{"id":28447,"date":"2022-03-14T13:55:11","date_gmt":"2022-03-14T12:55:11","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=28447"},"modified":"2022-03-25T10:21:55","modified_gmt":"2022-03-25T09:21:55","slug":"genigma-el-joc-que-ajuda-a-la-recerca-contra-el-cancer","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/genigma-el-joc-que-ajuda-a-la-recerca-contra-el-cancer\/","title":{"rendered":"Genigma: el joc que ajuda a la recerca contra el c\u00e0ncer"},"content":{"rendered":"\n

Genigma <\/strong>\u00e9s un experiment de ci\u00e8ncia ciutadana per explorar el genoma hum\u00e0 de manera col\u00b7laborativa<\/a><\/strong>. Per involucrar la ciutadania a la investigaci\u00f3, s’ha creat una app per a dispositius m\u00f2bils que permet analitzar les dades del genoma de les c\u00e8l\u00b7lules canceroses per determinar-ne l’ordre de les seq\u00fc\u00e8ncies i les anomalies<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Elisabetta Broglio<\/strong>, facilitadora de projectes de ci\u00e8ncia ciutadana al Centre de Regulaci\u00f3 Gen\u00f2mica (CRG)<\/a> i project manager de Genigma, ens n’explica m\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Elisabetta Broglio, facilitadora de projectes de ci\u00e8ncia ciutadana al CRG i project manager de Genigma.<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

Com sorgeix la idea de crear aquest projecte?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

La idea original neix de dos postdocs, Marco di Stefano i Juan Rodr\u00edguez<\/strong>, del CNAG-CRG, que el 2019 treballaven al Structural Genomics Group liderat per Marc Mart\u00ed-Renom<\/a><\/strong>. En el treball diari d’an\u00e0lisi del genoma en 3D sempre recorrien a uns ajustaments manuals<\/strong> per afinar alguns par\u00e0metres que els algorismes no eren capa\u00e7os de definir b\u00e9.<\/p>\n\n\n\n

Aquests ajustaments a l’ordinador eren una tasca essencialment visual i de l\u00f2gica<\/strong>, per la qual cosa es van plantejar la idea de convertir-la en un joc per involucrar la gent i accelerar la investigaci\u00f3<\/strong>. Van aplicar llavors a la convocat\u00f2ria<\/a> llan\u00e7ada pel projecte ORION Open Sience<\/a> i es van posar en contacte amb mi perqu\u00e8 els assessor\u00e9s sobre aspectes essencials de ci\u00e8ncia ciutadana, una metodologia totalment desconeguda per a ells.<\/p>\n\n\n\n

En el moment en qu\u00e8 es va obtenir el finan\u00e7ament vam comen\u00e7ar a treballar junts al projecte. Els vaig proposar, entre altres coses, comen\u00e7ar obrint la idea a la ciutadania amb tres sessions de co-creaci\u00f3<\/strong><\/a> i vam involucrar 120 persones de perfils molt diversos<\/strong>. Aix\u00f2 va ser el 2019!<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Qu\u00e8 aporten els jugadors que els falti als algorismes?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Els algorismes davant del mateix problema et donen sempre el mateix resultat; per dir-ho d’alguna manera, els algorismes juguen tots igual. Les persones, en canvi, juguen de manera diferent i poden arribar a respostes m\u00e9s creatives. \u00c9s precisament aquesta creativitat humana i intel\u00b7lig\u00e8ncia de ramat<\/strong> o social el que busquem explotar amb Genigma.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Explica’ns una mica m\u00e9s sobre la app: com es juga?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

A Genigma hi ha 4 clans que s’enfronten setmanalment<\/strong> per ser els que m\u00e9s dades aportin a la ci\u00e8ncia. L’objectiu \u00e9s solucionar diferents trencaclosques ordenant les peces (que s\u00f3n fragments d’ADN) per aconseguir la m\u00e0xima puntuaci\u00f3 i enviar aquestes dades a l’equip cient\u00edfic.<\/p>\n\n\n\n

A m\u00e9s, en el joc hi ha una s\u00e8rie d’eines virtuals que poden ajudar a aconseguir aquesta m\u00e0xima puntuaci\u00f3 i, com a recompensa, es poden anar col\u00b7leccionant cromos de ci\u00e8ncia.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n
\"\"<\/figure><\/div>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

