{"id":32354,"date":"2022-09-12T10:33:35","date_gmt":"2022-09-12T08:33:35","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=32354"},"modified":"2022-09-12T18:02:42","modified_gmt":"2022-09-12T16:02:42","slug":"la-vida-dinamica-dels-ribosomes-per-ivan-milenkovic","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/la-vida-dinamica-dels-ribosomes-per-ivan-milenkovic\/","title":{"rendered":"La vida din\u00e0mica dels ribosomes, per Ivan Milenkovic"},"content":{"rendered":"\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Aquest text ha estat escrit per <strong>Ivan Milenkovic<\/strong>, estudiant de doctorat al laboratori dirigit per l&#8217;<a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/eva-maria-novoa-crg-es-meravellos-trobar-respostes-als-misteris-que-ens-fascinen\/\" target=\"_blank\">Eva Novoa<\/a> al <a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"http:\/\/www.crg.eu\/\" target=\"_blank\">Centre de Regulaci\u00f3 Gen\u00f2mica (CRG)<\/a>. L&#8217;Ivan ha guanyat <a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/ciencia-en-quatre-minuts-per-a-tots-els-publics\/\" target=\"_blank\">el primer premi del concurs de divulgaci\u00f3 cient\u00edfica Rin4\u2032<\/a> amb la seva presentaci\u00f3 <a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=w2J89dvwUd0&amp;t=1s\" target=\"_blank\">\u201c<strong>La vida din\u00e0mica dels ribosomes<\/strong>\u201d<\/a>. En aquest article, ens parla de la seva recerca sobre els ribosomes, org\u00e0nuls cel\u00b7lulars involucrats en la formaci\u00f3 de les prote\u00efnes i que, fins fa relativament poc, es pensava que eren est\u00e0tics i uniformes en tots els teixits. L&#8217;Ivan tamb\u00e9 comparteix la seva experi\u00e8ncia com a estudiant de doctorat fins ara.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Tamb\u00e9 podeu llegir una entrevista que li van fer des de la UPF <a href=\"https:\/\/www.upf.edu\/web\/focus\/entrevistes\/-\/asset_publisher\/QRfEaDqGjjbO\/content\/id\/259598244\/maximized#.Yx7W-XZByUk\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">aqu\u00ed<\/a>.<\/p>\n\n\n\n<hr class=\"wp-block-separator\"\/>\n\n\n\n<div style=\"height:30px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">L&#8217;objectiu del meu projecte \u00e9s <strong>comprendre el paper biol\u00f2gic de l&#8217;heterogene\u00eftat dels ribosomes<\/strong>. Durant molt de temps hem pensat que els ribosomes \u2013les m\u00e0quines moleculars responsables de la s\u00edntesi de prote\u00efnes en tots els \u00e9ssers vius\u2013 tendeixen a ser uniformes, amb una composici\u00f3 est\u00e0tica que \u00e9s id\u00e8ntica en tots els teixits del nostre cos. Tot i aix\u00f2, recentment s&#8217;ha descobert que l&#8217;estructura dels ribosomes pot ser molt m\u00e9s heterog\u00e8nia, i que aquesta heterogene\u00eftat pot ser espec\u00edfica de cada teixit o etapa de desenvolupament. En la meva tesi, jo tracto d&#8217;entendre si aquesta diversitat estructural implica una funci\u00f3 especialitzada.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Algunes prote\u00efnes ribos\u00f2miques tenen <strong>par\u00e0legs<\/strong>, \u00e9s a dir, prote\u00efnes que provenen d&#8217;un gen ancestral que es va duplicar durant l&#8217;evoluci\u00f3. Hem descobert que una prote\u00efna ribosomal anomenada RPL3L nom\u00e9s s&#8217;expressa i s&#8217;incorpora als ribosomes als m\u00fasculs estriats, a difer\u00e8ncia de la seva par\u00e0loga, RPL3, que s&#8217;expressa en tots els altres teixits. En generar un <a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/els-animals-en-la-recerca-biomedica\/\" target=\"_blank\">model de ratol\u00ed<\/a><em> knockout<\/em> de Rpl3l (un ratol\u00ed que no t\u00e9 el gen Rpl3l), hem identificat que <strong>en abs\u00e8ncia de RPL3L, RPL3 s&#8217;expressa tamb\u00e9 als m\u00fasculs estriats i compensa la p\u00e8rdua del seu par\u00e0leg<\/strong>. A m\u00e9s, hem trobat que les interaccions ribosoma-mitocondri canvien depenent de quina prote\u00efna s&#8217;incorpori al ribosoma, cosa que suggereix que l&#8217;elecci\u00f3 del par\u00e0leg de la prote\u00efna ribos\u00f2mica pot afectar la funci\u00f3 del ribosoma.<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:32px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"aligncenter size-large\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"418\" height=\"277\" src=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2022\/09\/ribosomes.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-32200\" srcset=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2022\/09\/ribosomes.png 418w, https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2022\/09\/ribosomes-338x224.png 338w\" sizes=\"auto, (max-width: 418px) 100vw, 418px\" \/><figcaption>Rpl3 i Rpl3l s\u00f3n par\u00e0legs, \u00e9s a dir, gens molt similars perqu\u00e8 procedeixen d&#8217;una duplicaci\u00f3 del mateix gen i de la seva posterior diverg\u00e8ncia.