Aquest Pan-Cancer Atlas<\/strong> \u00e9s el resultat de l’an\u00e0lisis de dades generades durant m\u00e9s d’una d\u00e8cada per The Cancer Genome Atlas (TCGA)<\/a> i l’International Cancer Genome Consortium (ICGC)<\/a>. Aquests projectes anteriors s’havien centrat principalment en l’1% del genoma hum\u00e0 que codifica les prote\u00efnes. Ara, els investigadors del \u2018Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Project<\/a><\/strong>\u2019 han examinat el 99% restant del genoma per identificar patrons comuns de mutacions que podrien causar c\u00e0ncer i, per tant, trobar noves formes de prevenir, diagnosticar i tractar<\/a> aquesta malaltia.<\/p>\n A Espanya, el Centre Nacional d’An\u00e0lisi Gen\u00f2mica (CNAG-CRG)<\/a> ha contribu\u00eft, entre altres coses, mitjan\u00e7ant la seq\u00fcenciaci\u00f3 de tumors primaris de leuc\u00e8mia limf\u00e0tica cr\u00f2nica<\/strong>.<\/a><\/p>\n Parlem amb Ivo Gut, director de l’CNAG-CRG.<\/p>\n <\/p>\n El Pan-Cancer Genome Project ha donat com a resultat un mapa gen\u00f2mic complet de 38 tipus diferents de tumors. Espanya s’ha centrat en la leuc\u00e8mia limf\u00e0tica cr\u00f2nica.<\/p><\/blockquote>\n <\/p>\n La contribuci\u00f3 espanyola a l’ICGC s’ha centrat en la leuc\u00e8mia limf\u00e0tica cr\u00f2nica. Coordinats des de l’Hospital Cl\u00ednic, molts hospitals van participar en l’obtenci\u00f3 de mostres<\/a>. I diverses universitats i centres de recerca van jugar un paper important. Al CNAG-CRG, hem seq\u00fcenciat aproximadament 100 mostres del projecte Pan-Cancer, que representen al voltant del 5% del total.<\/p>\n A part d’aix\u00f2, crec que vam fer una altra contribuci\u00f3 important, encara que menys visible. Tot el consorci es va dividir en 18 grups de treball. Jo vaig liderar<\/strong> l’\u00faltim grup creat, per\u00f2, al meu entendre, un dels m\u00e9s importants: el grup de treball de Control de Qualitat<\/strong>. El nostre objectiu era assegurar que totes les seq\u00fc\u00e8ncies, que provenien de centres de seq\u00fcenciaci\u00f3 de tot el m\u00f3n, tinguessin una qualitat suficient. Aix\u00f2 no va ser tan senzill; aviat ens vam adonar que cadasc\u00fa definia la qualitat d’una manera diferent! Aix\u00ed que vam establir 5 criteris objectius, amb llindars espec\u00edfics, i vam determinar aquests cinc criteris en tots els genomes. A la fi, aix\u00f2 va significar que vam haver de descartar el 10% dels 3000 genomes enviats, perqu\u00e8 no van arribar al llindar de qualitat<\/strong>. Evidentment, si tens dades de mala qualitat, tota la interpretaci\u00f3 que s’obt\u00e9 no \u00e9s fiable…<\/p>\n <\/p>\n El major desafiament<\/span>\u00a0\u00e9s la gran quantitat de dades generades – cada genoma que analitzem t\u00e9 100.000.000.000 bases seq\u00fcenciades! Comporta mesos copiar totes les dades dels m\u00e9s de 2.500 genomes de c\u00e0ncer<\/strong>. Nom\u00e9s l’esfor\u00e7 de portar totes les dades a un sol lloc ja \u00e9s un gran repte a escala t\u00e8cnica. Per\u00f2 a la fi, l’important \u00e9s que hem demostrat que podem fer-ho, i aquest treball inicial obre infinites possibilitats per a futurs estudis.<\/p>\n Per a cada pacient, vam obtenir teixit cancer\u00f3s i teixit sa, i comparem les seves seq\u00fc\u00e8ncies gen\u00f2miques per buscar difer\u00e8ncies<\/strong>. Per\u00f2 la bellesa d’aquest projecte \u00e9s que\u00a0pots<\/span>\u00a0comparar el que vulguis! Pots comparar desenes de genomes\u00a0del\u00a0mateix tipus de tumor. O comparar diferents tipus de tumors entre si, per veure si hi ha mutacions que siguin comuns a tots els tipus.