{"id":24944,"date":"2021-09-13T14:11:44","date_gmt":"2021-09-13T12:11:44","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=24944"},"modified":"2021-09-15T18:32:05","modified_gmt":"2021-09-15T16:32:05","slug":"el-cnag-crg-estableix-un-nou-centre-de-visualitzacio-del-genoma-amb-tres-institucions-americanes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/el-cnag-crg-estableix-un-nou-centre-de-visualitzacio-del-genoma-amb-tres-institucions-americanes\/","title":{"rendered":"El CNAG-CRG estableix un nou centre de visualitzaci\u00f3 del genoma amb tres institucions americanes"},"content":{"rendered":"\n

Veure \u00e9s creure, diuen. I ara, el CNAG-CRG ha aconseguit formar part d\u2019un nou centre de visualitzaci\u00f3 del genoma<\/strong><\/a> que t\u00e9 com a objectiu desenvolupar tecnologies que permetin veure tot el genoma hum\u00e0, al complet i en 3D.<\/p>\n\n\n\n

El laboratori d\u2019en Marc Mart\u00ed-Renom<\/strong> al CNAG-CRG col\u00b7laborar\u00e0 amb d\u2019altres a la Facultat de Medicina de Harvard, a Brown University i al Baylor College of Medicine <\/strong>per tal d\u2019aconseguir aquest objectiu.<\/p>\n\n\n\n

Les t\u00e8cniques existents avui dia tan sols permeten observar, com a molt, un 1% del genoma d\u2019un cop d\u2019ull. \u201cEl que volem fer \u00e9s un canvi equivalent a passar de la tele en blanc i negre a una SmartTV en 4K\u201d, compara en Marc.<\/p>\n\n\n\n

Per aix\u00f2 comptaran amb 11,2 milions de d\u00f2lars <\/strong>en els propers cinc anys, gentilesa dels Instituts Nacionals de Salut (NIH)<\/strong> dels Estats Units. \u201cEl nou centre ser\u00e0 \u2018virtual\u2019, en el sentit que cadasc\u00fa treballar\u00e0 des del seu centre actual; similar al que seria un Centre d\u2019excel\u00b7l\u00e8ncia de la UE\u201d, explica el cap de grup. \u201cPer\u00f2 estem muntant un laboratori central, que anomenen \u201cINCUBATOR\u201d, que estar\u00e0 a Harvard <\/strong>i on hi hauran membres dels 4 grups de recerca que en formem part\u201d.<\/p>\n\n\n\n

Aix\u00ed, en els propers cinc anys desenvoluparan t\u00e8cniques per veure el genoma \u2018in situ\u2019, dins del nucli on est\u00e0 plegat: 2m d\u2019ADN dins un nucli d\u2019unes ~10 micres<\/strong>. \u201cSi el genoma no es plega b\u00e9, hi ha problemes de desenvolupament, c\u00e0ncer, etc. El que volem \u00e9s que aquesta visualitzaci\u00f3 pugui arribar a fer-se de forma senzilla, rutin\u00e0ria, a hospitals o centres de diagn\u00f2stic d\u2019arreu del m\u00f3n<\/strong>\u201d, diu en Mart\u00ed-Renom.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

La nova col\u00b7laboraci\u00f3 compta amb 11’2 milions de d\u00f2lars per aconseguir, en 5 anys, visualitzar sota el microscopi el genoma hum\u00e0 sencer (uns 2m d’ADN) dins el nucli d\u2019una \u00fanica c\u00e8l\u00b7lula i en 3D.<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

No ha estat gens f\u00e0cil aconseguir formar part d\u2019aquest gran projecte. \u201c\u00c9s un tipus de finan\u00e7ament dels NIH que no es sol donar a grups de fora d\u2019Estats Units\u201d,<\/strong> diu en Marc. El Centre de Regulaci\u00f3 Gen\u00f2mica (CRG)<\/a> ho havia aconseguit una vegada abans, quan el grup liderat pel Roderic Guig\u00f3 va participar en la seq\u00fcenciaci\u00f3 del genoma hum\u00e0, ja fa 20 anys.<\/a><\/p>\n\n\n\n

En aquesta ocasi\u00f3, l\u2019equip d\u2019en Mart\u00ed-Renom ho ha aconseguit gr\u00e0cies a la seva expertesa en l\u2019an\u00e0lisi computacional de les imatges <\/a>que sortiran dels microscopis, com han mostrat en recents articles<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

\u201cPortem col\u00b7laborant amb aquesta gent des del 2018. L\u2019any passat ens vam presentar a la convocat\u00f2ria i vam quedar aprop d\u2019aconseguir l\u2019ajut. Aquest any ho hem assolit principalment perqu\u00e8 ja hem demostrat que el que volem fer, es pot fer<\/strong>\u201d, explica en Marc, apuntant a un article que van publicar a finals de l\u2019any passat descrivint OligoFISSEQ<\/a>, un nou m\u00e8tode per a mapejar genomes que van desenvolupar amb el grup de Harvard.<\/p>\n\n\n\n

Aix\u00ed, ara comen\u00e7a aquest cam\u00ed de cinc anys per intentar abordar, per primera vegada, la visualitzaci\u00f3 del genoma hum\u00e0 sencer  a nivell d\u2019una \u00fanica c\u00e8l\u00b7lula i en 3D – sota el microscopi. I pel grup d\u2019en Mart\u00ed-Renom \u00e9s un orgull formar-ne part.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u00abM\u00e9s enll\u00e0 de l’aportaci\u00f3 econ\u00f2mica, aquesta ajuda representa per a nosaltres un important reconeixement internacional de prestigi\u00bb
Marc Mart\u00ed-Renom<\/strong>, cap de grup al CNAG-CRG<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u201cApart dels diners rebuts (1,8M$ pel nostre grup<\/strong>, m\u00e9s la part que ens toca dels 6M$ de Harvard a trav\u00e9s del \u201cIncubator\u201d), i no menys important per nosaltres, aquesta ajuda representa un reconeixement internacional important de prestigi<\/strong>\u201d, conclou l\u2019investigador.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

La nova col\u00b7laboraci\u00f3 del CNAG-CRG amb Harvard, Baylor College i Brown University compta amb 11’2 milions de d\u00f2lars per aconseguir visualitzar sota el microscopi el genoma hum\u00e0 sencer, en 3D, dins el nucli d\u2019una \u00fanica c\u00e8l\u00b7lula.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":24948,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[32],"tags":[448,265,289],"new-type":[35],"class_list":["post-24944","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-vida-cientifica","tag-analisi-dimatges","tag-crg-ca","tag-genoma","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/24944","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=24944"}],"version-history":[{"count":9,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/24944\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":24979,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/24944\/revisions\/24979"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/24948"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=24944"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=24944"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=24944"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=24944"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}