L’objectiu del joc \u00e9s solucionar diferents trencaclosques ordenant les peces, que s\u00f3n fragments d’ADN<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

En qu\u00e8 consisteix el #GenigmaChallenge?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Genigma es va llan\u00e7ar el 27 de gener com a experiment. Aleshores vam plantejar un repte col\u00b7lectiu, el #GenigmaChallenge<\/strong>: aconseguir en 90 dies<\/strong> les dades necess\u00e0ries per desxifrar el mapa gen\u00f2mic de refer\u00e8ncia de la l\u00ednia cel\u00b7lular T47D del c\u00e0ncer de mama<\/a>. Per aix\u00f2 s\u00f3n necess\u00e0ries 30.000 jugadores i jugadors<\/strong> que facin un m\u00ednim de 50 partides<\/strong> cadascuna. <\/p>\n\n\n\n

Cada setmana, l’equip cient\u00edfic introdueix nous trencaclosques perqu\u00e8 els jugadors els vagin resolent. Si aconsegu\u00edssim resoldre el mapa gen\u00f2mic d’aquest c\u00e0ncer, ens podr\u00edem plantejar ficar altres l\u00ednies cel\u00b7lulars<\/a> d’altres tipus de c\u00e0ncer. \u00c9s a dir, si l’experiment funciona, pot ser exportable a altres tipus de dades<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Com de present \u00e9s la ci\u00e8ncia a Genigma?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Aqu\u00ed vam tenir un gran dilema i es va discutir un munt qu\u00e8 fer. Per\u00f2 al final vam decidir fer un joc que pogu\u00e9s arribar a qualsevol tipus p\u00fablic<\/strong>, els interess\u00e9s a priori <\/em>la ci\u00e8ncia, o no.<\/p>\n\n\n\n

Per aix\u00f2, i com ens van suggerir diverses persones que van participar a les co-creacions del principi, la part de ci\u00e8ncia s’ha introdu\u00eft en forma de cromos acumulables (n’hi ha m\u00e9s de 200)<\/strong> que expliquen alguns conceptes relacionats amb el genoma<\/a>, el c\u00e0ncer<\/a> i la ci\u00e8ncia oberta<\/a> i aporten tamb\u00e9 dades curioses. Igualment, proporcionem setmanalment informaci\u00f3 dels resultats parcials obtinguts dels cromosomes que s’estan analitzant, amb un pop-up i un link a una p\u00e0gina web<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Aquesta setmana tamb\u00e9 hem presentat una guia did\u00e0ctica<\/a> amb material exclusiu de ci\u00e8ncia, creat per involucrar<\/strong> al #GenigmaChallenge professors i alumnes d’institut<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Qu\u00e8 esper\u00e0veu aconseguir amb el projecte?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

M\u00e9s enll\u00e0 d’obtenir les dades que ens ajudin a crear el mapa del genoma del c\u00e0ncer de mama, un altre dels objectius era aconseguir donar a con\u00e8ixer la ci\u00e8ncia ciutadana<\/a> com a metodologia<\/strong>, tamb\u00e9 a d’altres equips cient\u00edfics. Fer saber a les persones que hi ha maneres de participar en una investigaci\u00f3 dedicant part del seu temps i el seu coneixement a projectes reals<\/strong>. I fer veure els equips cient\u00edfics que \u00e9s possible crear projectes col\u00b7laboratius, tamb\u00e9 en disciplines com la ci\u00e8ncia b\u00e0sica.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

I ho heu aconseguit!<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

\u00d2bviament ten\u00edem l’esperan\u00e7a que el joc agrad\u00e9s, per\u00f2 no preve\u00edem aquesta resposta. Est\u00e0 tenint una acollida incre\u00efble. A un mes del llan\u00e7ament m\u00e9s de 30.000 persones s’han descarregat l’app<\/strong> i estan jugant a m\u00e9s de 130 pa\u00efsos<\/strong> del m\u00f3n. Les primeres setmanes ja s’ha resolt el 100% de 2 cromosomes<\/strong> i seguim avan\u00e7ant dia a dia per assolir el repte.<\/p>\n\n\n\n