<\/p>\n <\/p>\n Tan sols l’esfor\u00e7 de portar totes les dades a un sol lloc ja \u00e9s un gran desafiament t\u00e8cnic. Per\u00f2 aquesta gran quantitat de dades obre infinites possibilitats per a futurs estudis.<\/p><\/blockquote>\n <\/p>\n Crec que en un\u00a0futur pr\u00f2xim\u00a0veurem que la informaci\u00f3 gen\u00f2mica s’usa de forma generalitzada en les decisions cl\u00edniques. El cost de la seq\u00fcenciaci\u00f3 no \u00e9s tan gran; crec que en menys de\u00a05<\/span>\u00a0anys la majoria de les persones amb c\u00e0ncer podrien seq\u00fcenciar el seu genoma<\/strong>. Les troballes de l’estudi Pan-C\u00e0ncer, i tot el que aprendrem d’aquestes dades, seran clau per al desenvolupament de la medicina personalitzada.<\/p>\n <\/p>\n \u00abEn un\u00a0futur pr\u00f2xim, veurem que la informaci\u00f3 gen\u00f2mica s’usa comunament en les decisions cl\u00edniques.\u00bb<\/p><\/blockquote>\n <\/p>\n De fet ja hi ha nous estudis en la mateixa l\u00ednia. Actualment participo en el \u00ab1 +\u00a0Million<\/span>\u00a0Genomes<\/a>\u00ab, una iniciativa dels estats membres Europeus, on 21 pa\u00efsos d’Europa estan tractant d’establir un sistema mitjan\u00e7ant el qual puguin compartir informaci\u00f3 gen\u00f2mica i cl\u00ednica<\/a> entre ells<\/strong>. Cada pa\u00eds t\u00e9 la seva pr\u00f2pia informaci\u00f3, per\u00f2 permet que persones expertes busquin en el conjunt de dades. La idea \u00e9s tenir 1 mili\u00f3 de genomes disponibles per a 2022, i eventualment integrar aix\u00f2 en l’atenci\u00f3 m\u00e8dica. Aix\u00f2 ser\u00e0 molt \u00fatil, totes aquestes dades ajudaran a informar el diagn\u00f2stic i el tractament<\/a>, en particular en \u00e0rees com malalties rares i c\u00e0ncer.<\/p>\n <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Uns 1.300 cient\u00edfics i metges de tot el m\u00f3n han estat treballant durant una d\u00e8cada per completar el projecte de seq\u00fcenciaci\u00f3 del genoma del c\u00e0ncer m\u00e9s gran del m\u00f3n.<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":13163,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[26],"tags":[312,265,453,289,706,521],"new-type":[35],"class_list":["post-13201","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-recerca","tag-cancer-ca","tag-crg-ca","tag-entrevista","tag-genoma","tag-genomica","tag-salut","new-type-noticies"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13201","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=13201"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13201\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":13220,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13201\/revisions\/13220"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/13163"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=13201"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=13201"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=13201"},{"taxonomy":"new-type","embeddable":true,"href":"https:\/\/ellipse.prbb.org\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/new-type?post=13201"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}![\"Ivo](\"https:\/\/ellipse.prbb.org\/wp-content\/uploads\/2020\/03\/ivo-edit.jpg\")
Quina ha estat la contribuci\u00f3 de CNAG-CRG al projecte?<\/h3>\n
Quins han estat els reptes i els aspectes m\u00e9s destacats d’aquesta col\u00b7laboraci\u00f3?<\/h3>\n
On ens porta aix\u00f2?<\/h3>\n