{"id":32968,"date":"2022-10-17T11:09:45","date_gmt":"2022-10-17T09:09:45","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=32968"},"modified":"2023-01-03T17:51:51","modified_gmt":"2023-01-03T16:51:51","slug":"arrenca-el-barcelona-collaboratorium-for-modelling-and-predictive-biology","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/arrenca-el-barcelona-collaboratorium-for-modelling-and-predictive-biology\/","title":{"rendered":"Arrenca el \u00abBarcelona Collaboratorium for modelling and predictive biology\u00bb"},"content":{"rendered":"\n

Una nova manera de fer ci\u00e8ncia sorgeix a Barcelona<\/strong>. El ‘Barcelona Collaboratorium for Modeling and Predictive Biology<\/strong><\/a>‘, una iniciativa conjunta del Centre de Regulaci\u00f3 Gen\u00f2mica (CRG)<\/a> i el Laboratori Europeu de Biologia Molecular \u2013 Barcelona (EMBL Barcelona)<\/a> es va inaugurar a principis d’octubre al PRBB amb el Simposi de llan\u00e7ament ‘Programmable Life<\/a>‘ . Ocupant una planta sencera de l’edifici de la Fundaci\u00f3 Pasqual Maragall (FPM), pret\u00e9n ser un espai per a l’enginyeria biol\u00f2gica a Barcelona<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

El perqu\u00e8 i el com del Barcelona Collaboratorium<\/h2>\n\n\n\n

A la reuni\u00f3 d’inauguraci\u00f3 a l’auditori del Parc de Recerca Biom\u00e8dica de Barcelona (PRBB)<\/a><\/a>, l’investigador del CRG Ben Lehner<\/strong>, un dels motors de la creaci\u00f3 del Collaboratorium, va explicar el perqu\u00e8<\/strong> d’aquesta idea.<\/p>\n\n\n\n

\u201cEls humans ens hem tornat incre\u00efblement bons en enginyeria. Per\u00f2 encara no sabem com dissenyar una cosa tan notable com un guepard, que pot passar de 0 a 100 km en 3 segons, i es pot construir a si mateix, i reproduir-se. En realitat, ni tan sols sabem com dissenyar teixits<\/strong>. O c\u00e8l\u00b7lules. O fins i tot, f\u00e0cilment, prote\u00efnes\u201d, va comen\u00e7ar Lehner.<\/p>\n\n\n\n

Per\u00f2 ho arribarem a fer, va continuar el jove cient\u00edfic. I per aconseguir-ho necessitarem moltes dades<\/strong>, que ja estem acumulant en grans quantitats. Des que va crear el seu laboratori, va dir com a exemple, la seq\u00fcenciaci\u00f3 d’un genoma ha passat de costar mil milions de d\u00f2lars a 200 d\u00f2lars.<\/p>\n\n\n\n

No obstant, les dades per si soles no s\u00f3n suficients<\/strong>. La biologia \u00e9s tan complexa <\/strong>que hi ha m\u00e9s maneres diferents de fer una prote\u00efna de 100 amino\u00e0cids que \u00e0toms a l’univers. Aix\u00f2 significa que \u00e9s pr\u00e0cticament impossible provar totes les combinacions experimentalment o fins i tot examinar aquest espai computacionalment de manera exhaustiva. El que necessitem s\u00f3n models generatius<\/strong>. \u00abI aix\u00f2 nom\u00e9s \u00e9s per a l’estructura m\u00e9s simple\u00bb, va continuar el bi\u00f2leg. \u201cSi anem a c\u00e8l\u00b7lules, \u00f2rgans\u2026 l’espai combinatori \u00e9s enorme. Necessitem molts m\u00e9s models, de tota mena, per fer que la biologia sigui predictiva\u201d. I ha de passar aqu\u00ed: a Europa, a Barcelona. Per aix\u00f2 la creaci\u00f3 del Collaboratorium.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u201c<\/em>Tenim grans quantitats de dades biol\u00f2giques d’alta qualitat disponibles, per\u00f2 no tenim eines te\u00f2riques i computacionals que ajudin a explicar i predir la biologia complexa\u00ab<\/em>
Ben Lehner <\/strong>(CRG)<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