\u00c9s molt bonic veure com el joc ha aconseguit atreure l’atenci\u00f3 de moltes persones i veure que hi ha ganes de formar part d’una comunitat que col\u00b7labora per una mateixa causa.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Creus que calen m\u00e9s projectes de ci\u00e8ncia ciutadana?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Per descomptat que s\u00ed! Aquest tipus de projectes aporten un gran valor a la relaci\u00f3 entre la ci\u00e8ncia i la ciutadania<\/a>. Es pot aconseguir que des de la ci\u00e8ncia es treballi de manera m\u00e9s horitzontal escoltant les necessitats de la societat i que la ciutadania sigui part del projecte<\/a>. Si aquesta relaci\u00f3 \u00e9s honesta i ben treballada, aconsegueix crear aquesta connexi\u00f3 amb la ci\u00e8ncia real i actual i expandir-la.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u201cLa ci\u00e8ncia ciutadana trenca tots els esquemes: et permet arribar m\u00e9s enll\u00e0, no tan sols a nivell de big data<\/em>, sin\u00f3 tamb\u00e9 mental. Implica una altra manera de treballar tenint en compte que el temps i el valor que les persones aporten \u00e9s una cosa que no es pot aconseguir tancada en un laboratori\u201d<\/p>

Elisabetta Broglio<\/strong><\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Quin consell donaries a alg\u00fa que vulgui comen\u00e7ar un projecte de ci\u00e8ncia ciutadana?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Que es busqui un bon equip<\/a> multidisciplinari<\/a><\/strong> amb persones que tinguin habilitats complement\u00e0ries i visions diferents<\/strong> i que s’armi de molta paci\u00e8ncia perqu\u00e8 \u00e9s un proc\u00e9s llarg. I aix\u00f2 \u00e9s un punt cr\u00edtic. Cal aconseguir finan\u00e7ament paral\u00b7lel que ajudi a mantenir el projecte en el temps.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n
\"\"
Part del gran equip darrera la creaci\u00f3 del joc Genigma<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

Els projectes tenen una gestaci\u00f3 llarga i el primer finan\u00e7ament sempre s’acaba en algun moment. La rotaci\u00f3 natural de la ci\u00e8ncia comporta a m\u00e9s que els investigadors es moguin: de fet, el Marco i el Juan ja no s\u00f3n al CNAG i, encara que segueixen molt actius a l’equip cient\u00edfic de Genigma, hi ha noves persones que s’han incorporat i es necessiten noves f\u00f3rmules per a la sostenibilitat del projecte. Hem trigat m\u00e9s de 2 anys a crear el joc de Genigma<\/strong>, i ara que hi \u00e9s fora cal mantenir-lo!<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Qu\u00e8 t’ha sorpr\u00e8s m\u00e9s de Genigma?<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

M’ha sorpr\u00e8s molt positivament el canvi que l’equip cient\u00edfic<\/a> ha experimentat durant tot el proc\u00e9s creatiu. Era el seu primer projecte de ci\u00e8ncia ciutadana i junts hem apr\u00e8s molt\u00edssim i estem col\u00b7laborant de manera transversal dissipant les barreres entre disciplines<\/strong>. Hi ha hagut tamb\u00e9 una implicaci\u00f3 molt especial dels equips de professionals contractats, que han anat molt m\u00e9s enll\u00e0 del que s’estipula, per tractar-se d’un projecte d’aquest estil.<\/p>\n\n\n\n

Tamb\u00e9 m’ha sorpr\u00e8s veure com hem superat fronteres geogr\u00e0fiques<\/strong> gr\u00e0cies a l’important esfor\u00e7 que estem fent a la comunicaci\u00f3 del projecte<\/strong> i dels resultats preliminars. I, per descomptat, estic aclaparada per la resposta, la complicitat i l’esfor\u00e7 de tots els participants a les primeres fases i dels que s’han apuntat ara a jugar. Tant de bo a finals d’abril, puguem anunciar que tenim totes les dades necess\u00e0ries per construir el mapa gen\u00f2mic de refer\u00e8ncia del c\u00e0ncer de mama i que les hem obtingut de manera col\u00b7lectiva amb persones de tot el m\u00f3n!<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u201cTenir el mapa de refer\u00e8ncia del c\u00e0ncer de mama ens donaria m\u00e9s informaci\u00f3 per identificar noves dianes i ter\u00e0pies per ajudar els pacients en el futur\u201d<\/p>

Roni Wright<\/strong>, investigadora del c\u00e0ncer de mama utilitzant la l\u00ednia cel\u00b7lular T47D<\/p><\/blockquote>\n\n\n