{"id":18171,"date":"2020-10-20T11:07:41","date_gmt":"2020-10-20T09:07:41","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=18171"},"modified":"2021-06-28T14:25:46","modified_gmt":"2021-06-28T12:25:46","slug":"caracteritzades-les-diferencies-sexuals-en-el-transcriptoma-huma","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/caracteritzades-les-diferencies-sexuals-en-el-transcriptoma-huma\/","title":{"rendered":"Caracteritzades les difer\u00e8ncies sexuals en el transcriptoma hum\u00e0"},"content":{"rendered":"\n

El sexe importa, segons un estudi recent<\/a> amb participaci\u00f3 d’investigadors del laboratori Guig\u00f3<\/a> del Centre de Regulaci\u00f3 Gen\u00f2mica (CRG).<\/a><\/p>\n\n\n\n

Han demostrat que el sexe biol\u00f2gic t\u00e9 una influ\u00e8ncia petita per\u00f2 omnipresent en l’expressi\u00f3 g\u00e8nica de gaireb\u00e9 tots els tipus de teixit hum\u00e0<\/strong>. Els gens que es troben expressats a diferents nivells en homes i dones estan involucrats en molts processos biol\u00f2gics diferents<\/strong>, des del pes en n\u00e9ixer i el percentatge de greix corporal fins a la resposta a la medicaci\u00f3 o al c\u00e0ncer<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

L’estudi va formar part del Consorci Genotype-Tissue Expression (GTEx)<\/a>, un projecte internacional encara en curs finan\u00e7at pels Instituts Nacionals de Salut dels EUA (NIH) per a estudiar de manera integral l’expressi\u00f3 i regulaci\u00f3 de gens als diferents teixits.<\/p>\n\n\n\n

Parlem amb l’estudiant de doctorat del CRG i primer coautor Manuel Mu\u00f1oz Aguirre<\/strong> sobre aquests \u00faltims resultats, i el que suggereixen sobre la import\u00e0ncia de considerar el sexe com una variable biol\u00f2gica en els estudis de gen\u00e8tica i gen\u00f2mica humana.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Per qu\u00e8 vau decidir fer aquest estudi i qu\u00e8 vau esbrinar?<\/h2>\n\n\n\n

La motivaci\u00f3 per realitzar aquest estudi va ser que, encara que sabem que el sexe biol\u00f2gic (definit pels cromosomes sexuals) t\u00e9 una influ\u00e8ncia en l’expressi\u00f3 de gens humans, no ten\u00edem una visi\u00f3 general de l’abast d’aquestes difer\u00e8ncies. Aix\u00ed que ens vam disposar a analitzar la prevalen\u00e7a d’efectes diferenciats per sexe en el transcriptoma hum\u00e0 <\/strong>en una col\u00b7lecci\u00f3 de 44 teixits sans <\/strong>del Projecte de Genotype-Tissue Expression (GTEx).<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u00abSab\u00edem que el sexe biol\u00f2gic t\u00e9 una influ\u00e8ncia en l’expressi\u00f3 de gens humans, per\u00f2 no ten\u00edem una visi\u00f3 global sobre l’abast d’aquestes difer\u00e8ncies\u00bb<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Vam trobar difer\u00e8ncies sexuals respecte a l’expressi\u00f3 g\u00e8nica en molts teixits (el 37% dels gens tenien una expressi\u00f3 esbiaixada per sexe en almenys un teixit), per\u00f2 les difer\u00e8ncies en abund\u00e0ncia s\u00f3n bastant petites<\/strong> i molts d’aquests gens expressats de manera diferent en els diferents sexes s\u00f3n espec\u00edfics de teixit. No obstant aix\u00f2, aquests gens intervenen en una varietat de funcions biol\u00f2giques com el metabolisme dels f\u00e0rmacs<\/a>, les respostes hormonals i immunit\u00e0ries <\/a>i el c\u00e0ncer. Tamb\u00e9 vam trobar evid\u00e8ncia de reguladors gen\u00e8tics i marques epigen\u00e8tiques que podrien explicar parcialment les difer\u00e8ncies sexuals que observem.<\/p>\n\n\n\n

Tamb\u00e9 vol\u00edem investigar si la regulaci\u00f3 gen\u00e8tica est\u00e0 diferenciada per sexes i el vincle d’aquesta amb malalties i trets complexos. En aquest cas, hi ha moltes menys difer\u00e8ncies en la regulaci\u00f3 gen\u00e8tica de l’expressi\u00f3 g\u00e8nica<\/strong>, i aquestes poden derivar parcialment de canvis en l’abund\u00e0ncia cel\u00b7lular entre sexes.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Quina \u00e9s la novetat de l’estudi?<\/h2>\n\n\n\n

A causa de l’amplitud dels tipus de teixit inclosos en GTEx, vam poder caracteritzar especificitats de teixit de l’expressi\u00f3 g\u00e8nica diferenciada per sexe que d’una altra manera s’haurien passat per alt.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