James Sharpe,<\/strong> l’altre cervell darrere d’aquest nou projecte, va continuar explicant com planegen aconseguir-ho.<\/p>\n\n\n\n

En poques paraules, es basa en una nova manera dorganitzar la ci\u00e8ncia<\/strong>; en lloc d’una estructura fixa en laboratoris separats, amb investigadors principals, postdoctorats, doctorands, etc. busquen una estructura col\u00b7laborativa m\u00e9s fluida<\/strong>. Tamb\u00e9 volen fomentar la mobilitat<\/strong>, per la qual cosa preveuen que la meitat de les persones que treballin al Collaboratorium siguin cient\u00edfics o cient\u00edfiques visitants o de sab\u00e0tic<\/strong>, que hi passarien uns mesos i tindrien una relaci\u00f3 de mentoria amb la resta del personal m\u00e9s estable. Per tant, hi haur\u00e0 convocat\u00f2ries anuals<\/strong> obertes per portar aquests experts i expertes l\u00edders mundials a treballar sota un mateix sostre, en col\u00b7laboraci\u00f3 amb el personal local.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Col\u00b7laboraci\u00f3 per tot arreu<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

\u00abTot i que el Collaboratorium no estar\u00e0 f\u00edsicament al PRBB, no est\u00e0 tan lluny, nom\u00e9s a 10 minuts a peu, aix\u00ed que esperem que la interacci\u00f3 amb la resta de la comunitat aqu\u00ed al PRBB sigui molt important<\/strong>\u201d, va afegir Sharpe, referint-se al parc on tant CRG com EMBL estan ubicats. I tamb\u00e9 volen iniciar col\u00b7laboracions amb altres centres de Barcelona<\/strong>, \u200b\u200baix\u00ed com convertir-se en un referent mundial en aquest tipus de ci\u00e8ncia, basada no en laboratoris r\u00edgids sin\u00f3 en visitants que hi van i v\u00e9nen, albergant grans ments que interactuen entre si.<\/p>\n\n\n\n

Pel que fa als temes a tractar, no posen l\u00edmits; seran tan variats com el personal investigador participant vulgui que ho siguin.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u201cVolem permetre l’estudi des de les mol\u00e8cules fins als ecosistemes, amb una fertilitzaci\u00f3 creuada d’ideess\u201d
James Sharpe <\/strong>(EMBL-Barcelona)<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

A m\u00e9s dels models te\u00f2rics que s’espera que surtin del Collaboratorium, hi ha previst planificat un simposi anual<\/strong>, que es basar\u00e0 en els temes que proposi la pr\u00f2pia comunitat, a m\u00e9s de tallers <\/strong>i altres esdeveniments.<\/p>\n\n\n\n

La iniciativa t\u00e9 prevista una durada m\u00ednima de cinc anys<\/strong> per comen\u00e7ar, i est\u00e0 cofinan\u00e7ada pel CRG, l’EMBL Barcelona, \u200b\u200bla Generalitat de Catalunya, el Ministeri de Ci\u00e8ncia i Innovaci\u00f3 d’Espanya i el programa ‘Centre d’Excel\u00b7l\u00e8ncia Severo Ochoa’ del CRG .<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

La iniciativa Barcelona Collaboratorium t\u00e9 com a objectiu fomentar una nova manera de fer ci\u00e8ncia per crear models generatius que ajudin a predir i dissenyar la biologia.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":32951,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[26],"tags":[309,307,265,279,430],"new-type":[38,35],"class_list":["post-32968","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-recerca","tag-biologia-de-sistemes","tag-biologia-sintetica","tag-crg-ca","tag-embl-barcelona-ca","tag-modelatge-de-teixits","new-type-a-fons","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32968","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=32968"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32968\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":32972,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32968\/revisions\/32972"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/32951"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=32968"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=32968"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=32968"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=32968"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}