{"id":14879,"date":"2020-06-08T15:56:23","date_gmt":"2020-06-08T13:56:23","guid":{"rendered":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/?p=14879"},"modified":"2020-06-08T15:56:24","modified_gmt":"2020-06-08T13:56:24","slug":"quan-la-genomica-ajuda-a-salvar-els-ximpanzes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/quan-la-genomica-ajuda-a-salvar-els-ximpanzes\/","title":{"rendered":"Quan la gen\u00f2mica ajuda a salvar els ximpanz\u00e9s"},"content":{"rendered":"

En aquests moments on l\u2019aparici\u00f3 del SARS-CoV-2<\/a> ha canviat les nostres vides, \u00e9s un bon moment per reflexionar sobre com aquesta pand\u00e8mia<\/a> tamb\u00e9 afecta a la resta d\u2019\u00e9ssers vius<\/strong>. Per exemple, en el cas dels ximpanz\u00e9s<\/strong> (Pan troglodytes<\/em>) ja es comen\u00e7a a parlar de com aquesta infecci\u00f3 pot ser perjudicial per a la seva superviv\u00e8ncia<\/strong>.<\/p>\n

Si b\u00e9 la COVID-19, i altres malalties infeccioses com l\u2019Ebola, s\u00f3n un factor de risc pels ximpanz\u00e9s, tamb\u00e9 la destrucci\u00f3 de l\u2019h\u00e0bitat natural, el canvi clim\u00e0tic i el tr\u00e0fic il\u00b7legal han provocat que avui en dia els ximpanz\u00e9s estiguin considerats en perill d\u2019extinci\u00f3<\/strong>. Segons l\u2019IUCN (International Union for Conservation of Nature and Natural Resources<\/em>), s\u2019estima que la seva poblaci\u00f3 s\u2019haur\u00e0 redu\u00eft a la meitat cap a l\u2019any 2050. Aix\u00ed doncs, \u00e9s imprescindible l\u2019elaboraci\u00f3 de plans d\u2019acci\u00f3 efica\u00e7os per a la conservaci\u00f3 d\u2019aquesta esp\u00e8cie<\/strong>.<\/p>\n

\u00a0<\/p>\n

\n

S\u2019estima que la poblaci\u00f3 de ximpanz\u00e9s s\u2019haur\u00e0 redu\u00eft a la meitat cap a l\u2019any 2050. La destrucci\u00f3 del seu h\u00e0bitat natural, el canvi clim\u00e0tic i el tr\u00e0fic il\u00b7legal en s\u00f3n les causes principals.<\/p>\n<\/blockquote>\n

\u00a0<\/p>\n

Aquests plans solen dividir-se en ex situ <\/em>i in situ<\/em>, depenent de si s\u2019efectuen fora o en el seu h\u00e0bitat natural.<\/p>\n

Fora de l\u2019\u00c0frica, un dels plans de conservaci\u00f3 d\u2019esp\u00e8cies en perill d\u2019extinci\u00f3 m\u00e9s importants \u00e9s el dirigit per l\u2019Associaci\u00f3 de Zoos i Aquaris Europeu (EAZA)<\/a>. El seu objectiu principal \u00e9s vetllar per la superviv\u00e8ncia a llarg termini d\u2019una poblaci\u00f3 sana de ximpanz\u00e9s, mantenint-ne separades les seves quatre subesp\u00e8cies. Tot i aix\u00f2, degut a un coneixement poc acurat de l\u2019origen, ascend\u00e8ncia gen\u00e8tica i parentesc dels ximpanz\u00e9s, per\u00f2 tamb\u00e9 a la manca d\u2019eines moleculars precises, la cria d\u2019aquesta esp\u00e8cie ha derivat cap a casos de mescla entre subesp\u00e8cies i a consanguinitat<\/strong>.<\/p>\n

