilitzant models que, en comptes de seguir el cam\u00ed de les part\u00edcules a l\u2019oce\u00e0, mostraven el seu origen, van descobrir que Grenada<\/strong>, al Carib, era on arribaven m\u00e9s part\u00edcules del mig de l’Atl\u00e0ntic<\/strong>. L\u2019aigua d\u2019all\u00e0 \u00e9s ben especial, ja que prov\u00e9 d\u2019un ecosistema molt diferent i amb pocs nutrients, a difer\u00e8ncia de l\u2019aigua costaner del Mediterrani.  <\/p>\n\n\n\n

A l\u2019illa de Grenada van prendre mostres de molts protists<\/strong>; per\u00f2 curiosament l\u2019esp\u00e8cie m\u00e9s abundant<\/strong> \u00e9s d\u2019aqu\u00ed, del Mediterrani<\/strong>, tot i que \u00e9s \u00e0mpliament present, ja que \u201cels organismes m\u00e9s abundants s\u00f3n a tot arreu, s\u00f3n ubiq\u00fcistes\u201d. Sorprenentment es tracta d\u2019una potencial nova esp\u00e8cie  del grup dels dinoflagel\u00b7lats, que va ser a\u00efllada pel Grup de processos Biol\u00f2gics Litorals<\/a>, de l\u2019ICM.<\/p>\n\n\n\n

Tamb\u00e9 resulta interessant el lloc on fan cr\u00e8ixer alguns dels protists que tenen al laboratori, unes neveres ben particulars. \u201cUn dia, esmorzant, em vaig fixar en una nevera de pastissos<\/strong>. S\u00f3n transparents, estan il\u00b7luminades i els pots regular la temperatura\u201d. \u00c9s aix\u00ed com en Daniel es va inspirar per les noves neveres del seu laboratori: neveres de pastisseria<\/strong> que els permeten mantenir les mostres amb la llum natural que els arriba i amb un preu de cost molt m\u00e9s econ\u00f2mic.  <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n
\"\"<\/figure><\/div>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

Una particular filosofia de recerca<\/h2>\n\n\n\n

Un dels desitjos del BEAP Lab \u00e9s que el que fan sigui \u00fatil per a la comunitat<\/strong>, a m\u00e9s de canviar la cultura de la recerca<\/strong>. Per aquesta ra\u00f3, posen a l\u2019abast de tothom<\/strong> els seus recursos<\/strong><\/a>: cultius, codi<\/a>, protocols <\/a>i dades generades. I aquesta forma de fer ci\u00e8ncia oberta<\/strong><\/a>, de retruc, tamb\u00e9 els ajuda a ells: \u201cSi ja saps que el que far\u00e0s s’ha de compartir amb la comunitat, ja ho fas millor d\u2019entrada i aix\u00f2 implica que \u00e9s millor per a la resta per\u00f2 tamb\u00e9 per a tu mateix\u201d. Membres de la comunitat cient\u00edfica ja han agra\u00eft i utilitzat les seves dades arreu del m\u00f3n: Jap\u00f3, Estats Units, Fran\u00e7a, It\u00e0lia, Anglaterra… de manera que seguiran posant el seu granet de sorra perqu\u00e8 la seva feina estigui disponible per a tothom, ja que \u201ctot el que generem \u00e9s gr\u00e0cies a finan\u00e7ament p\u00fablic, al capdavall\u201d. <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Ci\u00e8ncia oberta: \u00abSi ja saps que el que far\u00e0s s’ha de compartir amb la comunitat, ja ho fas millor d\u2019entrada\u00bb
Daniel Richter <\/strong>(IBE)<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

A m\u00e9s de gestionar tota la recerca i l\u2019administraci\u00f3 del laboratori, en Daniel forma part del Comit\u00e8 de Diversitat<\/strong> de l\u2019IBE<\/a>. Una de les darreres accions que s’ha emp\u00e8s ha estat elaborar un pla de diversitat<\/strong>, ja que al ser un institut d\u2019investigaci\u00f3 coordinat per dos centres (la UPF i el CSIC), calia unificar protocols. \u201cA vegades el que fem suposa un canvi molt petitet, per\u00f2 cal anar impulsant aquests canvis\u201d. Unir esfor\u00e7os \u00e9s clau, i el cap de grup tamb\u00e9 forma part del Comit\u00e8 EDI del PRBB<\/a>, on representa a l\u2019IBE. <\/p>\n\n\n\n

Per acabar, amb un somriure, en Daniel explica la seva filosofia de laboratori<\/strong>: \u201c\u00c9s una idea una mica boja, o potser molt senzilla; intentem fer el millor per a tothom al dia a dia<\/strong>.\u201d Malgrat que a vegades no tingui temps de respondre tots els correus que li arriben, perqu\u00e8 \u201cquan arribes a investigador principal portes 20 anys de formaci\u00f3 per ser cient\u00edfic i 0 anys per coses administratives\u201d, el reconforta pensar que, tot i ser un repte molt gran, des del BEAP Lab ajuden una miqueta cada dia que el m\u00f3n sigui millor<\/strong>. <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n
\"\"<\/figure><\/div>\n\n\n\n
<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

El laboratori liderat per Daniel Richter a l\u2019IBE estudia els protists m\u00e9s abundants de l\u2019oce\u00e0 per comprendre la seva evoluci\u00f3 i ecologia. El laboratori posa especial atenci\u00f3 en com aquests organismes es relacionen amb el seu entorn i \u00e9s un gran defensor de la ci\u00e8ncia oberta.<\/p>\n","protected":false},"author":33,"featured_media":45477,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[26],"tags":[269,489,289,211,480,291],"new-type":[38,35],"class_list":["post-45476","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-recerca","tag-biologia-cellular","tag-ciencia-oberta","tag-genoma","tag-ibe-csic-upf","tag-microorganismes","tag-perfil-de-grup","new-type-a-fons","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/45476","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/33"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=45476"}],"version-history":[{"count":11,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/45476\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":46290,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/45476\/revisions\/46290"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/45477"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=45476"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=45476"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=45476"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=45476"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}