<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n<div style=\"height:32px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">L&#8217;heterogene\u00eftat del ribosoma tamb\u00e9 pot provenir de l&#8217;ARNr, especialment de les <a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/les-modificacions-de-larn-possibles-biomarcadors-de-deteccio-de-la-progressio-del-cancer\/\" target=\"_blank\">modificacions de l&#8217;ARNr<\/a>. Al laboratori hem desenvolupat un <a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/les-modificacions-de-larn-possibles-biomarcadors-de-deteccio-de-la-progressio-del-cancer\/\" target=\"_blank\">m\u00e8tode per a estudiar les modificacions de l&#8217;ARN<\/a> mitjan\u00e7ant la <strong>seq\u00fcenciaci\u00f3 de mol\u00e8cules d&#8217;ARN nadives utilitzant la plataforma tecnol\u00f2gica Oxford Nanopore<\/strong>. Hem seq\u00fcenciat l&#8217;ARNr de diversos teixits de ratol\u00ed en diferents etapes de desenvolupament i hem descobert que diversos nucle\u00f2tids es modifiquen de forma din\u00e0mica, tant a nivell de teixits com d&#8217;etapes de desenvolupament.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">En conjunt, aquests resultats coincideixen amb diversos estudis dels darrers anys que descriuen <strong>els ribosomes<\/strong> <strong>com a mol\u00e8cules molt m\u00e9s din\u00e0miques del que es pensava<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:25px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n<style>.embed-container { position: relative; padding-bottom: 56.25%; height: 0; overflow: hidden; max-width: 100%; } .embed-container iframe, .embed-container object, .embed-container embed { position: absolute; top: 0; left: 0; width: 100%; height: 100%; }<\/style>\n<div class=\"embed-container\"><iframe src=\"https:\/\/www.youtube.com\/embed\/w2J89dvwUd0\" frameborder=\"0\" allowfullscreen=\"\"><\/iframe><\/div>\n\n\n\n<div style=\"height:57px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">Inform\u00e0tica i laboratori, un repte apassionant<\/h2>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Actualment estic al quart any del meu doctorat. El principal repte fins ara ha estat <strong>aprendre bioinform\u00e0tica <strong>alhora<\/strong><\/strong> <strong>que feia experiments<\/strong>. Com que la meva formaci\u00f3 \u00e9s en bioqu\u00edmica, gaireb\u00e9 no tenia experi\u00e8ncia en bioinform\u00e0tica quan vaig comen\u00e7ar el meu doctorat. No obstant aix\u00f2, la meva supervisora, l&#8217;<a rel=\"noopener noreferrer\" href=\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/eva-maria-novoa-crg-es-meravellos-trobar-respostes-als-misteris-que-ens-fascinen\/\" target=\"_blank\">Eva Novoa<\/a>, <strong>anima tots i totes les estudiants de doctorat a participar tant al laboratori experimental com a la part bioinform\u00e0tica<\/strong>, aix\u00ed que des dels meus primers dies al laboratori vaig estar immers en aquest entorn que em va ajudar a treballar a tots dos en paral\u00b7lel. Aix\u00f2 ha estat el m\u00e9s gratificant, ja que gaudeixo molt participant en totes les etapes del projecte: des dels primers dissenys experimentals fins a les darreres an\u00e0lisis bioinform\u00e0tiques i la visualitzaci\u00f3!<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:66px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n\n\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\"><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>L&#8217;estudiant de doctorat del CRG Ivan Milenkovic ens parla de la seva recerca sobre els ribosomes. La seva explicaci\u00f3 de 4 minuts el va portar a guanyar el concurs de divulgaci\u00f3 Rin 4\u2032.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":32340,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[30],"tags":[269,265,515,657],"new-type":[35],"class_list":["post-32354","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia-i-societat","tag-biologia-cellular","tag-crg-ca","tag-divulgacio","tag-doctorat","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32354","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=32354"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32354\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":32407,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/32354\/revisions\/32407"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/32340"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=32354"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=32354"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=32354"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=32354"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}