\u00a0<\/p>\n

La gen\u00f2mica al rescat<\/strong><\/h2>\n

Per aquest motiu, en l\u2019estudi que hem publicat a Heredity<\/em>, hem volgut explorar fins a quin punt trobem aquests casos en 167 ximpanz\u00e9s tant de zoos europeus com de santuaris d\u2019\u00c0frica. D\u2019aquesta manera es poden identificar els individus susceptibles a formar part de programes de cria en captivitat i contribuir a mantenir una poblaci\u00f3 gen\u00e8ticament fidedigna amb la natura. En l\u2019estudi, hem determinat que dels 136 ximpanz\u00e9s que formen part del programa de conservaci\u00f3 ex situ <\/em>en zoos europeus,<\/strong> 90 tenen ascend\u00e8ncia d\u2019una sola subesp\u00e8cie mentre que la resta han sigut classificats com a h\u00edbrids, \u00e9s a dir, amb ascend\u00e8ncia de dues o m\u00e9s subesp\u00e8cies.<\/p>\n

Per\u00f2 tamb\u00e9 des d\u2019una visi\u00f3 de la conservaci\u00f3 in situ<\/em><\/strong>, hem completat l\u2019estudi amb la determinaci\u00f3 de l\u2019origen geogr\u00e0fic de 31 ximpanz\u00e9s rescatats del tr\u00e0fic il\u00b7legal de mascotes<\/strong> i que actualment es troben en santuaris a \u00c0frica. Aix\u00f2 ha sigut possible gr\u00e0cies a un estudi anterior<\/strong> del nostre grup on vam descriure un atles gen\u00e8tico-geogr\u00e0fic que permet inferir el lloc d\u2019origen a partir de les dades gen\u00e8tiques<\/strong> (de Manuel, 2016).<\/p>\n

Dels 31 ximpanz\u00e9s que hem analitzat, la majoria pertanyen a la subesp\u00e8cie P.t. schweinfurthii<\/em>, i n\u2019hem inferit l\u2019origen principalment a dues localitzacions concretes: una al nord i l\u2019altra al sud de la Rep\u00fablica Democr\u00e0tica del Congo. Al creuar aquestes dades amb el lloc de confiscaci\u00f3, hem vist que en la majoria dels casos coincidia, fet que ens indica que la ruta de tr\u00e0fic il\u00b7legal ocorre a escala local, a poca dist\u00e0ncia del lloc on s\u2019ha capturat l\u2019animal<\/strong>. Tot i aix\u00f2, tamb\u00e9 hem trobat dos casos on els ximpanz\u00e9s havien estat confiscats molt m\u00e9s lluny, un a Moscou i l\u2019altre a Nairobi, mentre que l\u2019origen geogr\u00e0fic inferit gen\u00e8ticament els situa a l\u2019oest d\u2019\u00c0frica i a Camerun, respectivament.<\/p>\n

\u00a0<\/p>\n

\n

Determinar l\u2019origen geogr\u00e0fic dels animals confiscats obra la possibilitat que aquests ximpanz\u00e9s puguin ser reintrodu\u00efts al seu h\u00e0bitat natural<\/p>\n<\/blockquote>\n

\u00a0<\/p>\n

El fet de poder determinar l\u2019origen geogr\u00e0fic dels animals confiscats obra la possibilitat que aquests ximpanz\u00e9s puguin ser reintrodu\u00efts al seu h\u00e0bitat natural, i gr\u00e0cies a les an\u00e0lisis gen\u00f2miques, poder-ho fer al lloc on toca. Per\u00f2 tamb\u00e9 ens permet con\u00e8ixer a quines zones hi ha m\u00e9s casos de tr\u00e0fic il\u00b7legal per a que les administracions pertinents puguin aplicar les sancions necess\u00e0ries.<\/p>\n