A m\u00e9s de crear un compendi d’efectes diferenciats per sexe, tamb\u00e9 vam demostrar la import\u00e0ncia de considerar el sexe com una variable biol\u00f2gica: a trav\u00e9s d’an\u00e0lisis on es tenia en compte el sexe, vam poder identificar alguns vincles gen\u00e8tics amb trets complexos que no s’haguessin pogut identificar \u00fanicament mitjan\u00e7ant un enfocament de combinaci\u00f3 de sexes<\/strong>. Aix\u00f2 diu molt de la import\u00e0ncia de considerar les dades desglossades per sexe, per exemple, en els estudis m\u00e8dics. \u00c9s important dir, no obstant, que fins i tot observant difer\u00e8ncies a nivell del transcriptoma, la major part de la biologia a nivell fenot\u00edpic \u00e9s igual entre dones i homes.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u00abEls nostres resultats demostren la import\u00e0ncia de considerar les dades desglossades per sexe, per exemple, en els estudis m\u00e8dics\u00bb<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Quines s\u00f3n les implicacions per als estudis futurs?<\/strong><\/strong><\/h2>\n\n\n\n

El nostre treball representa una caracteritzaci\u00f3 extensa de les difer\u00e8ncies entre sexes en el transcriptoma hum\u00e0 de refer\u00e8ncia, que podria utilitzar-se a l’hora d’analitzar altres estudis d’expressi\u00f3 g\u00e8nica<\/strong>. Tot i que encara \u00e9s massa aviat per a dir-ho, possibles exemples podrien ser l’establiment de diferents models de predicci\u00f3 de malalties basades en el sexe<\/strong>, el descobriment de biomarcadores espec\u00edfics per sexe<\/strong> que poden ajudar a descriure la progressi\u00f3 de la malaltia o la resposta a f\u00e0rmacs que afecten homes i dones de manera diferencial, <\/strong>entre altres aspectes que potencialment podrien traduir-se en la pr\u00e0ctica cl\u00ednica.<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u00abEl nostre treball representa una caracteritzaci\u00f3 extensa de les difer\u00e8ncies entre sexes en el transcriptoma hum\u00e0 de refer\u00e8ncia, que podrien tenir-se en compte en altres estudis d’expressi\u00f3 gen\u00e8tica\u00bb<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Un exemple de l’impacte potencial de la recopilaci\u00f3 d’informaci\u00f3 sobre el sexe \u00e9s un treball recent<\/a> que ha donat explicacions plausibles dels mecanismes subjacents als biaixos sexuals observats en COVID-19<\/a> i que podrien establir les bases per a desenvolupar pautes basades en el sexe a nivell de tractament.<\/p>\n\n\n\n

Aqu\u00ed, analitzem dades massives d’RNA-Seq, per\u00f2 les tecnologies m\u00e9s noves, com les \u00f3miques de c\u00e8l\u00b7lules individuals, segurament permetran noves maneres d’estudiar la biologia del sexe<\/strong>, especialment respecte als efectes gen\u00e8tics. <\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

\u00abVam demostrar que hi ha descobriments que podrien perdre’s si no es t\u00e9 en compte el sexe\u00bb<\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n


Quines s\u00f3n les defici\u00e8ncies de l’estudi?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Hi ha molts factors en joc en analitzar les difer\u00e8ncies de sexe, com el medi ambient: sabem que existeixen comportaments diferenciats per sexe<\/strong>, com el tabaquisme, i altres factors que han de ser estudiats per a caracteritzar completament els efectes directes i indirectes del sexe en la salut humana<\/strong>, i en el nostre estudi no ten\u00edem les dades epidemiol\u00f2giques necess\u00e0ries per a abordar aquesta q\u00fcesti\u00f3.<\/p>\n\n\n\n

Tamb\u00e9 est\u00e0vem limitats per la composici\u00f3 inherent de la cohort GTEx<\/strong>: \u00e9s una instant\u00e0nia on la majoria dels individus s\u00f3n gent gran, dos ter\u00e7os dels quals s\u00f3n homes i gaireb\u00e9 el 85% s\u00f3n d’ascend\u00e8ncia europea<\/strong>. A m\u00e9s d’aquesta falta de diversitat, existeix una heterogene\u00eftat d’expressi\u00f3 interindividual i, per a algunes an\u00e0lisis, limitacions en la grand\u00e0ria de la mostra.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Parlem amb l’estudiant de doctorat del CRG Manuel Mu\u00f1oz Aguirre sobre els resultats d’aquest estudi, i sobre la import\u00e0ncia de considerar el sexe com una variable biol\u00f2gica en els estudis de gen\u00e8tica i gen\u00f2mica humana.<\/p>\n","protected":false},"author":9,"featured_media":18248,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[26],"tags":[265,708,706,332],"new-type":[38,35],"class_list":["post-18171","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-recerca","tag-crg-ca","tag-genetica","tag-genomica","tag-gens","new-type-a-fons","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18171","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/9"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=18171"}],"version-history":[{"count":8,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18171\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":18199,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18171\/revisions\/18199"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/18248"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=18171"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=18171"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=18171"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=18171"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}