{"id":20332,"date":"2021-02-09T14:38:05","date_gmt":"2021-02-09T13:38:05","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=20332"},"modified":"2024-08-30T12:23:15","modified_gmt":"2024-08-30T10:23:15","slug":"eduard-sabido-crg-en-pocs-anys-tots-els-investigadors-serem-usuaris-dalgorismes-informatics-daprenentatge-automatic","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/eduard-sabido-crg-en-pocs-anys-tots-els-investigadors-serem-usuaris-dalgorismes-informatics-daprenentatge-automatic\/","title":{"rendered":"Eduard Sabid\u00f3 (CRG): \u00abEn pocs anys tots els investigadors serem usuaris d’algorismes inform\u00e0tics d’aprenentatge autom\u00e0tic\u00bb"},"content":{"rendered":"\n

L’Eduard Sabid\u00f3 Aguade<\/strong> \u00e9s el cap de l’Unitat de Prote\u00f2mica<\/a> mixta entre el Centre de Regulaci\u00f3 Gen\u00f2mica (CRG)<\/a> i el Departament de Ci\u00e8ncies Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra (DCEXS-UPF)<\/a>, i el responsable del programa formatiu del nou projecte PROTrEIN<\/a><\/strong>, comen\u00e7at al gener de 2021.<\/p>\n\n\n\n

Parlem amb ell sobre aquesta interessant iniciativa per impulsar el machine learning <\/em>a l’\u00e0mbit de la prote\u00f2mica<\/strong>, i sobre el futur de la recerca de la m\u00e0 d’aquestes noves tecnologies. <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Quina utilitat t\u00e9 el machine learning<\/em> aplicat a la prot\u00e8omica?<\/h2>\n\n\n\n

Les eines d’aprenentatge autom\u00e0tic<\/a> i de visualitzaci\u00f3 de dades<\/strong> estan cobrant una import\u00e0ncia cabdal en molts \u00e0mbits de la recerca biom\u00e8dica<\/a>. Tenen un impacte especialment important en el tractament de dades complexes<\/strong> i altament estructurades com les que genera la prote\u00f2mica<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

En els darrers anys aquestes eines han facilitat aspectes com la identificaci\u00f3 de prote\u00efnes i les seves modificacions, la seva integraci\u00f3 amb dades gen\u00f2miques, i l’estratificaci\u00f3 de pacients en grups de risc, entre d’altres.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u00abEns permetr\u00e0 avan\u00e7ar en el nostre coneixement sobre els processos patol\u00f2gics i de resposta a tractament.\u00bb<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Quin es l\u2019objectiu del projecte PROTrEIN?<\/h2>\n\n\n\n

El projecte PROTrEIN \u00e9s una xarxa europea de formaci\u00f3 d’estudiants de doctorat<\/strong>, i cadascun d’aquests estudiants realitzar\u00e0 un projecte de recerca en el camp de la prote\u00f2mica computacional<\/strong> al llarg de 4 anys, fins al 2024.<\/p>\n\n\n\n

Tenim 15 projectes de recerca per a 15 estudiants de doctorat<\/strong> repartits entre diverses universitats europees, centres de recerca i ind\u00fastria, que abasten des del desenvolupament de nous algorismes d’interpretaci\u00f3 de dades, a l’an\u00e0lisi de xarxes d’interacci\u00f3 molecular, integraci\u00f3 de dades gen\u00f2miques i el desenvolupament de processos de gamificaci\u00f3 en la visualitzaci\u00f3 de dades complexes.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Quins han estat els principals reptes a l\u2019hora de definir el programa formatiu?<\/h2>\n\n\n\n

El principal repte<\/strong> del projecte PROTrEIN per garantir una excel\u00b7lent formaci\u00f3<\/a> ha estat combinar un programa altament multidisciplinar<\/strong> que inclou formaci\u00f3 avan\u00e7ada en qu\u00edmica anal\u00edtica, biologia molecular, aprenentatge autom\u00e0tic i visualitzaci\u00f3 de dades. <\/p>\n\n\n\n

Aix\u00f2 ha estat possible gr\u00e0cies a la implicaci\u00f3 dels experts<\/strong> en aquestes disciplines d’una gran varietat d’entitats<\/strong> participants i d’entitats associades al projecte.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Les metodologies que impulsa el projecte PROTrEIN han vingut per quedar-s’hi?<\/h2>\n\n\n\n

Els continguts de formaci\u00f3 impulsats pel projecte PROTrEIN, com el desenvolupament d’eines d’aprenentatge autom\u00e0tic i de visualitzaci\u00f3 de dades<\/strong> seran (i s\u00f3n) de gran inter\u00e8s per a la recerca biom\u00e8dica. <\/p>\n\n\n\n

En pocs anys tots els investigadors serem usuaris d’aquest tipus d’algorismes inform\u00e0tics<\/strong>. No necess\u00e0riament tothom n’haur\u00e0 de ser un desenvolupador expert, per\u00f2 els professionals amb aquest perfil i coneixements tindran un gran valor afegit en l’ecosistema de recerca.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u00abEls professionals que s\u00e0piguen d’aquest tipus d’algorismes tindran un gran valor afegit en l’ecosistema de recerca.\u00bb
Eduard Sabid\u00f3 (CRG)<\/strong><\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Fins on pot arribar la recerca de la m\u00e0 d’aquestes noves tecnologies?<\/h2>\n\n\n\n

Estem als inicis de l’aplicaci\u00f3<\/strong> de les eines d’aprenentatge autom\u00e0tic en recerca. Esperem un creixement exponencial en els propers anys<\/strong>, i costa valorar fins a on arribar\u00e0 el seu impacte. <\/p>\n\n\n\n

En el cas concret de la prote\u00f2mica aquestes noves tecnologies canviaran la forma com adquirim i analitzem les dades<\/a><\/strong>, i ens permetran avan\u00e7ar en el nostre coneixement<\/strong> sobre els processos patol\u00f2gics i de resposta a tractament.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Parlem amb l’Eduard Sabid\u00f3, cap de l’Unitat de Prote\u00f2mica del CRG i la UPF, sobre PROTrEIN, el projecte de formaci\u00f3 en machine learning i prote\u00f2mica que lidera. <\/p>\n","protected":false},"author":9,"featured_media":20351,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[26],"tags":[261,265,453,859,726,273,329,620],"new-type":[38,35],"class_list":["post-20332","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-recerca","tag-bioinformatica","tag-crg-ca","tag-entrevista","tag-ia","tag-innovacio","tag-melis-upf-ca","tag-proteines","tag-proteomica","new-type-a-fons","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/20332","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/9"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=20332"}],"version-history":[{"count":19,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/20332\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":20380,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/20332\/revisions\/20380"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/20351"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=20332"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=20332"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=20332"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=20332"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}