\u00a0<\/p>\n

Solucions innovadores per les limitacions<\/strong><\/h2>\n

Ara b\u00e9, molts cops l\u2019aplicaci\u00f3 de la gen\u00e8tica en la conservaci\u00f3 s\u2019ha vist limitada pel finan\u00e7ament. Per aix\u00f2, hem volgut desenvolupar i aplicar un m\u00e8tode que ens permet capturar les regions del genoma que ens informen quina \u00e9s la subesp\u00e8cie del ximpanz\u00e9 analitzat mirant ~60.000 SNPs<\/a><\/strong>, tot evitant el cost de la seq\u00fcenciaci\u00f3 de genomes complets<\/a>. Aix\u00ed doncs, hem proposat un t\u00e8cnica assequible que pot ser utilitzada en la conservaci\u00f3 d\u2019esp\u00e8cies en perill d\u2019extinci\u00f3<\/strong>.<\/p>\n

Una altra limitaci\u00f3<\/strong> que molt sovint ens trobem \u00e9s l\u2019obtenci\u00f3 de mostres<\/strong>, sobretot pel que fa a animals salvatges<\/strong>. Per tant, tamb\u00e9 hem comprovat la idone\u00eftat de les mostres no-invasives (p\u00e8l)<\/strong>, comparant els resultat amb mostres de sang dels mateixos individus.<\/p>\n

Aquest projecte ha sigut possible gr\u00e0cies a una llarga col\u00b7laboraci\u00f3 entre el grup de Tom\u00e0s Marqu\u00e8s a l’Institut de Biologia Evolutiva (IBE: CSIC-UPF)<\/a>, amb el suport del Zoo de Barcelona<\/a>, i el Zoo de Copenhaguen, amb els investigadors Peter Frandsen i Christina Hvilsom.<\/p>\n

\u00a0<\/p>\n

\n

\u00abEl nostre estudi ajudar\u00e0 a construir, amb m\u00e9s precisi\u00f3, l’atles de correspond\u00e8ncia gen\u00e8tica i geogr\u00e0fica i aix\u00ed poder geolocalitzar ximpanz\u00e9s a nivell molt m\u00e9s local\u00bb
Cl\u00e0udia Fontser\u00e8 Alemany<\/strong><\/p>\n<\/blockquote>\n

\u00a0<\/p>\n

En definitiva, el nostre estudi demostra el potencial de la gen\u00f2mica per contribuir en l\u2019elaboraci\u00f3 de plans de conservaci\u00f3<\/strong> per\u00f2 alhora ens prepara el terreny pel estudis que vindran. Els propers passos en la gen\u00e8tica de la conservaci\u00f3 consistiran en construir, amb m\u00e9s precisi\u00f3, aquests atles de correspond\u00e8ncia gen\u00e8tica i geogr\u00e0fica i aix\u00ed poder geolocalitzar ximpanz\u00e9s, no a nivell de pa\u00eds o regi\u00f3 sin\u00f3 a nivell molt m\u00e9s local, per exemple de parc nacional. Per aconseguir-ho caldran moltes m\u00e9s mostres de les quals en coneguem el seu origen geogr\u00e0fic i \u00e9s aqu\u00ed on les mostres no-invasives ens seran de gran ajuda. Espero poder-vos explicar una mica m\u00e9s sobre aquest tema en un futur ben pr\u00f2xim!<\/p>\n

\u00a0<\/p>\n\n\n

\"\"<\/figure>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Cl\u00e0udia Fontser\u00e8 Alemany est\u00e0 acabant el seu doctorat en l’IBE. Ens explica com han desenvolupat un an\u00e0lisi gen\u00f2mica assequible i no invasiu que pot ser usat en la conservaci\u00f3 d’esp\u00e8cies en perill d’extinci\u00f3.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":15266,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[30],"tags":[259,657,289,706,211],"new-type":[35],"class_list":["post-14879","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia-i-societat","tag-biodiversitat","tag-doctorat","tag-genoma","tag-genomica","tag-ibe-csic-upf","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14879","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=14879"}],"version-history":[{"count":26,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14879\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":15739,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14879\/revisions\/15739"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/15266"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=14879"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=14879"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=14879"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=14879"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}